Anaconda初探与R的安装

1.由于本地的内存不够，R脚本运行不了，考虑使用服务器上的R，但是安装包时总是报错，听说Anaconda管理R比较好用，就来试试。

2.首先下载文件wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda2-2019.07-Linux-x86_64.sh

下得有点慢，干脆先下载到本地再上传的服务器上

3.sha256sum /sibcb1/zengrong-lab5/fengli/biosoft/Anaconda2-2019.07-Linux-x86_64.sh

189e16e7adf9ba4b7b7d06ecdc10ce4ad4153e5e3505b9331f3d142243e18e97  /sibcb1/zengrong-lab5/fengli/biosoft/Anaconda2-2019.07-Linux-x86_64.sh

4.bash /sibcb1/zengrong-lab5/fengli/biosoft/Anaconda2-2019.07-Linux-x86_64.sh

5.按ENTER

6.输入yes

7.没有改安装目录/home2/fengli/anaconda2，直接按ENTER

8.问你是否安装，输入yes

9.source ~/.bashrc 直接进入base环境

10.conda config --set auto_activate_base False每一处都可运行conda,不默认激活base环境

不会自动进入，要 conda activate base

11.anaconda-navigator检查是否安装完成

服务器没有界面显示

12.配置conda（一直在base环境里）

conda config --add channels conda-forge

conda config --add channels defaults

conda config --add channels r

conda config --add channels bioconda

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --set show_channel_urls yes

conda install r

 

参考：https://www.jianshu.com/p/2621abd6493a

https://docs.anaconda.com/anaconda/user-guide