利用matlab将图像矩阵转换为Nifti(.nii)格式的文件并保存至本地

问题描述:已知图像矩阵,想要输出该矩阵为.nii(nifty)格式的图像并保存.
解决办法:利用matlab进行编程,载入nii格式文件,然后更改头文件并写出,最后导出目标文件.
注:需要在matlab下加载Nifti程序包,下载地址及使用方法:Nifti程序包

程序:

 %读取nii文件
 
 nii=load_nii('xxx.nii'); %载入nii文件
 matrix_img = nii.img; %读取nii文件下的img矩阵
    

%将生成的ADC图导出为nii格式的图像

file1='xxx.nii';%导入一张与目标图像维度相同的nii图像
%这一步的目的是为了方便导出目标nii图像,导入一张已有的图像之后,我们只用更改像素矩阵和头文件名即可

v=spm_vol(file1);%v代表头文件

v.fname='test.nii';%更改输出文件名,否则会覆盖原文件

%v.dt=[16 0]; %将显示精度扩大到小数点后16位,当目标图像显示精度需要调整时可更改此数值

spm_write_vol(v,matrixD); %将更改过显示精度的头文件写入矩阵中

生成的.nii格式的图像就保存在了matlab当前工作路径中,保存文件名为"test.nii"

### 回答1: 首先,我们需要将nrrd文件读取到Matlab中。这可以通过调用nrrdread函数实现,该函数可以从nrrd文件中读取数据和元数据。 接下来,我们需要利用Matlab中的NIfTI工具箱将读取的nrrd数据转换nii格式。这可以通过使用make_nii函数实现,该函数可以将读取的nrrd数据转换nii格式,并创建一个NIfTI数据结构。 最后,我们需要将转换后的nii数据存储在硬盘上,以便将其用于后续的分析。这可以通过调用save_nii函数实现,该函数将nii数据保存文件。 下面是一个简单的Matlab代码示例,演示如何读取nrrd数据并将其转换nii格式: % 导入nrrd数据 [nrrd_data, metadata] = nrrdread('example.nrrd'); % 转换nii格式 nii_struct = make_nii(nrrd_data, metadata.spacing, metadata.origin); % 保存nii文件 save_nii(nii_struct, 'example.nii'); 通过运行这个代码示例,我们可以将名为"example.nrrd"的文件转换为"example.nii"文件,方便后续分析。 ### 回答2: MATLAB是一种常用的工具,为医学图像处理和分析提供了强大的支持。在读取nrrd数据的过程中,MATLAB提供了读取nrrd文件的函数nrrdread,可以将nrrd格式的数据读入MATLAB,并直接使用MATLAB对其进行分析和处理。 当读取nrrd数据后,我们可以使用MATLAB中的mat2niix函数,将nrrd文件转换nii格式。该函数使用方法如下: ```matlab mat2niix('input_file.nrrd', 'output_file.nii') ``` 其中,input_file.nrrd表示要转换的nrrd文件的路径和文件名,output_file.nii表示转换后的nii文件的路径和文件名。 需要注意的是,转换后的nii文件格式可能与原始nrrd文件不完全相同,需要在进一步的分析过程中进行确认和调整。 除了使用MATLAB自带的函数,也可以使用一些第三方的工具箱来处理nrrd和nii格式的数据,如NITRC-CE, NiftyReg, ANTS等。 总之,MATLAB提供了方便和灵活的工具来处理医学图像数据,并支持多种数据格式的读取、处理和存储,可以在医学图像分析和研究中起到很大的作用。 ### 回答3: MATLAB是一种很强大的科学计算软件,它支持读取和处理多种数据格式,包括常见的NRRD和NIFTI格式。下面我们将介绍如何使用MATLAB读取NRRD数据并将其转换NII格式。 首先,我们需要下载并安装一个开源的NRRD阅读器——nrrdread。可以在MATLAB应用商店中查找到此工具,并安装至MATLAB中。完成安装后,我们可以开始读取NRRD数据了。 读取NRRD数据的方法如下: ```matlab [data, meta] = nrrdread('yourfile.nrrd'); ``` 其中,'yourfile.nrrd'是待读取的文件名,data是数据矩阵,meta是元数据。 读取了数据后,我们需要将它转换NII格式,可以使用MATLAB自带的nifti工具箱实现。将NRRD数据转换NII格式的方法如下: ```matlab nii = make_nii(data, voxel_size, origin); save_nii(nii, 'yourfile.nii'); ``` 其中,voxel_size和origin是数据体素大小和原点信息,可以从元数据中获取得到。make_nii函数将数据和元数据转化为一个NII对象,而save_nii函数将NII对象保存NII文件。 完成上述步骤后,我们就成功地将一个NRRD格式的数据转换NII格式,并保存到本地了。这样,我们就可以使用MATLAB或其他支持NII格式的软件进一步处理和分析这些数据了。
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