目的:采用Discovery Studio,以一组小分子化合物为实例,示范毒理学性质预测及结果分析操作过程。
所需功能和模块:Discovery Studio Visualizer client和DS TOPKAT。
所需数据文件:1fvv_ligand.dsv。
所需时间:10分钟
介绍
毒理学性质预测流程TOPKAT基于分子的2D结构对化合物的毒性及环境效应进行快速且准确地计算预测并加以验证。该流程采用了一系列强大且经交叉验证过的定量结构毒性关系(QSTR)模型来评估各种毒性预测结果。
基于该流程,我们可以完成以下工作:
- 快速评估有机化合物一系列毒理学性质
- 检查子结构以及结构改造的结构毒性关系以及相关的作用机制
- 分子排名以用于实验测试或者进一步的开发
- 设计新的化合物
因此采用TOPKAT流程进行毒性预测在节省药物上市时间,减少动物实验,评估人体健康风险以及药物研发流程的战略性部署等方面都起了非常重要的作用。
本教程主要介绍了在Discovery Studio中如何进行小分子化合物毒理学性质的预测,以及预测结果的分析。
本教程包括:
- 运行TOPKAT流程
- 分析预测结果
Discovery Studio中计算的毒理学性质包括:
- 潜在发育毒性(Developmental Toxicity Potential ,DTP