生信初学者教程（三）：介绍

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分类专栏： 生信论文手把手保姆教程 文章标签： 机器学习 r语言 数据可视化 数据分析
于 2024-09-20 17:40:06 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/H20230717/article/details/142391414

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参考文章

Revealing EXPH5 as a potential diagnostic gene biomarker of the late stage of COPD based on machine learning analysis
在这里插入图片描述

在生物信息学的助力下，科研人员不断探索着癌症转录组学的奥秘，以期发现能够早期诊断、指导治疗和预测疾病进程的生物标志物。本教程参考已发表的文章[@yang2023revealing]的研究方法，该文章深入探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）晚期的潜在诊断基因生物标志物，为科研人员提供了宝贵的经验和启示。它的研究框架和结果见：

分析框架：

在这里插入图片描述

  1. 数据收集与下载：从GEO数据库中下载了GSE38974、GSE69818和GSE54837这三个COPD基因表达数据集。

  2. 定义I和II期为COPD早期，III和IV期为

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生信初学者教程（一）：欢迎
专注生信领域
09-20 1045
生信初学者教程（一）：欢迎
生信初学者教程（四）：软件
专注生信领域
09-20 769
教程涉及到的软件以及简要介绍
生信分析基本流程--单样本分析
fwkgeass的博客
09-29 1767
最近在学单细胞的生信分析，学的有点懵。。。。先做点记录吧，后面在看看有什么要改的。说起来，生信分析的B站上怎么全是直到这基本流程就结束的。。看文献后面应该还有很多。。不知道怎么学了。
生信初学者教程（二）：前言
专注生信领域
09-20 327
本教程是专为那些已经具备R语言和统计基础的初学者精心编写的，它以一个简单而完整的项目为框架，为学习者提供了一份深入浅出的生物信息学入门材料。教程内容广泛而全面，涵盖了生物信息学领域的众多核心知识点，旨在帮助初学者建立起扎实的理论基础和实践技能。然而，鉴于生物信息学领域的复杂性和跨学科性，本教程所涉及的知识领域较为广泛，初学者可能需要在学习的过程中展现出一定的自学能力。通过深入探索教程中提及的知识点，并主动查找相关资料，初学者可以更加全面地理解和掌握这些知识背后的原理和应用，从而不断提升自己的生物信息学技能。
生信初学者教程（十一）：数据校正
专注生信领域
09-27 669
生信初学者教程（十一）：数据校正
生信初学者教程（九）：数据预处理
专注生信领域
09-20 1137
生信初学者教程（九）：数据预处理
生信初学者教程（十八）：ssGSEA富集分析
专注生信领域
09-30 1872
生信初学者教程（十八）：ssGSEA富集分析
生信初学者教程（五）：R语言基础
专注生信领域
09-20 833
生信初学者教程（五）：R语言基础
生信初学者教程（六）：数学基础
专注生信领域
09-20 502
生信初学者教程（六）：数学基础
肝硬化患者肝功能分级临床预测模型：基于机器学习的多变量分析
huanghm88的专栏
12-11 168
摘要 本研究基于128例肝硬化患者的34项临床指标，采用机器学习方法构建肝功能分级预测模型。通过XGBoost、随机森林等多种算法比较，发现XGBoost模型表现最优，预测准确率达86.5%，AUC值0.89。研究确定了总胆红素、白蛋白等10个关键预测因子，为临床肝功能评估提供了新的辅助工具。该模型整合了多维临床数据，较传统Child-Pugh评分更具综合性，有助于优化肝硬化患者的个体化诊疗决策。未来需扩大样本量进行多中心验证，进一步完善模型性能。 关键词：肝硬化；肝功能分级；机器学习；预测模型；XGBoo
机器学习进阶＜5＞K-means智能客户分群与可视化分析系统
2303_77568009的博客
12-09 1226
这篇博客详细介绍了基于Streamlit构建的交互式K-means聚类学习平台。该项目通过模块化设计，带领用户从数据生成、算法原理演示、最佳K值选择，到实际应用场景（如客户细分、图像颜色量化）和交互式练习，完整实践无监督学习流程。平台集成了丰富的可视化组件与即时反馈功能，特别适合机器学习初学者直观理解K-means的核心概念与实现步骤。博客还提供了完整的代码解析、运行指南及资源推荐，是一份深入浅出的实战教程。
机器学习进阶＜4＞探索数据中的物以类聚——直观理解k-均值聚类算法
2303_77568009的博客
12-09 662
这篇博客以生动的生活场景（如手机相册分类、商场客户分组）为引，深入浅出地介绍了经典的K-means聚类算法。通过“选班干部”的比喻和宠物数据集的Python可视化演示，清晰阐释了其“初始化、分配、更新、判断”四步核心流程，并展示了如何用肘部法则科学选择聚类数量。
机器学习进阶＜10＞分类器集成：集成学习算法
最新发布
2303_77568009的博客
12-12 479
这篇博客是一篇关于分类器集成技术的全面实战指南，涵盖了从理论基础到代码实践的完整知识体系。文章以"三个臭皮匠顶个诸葛亮"的智慧为核心隐喻，系统阐述了如何通过组合多个弱分类器来构建强大的集成模型，从而突破单分类器的性能瓶颈。
机器学习与深度学习基础（五）：深度神经网络经典架构简介
TracyCoder的博客
12-11 501
本文学习要点：1.深度神经网络分层架构：全连接层卷积层池化层2.深度神经网络代表:CNN：CNN、AlexNet、VGG-Net、GoogLeNet（Inception）、ResNet（残差连接）编码器-解码器架构：序列到序列模型（Seq2Seq）
小白从零开始勇闯人工智能：机器学习初级篇(pandas库)
m0_52496416的博客
12-09 1127
在上一篇文章中，我们学习了Python科学计算的核心库Numpy，在本章中我们将学习机器学习中负责数据处理和分析的Pandas库。Pandas是一个用Python编写的数据分析库，可以轻松处理数百万行数据，是AI工程师最常用的工具。
第二届机器学习、计算智能与模式识别国际学术会议（MLCIPR 2025）
2503_93659005的博客
12-08 758
摘要： 2025年12月19-21日，MLCIPR2025国际会议将在南京举办，聚焦机器学习（ML）、计算智能（CI）与模式识别（PR）的融合与创新。会议涵盖技术架构解析（如监督学习、进化算法）、工程实践（基于CNN的工业缺陷检测、遗传算法优化XGBoost）及前沿趋势（小样本学习、多模态识别）。核心议题包括算法轻量化、可解释性提升及云边协同部署，旨在推动人工智能从理论到应用的转化。官网：https://ais.cn/u/IRfYJf。欢迎投稿与交流，共促技术发展与国际合作。
【机器学习】28-29 推荐系统 & 推荐系统实现
weixin_54010404的博客
12-08 841
本文介绍了推荐系统的核心算法——协同过滤。首先以电影推荐为例，讨论了基于用户评分和电影特征的线性回归模型。随后详细阐述了协同过滤算法的原理，通过交替优化用户参数和电影特征来实现推荐。文章还扩展到二元标签场景，并介绍了均值归一化处理冷启动问题的方法。最后提到TensorFlow的自动微分工具可以简化实现，并分析了算法的局限性，包括冷启动问题和未充分利用已知特征等。协同过滤算法通过挖掘用户-物品交互数据的内在关联性，为个性化推荐提供了有效解决方案。
机器学习打卡DAY18 | 回归问题全解析：模型对比、置信区间与Bootstrap实战
2301_76812716的博客
12-08 683
本文探讨了回归问题的核心内容，重点对比了回归器与分类器的本质区别，介绍了回归任务的关键评估指标（MAE、MSE、RMSE、R²），并阐述了多输出回归任务和置信区间的实现方法。通过混凝土抗压强度数据集（1030条样本，8个特征）的实战案例，展示了线性回归、决策树、随机森林和梯度提升四种模型的训练与评估过程，提供了完整的代码实现和数据可视化方案。文章强调置信区间通过Bootstrap方法估计预测范围，而非单一预测值，为工程实践提供了实用指导。
在openEuler操作系统基础上实现机器学习开发以及openEuler优势分析
初九之潜龙勿用
12-08 8882
我们都知道，openEuler 作为华为开源的企业级 Linux 操作系统，凭借对鲲鹏架构的深度定制优化、经过工业级验证的稳定内核性能以及持续扩容的开源生态支持，已成为机器学习开发领域的优选底座。其内核层面针对异构计算场景设计的智能算力调度机制，能够动态分配 CPU、GPU 及 NPU 等硬件资源，精准匹配机器学习任务中数据预处理、模型训练与推理部署的差异化资源需求，显著提升算力利用率；
R语言生信分析教程：从基础到高级
本教程旨在帮助初学者掌握R语言的基础知识以及在生物信息学中的应用，特别是宏基因组数据分析。以下是对教程内容的详细说明： 1. **R基础**： - **R安装**：首先介绍如何下载和安装R语言环境，包括主程序和RStudio...
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