PAST4.09的下载与使用介绍_简单高效

PAST（Paleontological Statistics）是一款免费的、实用的软件包，可以处理统计数据、计算各种统计指标和生成图表。该程序包含了多种分析技术，只需几次点击即可应用。 为什么分享PAST软件？

PAST软件的相关文章在2001年发表，软件也在不断更新。迄今，PAST软件在谷歌学术上的引用率为19053。通过该软件进行扩增子测序数据（尤其是基于特征表）的下游分析可以高效、准确地获得结果。

关注“环微分析”公众号，后台回复“PAST”，即可获取PAST4.09软件包和相关文献。当然啦，授人以鱼不如授人以渔！下面小编就带你去官方网站下载最新PAST~

一、软件下载

软件下载网址：Past 4 - the Past of the Future - Natural History Museum，此网页是由奥斯陆大学自然历史博物馆的Øyvind Hammer 教授负责。

1. 打开浏览器，跳转网页Past 4 - the Past of the Future - Natural History Museum，下拉至下载栏，点击“Version 4.09, 64-bit Windows (9 MB)”开始下载；

2. 下载完成之后会得到一个压缩包，解压缩之后看到一个可执行文件Past4.09.exe，软件无需安装，直接双击运行即可使用。

二、软件界面介绍 在分析扩增子测序数据时，小编主要使用PAST基于OTU/ASV特征表计算群落Alpha多样性指数，绘制稀释曲线，进行聚类分析、排序分析以及差异性检验等。

软件界面十分简洁，从左到六依次有13个选项，我们将挑选部分板块进行简单介绍。

1. File菜单主要进行数据的导入，文件的保存；

2. Edit菜单包含撤销、重做、剪切、复制、插入行/列、移除、查找等功能；

​3. Transform菜单可以进行数据格式的转换或标准化。例如：Log为以10为底进行对数转换，Row percentage可以将数据转换为其在所在行的占比，通过Box-Cox转化可以使数据集更接近正态分布；

4. Plot菜单可以进行绘图。在写文章画图时，一般我们会使用专门的绘图工具；

5. Univariate菜单（单变量统计分析）。针对该板块，还有其他一些更专业的统计分析软件，所以这个板块我们一般也不使用；

6. Multivariate菜单（多元数据统计学分析）在扩增子测序数据后续分析中较为常用。Multivariate菜单可以进行排序、聚类、检验等分析，使用最多。基于OTU/ASV特征表进行主成分分析（PCA）、主坐标分析（PCoA）、非度量多维尺度分析（NMDS）等排序分析（Ordination），样本聚类分析（Clustering）和ANOSIM、Adonis test组间差异检验；

7. Model菜单（模型预测）包含一/多元线性回归、非线性回归等内容；

8. Diversity菜单（多样性）在扩增子测序数据后续分析中较为常用。Diversity菜单可以提供多种多样性分析方法与计算公式，包括Diversity indices（计算Alpha多样性指数），Diversity permutation test（比较两个样品的多样性是否存在显著差异）和Diversity t test（比对两个样品的Shannon and Simpson指数是否存在显著差异）等；

9.Help为软件帮助，在About Past可以查看软件信息和相关文章。

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转载自原创文章：

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最后，再次感谢你阅读本篇文章，真心希望对你有所帮助。感谢！