本文介绍了在安装R包sciClone时遇到的问题及解决方案。首先尝试使用conda安装但因网络和gcc更新问题受阻，然后选择在R环境中安装。关键点在于R3.5以上版本不再支持biocLite，需要直接使用install.packages，并且在安装前要先解决依赖包NORMT3，可以从GitHub获取并安装。按照此方法操作，可以成功安装sciClone包。
不知道有没有朋友遇到过这个问题，安装不上sciClone。开始想要直接用conda安装，但是conda提供的安装方法总是遇到各种问题，例如网络连接不好，gcc需要更新之类的。所以考虑还是直接在R里面装。参考sciClone package - RDocumentation安装方法，有一点需要注意，可以直接从
library(devtools)开始，因为从R3.5之后，不再支持biocLite，所以会报错。另外，由于缺乏NORMT3这个依赖包，所以需要先安装它。GitHub - genome/sciclone: An R package for inferring the subclonal architecture of tumors
wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/NORMT3/NORMT3_1.0.4.tar.gz再打开R【R语言】4种R包安装方式_镰刀韭菜的博客-CSDN博客_r语言如何安装包
install.packages("xxx/xxx/NORMT3_1.0.4.tar.gz",repos=NULL)这样亲测就可以啦！
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