算法设计与分析：动态规划（2） - 序列联配问题(最优对齐方案)

本文参考UCAS卜东波老师算法设计与分析课程撰写

前言

本文依然围绕动态规划问题展开，会详细描述动态规划在序列联配问题中的应用，通过这个问题引出高级动态规划，以及以算代存的方式减少动态规划占用的内存。

序列联配问题

问题描述与分析

• 给你两个字符串序列$x=x_1{x}_2...x_n$,$y=y_1{y}_2...y_n$，计算联配$(x^{\prime },y^{\prime })$,使得编辑操作数目$s(x^{\prime },y^{\prime })$最小
  首先解读一下问题，想象这样一个场景，我们拥有一个字典词库，对于用户输入的单词S（可能输错），我们需要尽快地找到词库中与它最像的单词（动态规划保证这一过程尽可能快），修正用户的输入。

  为此我们引入“对齐”的概念。拿到两个字符串T&S，我们对字符串每个对应位置的元素做以下判断：

  • $S^{\prime }[i]$=’-’：$S[i]$相比于$T[i]$ 少了一个字母，称作删除
  • $T^{\prime }[i]$= ‘-’: $S^{\prime }[i]$相比于$T[i]$多了一个字母，称作插入
  • $S[i]$与$T[i]$位置元素相同，称作匹配

  简而言之，就是给了$(S,T)$要转换到$(S^{\prime },T^{\prime })$，使得 ( S ′ , T ′ ) (S',T') <