Ubuntu14.04下安装Doris/StaMPS

#一、准备工作

##1、需要文件

    1）系统文件：ubuntu-14.04.1-desktop-amd64.iso
    2）软件包： 
              doris_v4.06beta2.tar.gz
              fftw-3.3.3.tar.gz
              getorb_2.3.2.tar.gz
              ROI_PAC_3_0.tar.gz
              snaphu-v1.4.2.tar.gz
              triangle.zip

             StaMPS_v3.3b1.tar.gz
             Vi_StaMPS
            
             Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO
  
  ![StaMPS目录下文件安排](https://img-blog.csdn.net/20160821170001586) 
  ![doris_v406beta2目录安排](https://img-blog.csdn.net/20160821170232103)
  ![StaMPS_v3.3b1目录安排](https://img-blog.csdn.net/20160821170428385)

##2、联网操作

     普通用户获得root权限：sudo passwd root
     注意：联网设置前需要设置root密码
    联网安装设置：
   （操作：编辑链接——>选中以太网Wired connection 1编辑设置IPV4再在终端输入a,b,c对应的指令即可。）
    (1)编辑网络连接：手动设置IP、NETMASK、网关和DNS（IPV4如：192.168.200.124；255.255.255.0；        192.168.200.1；202.106.0.20）
   (2)终端：a. sudo /sbin/ifconfig eth0 down   //断开
           b. sudo /sbin/ifconfig em1 hw ether MAC地址（如：0007E9F1B25C）
           c. sudo /sbin/ifconfig em1 up //连接
     每次重启完电脑后都要重新输入a,b,c对应的命令，才能连上 

##3、安装插件

     1）、安装新立得：
        $sudo apt-get install synaptic
     2）、安装gawk gcc g++ make tcsh csh gmt
        $sudo apt-get install gawk gcc g++ make tcsh csh gmt
     3）、 安装terrasar-x影像包:
        $ sudo apt-get install gdal-bin libxslt1.1 python-lxml python libxml2
     4）、安装Cosmo-SkyMed影像包：
        $sudo apt-get install python-h5py
     5）、
    注：新立得下载的安装包文件存放在：/var/cache/apt/archives/ 目录下

#二、安装过程

##1、安装ubuntu14.04系统
1）刻录系统到U盘，安装windows、ubuntu双系统
2）安装VMware-workstation虚拟机，虚拟机上安装ubuntu14.04

##2、安装doris4.06beta2

将解压的 fftw-3.3.3 、 getorb、snaphu-v1.4.2放到doris4.06beta2目录下，等待安装。

###1）编译、安装fftw-3.3.3库

   $ cd fftw-3.3.3/
   $ ./configure --prefix=`pwd` --enable-float
   
   注： 如果出现"./configure  Permission Denied", 输入命令sudo chmod +x configure给configure赋权限。再执行./configure --prefix=`pwd` --enable-float然后回车
 若按装过程出错的话，需要将安装包删除，全部重新安装
 注意，--prefix=`pwd`中的斜撇是键盘上数字1边上的斜撇。
 【这一步configure选项可以进一步优化。我们现在的机器都支持sse，cpu都是多核心的，可以加  上--enable-sse 和 --with-combined-threads选项，也就是下面的命令：$./configure --prefix=`pwd` --enable-float --enable-sse --with-combined-threads
 //特别的，如果是32位linux系统，用的是amd的cpu，可以加上 --enable-k7】

 $ make
 $ make install
 
编译安装，注意--prefix=`pwd`选项保证了fftw库直接安装在pwd，也就是当前的 fftw-3.3.3目录，doris编译时会直接找到自己目录下的fftw。

###2)编译安装doris
$ cd src
//进入到doris下面的src目录
$ ./configure
$ make
$ sudo make install
//最后一步安装doris到/usr/local/bin需要root权限

###3)安装SARtools和ENVISAT_TOOLS
A．安装SARtools
$cd doris_v4.04beta4/SARtools
$make
$sudo make install

      若是64位Ubuntu，ENVISAT_TOOLS 需要先安装 libc-dev-i386
     $sudo apt-get install  libc6-dev-i386
     $make
     $sudo make install
 B．安装ENVISAT_TOOLS
      $ cd doris_v4.02/ENVISAT_TOOLS 
      $ make
      $sudo make install

###4)安装getorb，snaphu，GMT
Getorb（getorb_2.3.2.tar.gz）用于获取精轨，snaphu（snaphu-v1.4.2.tar.gz）用于相位解缠

#####安装getorb软件

     snaphu与getorb软件都放到doris目录下
  A．先安装fortran包
       $ sudo apt-get install gfortran
       注意：修改getorb安装文件目录下Makefile文件，第34行和38行，去掉行首的注释符号“#” 
       FC    =fc
       FC    =gfortran

 B．再安装getorb
    进入getorb目录
    $ make
    $sudo make install
   可使用getorb检查安装是否成功
 注意：拷入精轨文件的时候必须注意大小写，即轨道文件必须大写的，doris才能正确读入精轨

#####安装snaphu软件

首先到“/usr/local”文件夹下建个 man文件夹，在man文件夹下建立man1文件夹，再进入  snaphu/src下make、make install，最后make install如果提示还有一个错误，不用管

$ sudo mkdir /usr/local/man/man1  //若是fedora要分步创建
 进入snaphu/src目录，make 和 sudo make install。

#####赋执行权限
以上软件的执行文件都安装在 /usr/local/bin下面，到该目录里面去检查一下，发现有几个文件没有执行权限，增加执行权限即可。
$ cd /usr/local/bin
$ sudo chmod 755 .
$ sudo chmod 755 *
在终端运行run -g时提示添加PAGER,EDITOR到环境变量。编辑/home/Administrator(用户名，例如root)目录下.bashrc文件(为隐藏文件,Ubuntu下Ctrl+H显示)，在最后加入下面两行代码：
export PAGER=less
export EDITOR=vi

##3 安装matlab2010a

###1) 挂载光盘镜像

     $ sudo mount -o loop /home/aaa.iso /media
  其中/home/aaa.iso为你的matlab安装文件所在位置（.ios文件的路径不能有空格，可以将iso放在主文件夹下），/media为你要把光盘镜像文件挂载到的位置(一般默认该位置)

###2)安装matlab
$ cd /media（挂载的位置）
$ sudo ./install
注意：选择是否在线安装时，选否，即 install manually without using the internet
建立文件夹 sudo mkdir /usr/local/matlab，给权限sudo chmod777 路径
输入key,输入 36096-53477-64319-46930-25628-45918-00806
安装完成破解需要 license file ，选择镜像文件crack中的 license_standalone.dat

在终端运行Matlab时，提示没有注册，则需要以管理员的身份注册。
注册Matlab：sudo nautilus以管理员的身份打开文件管理器，找到Matab安装目录，文件系统下：/usr/local/MATLAB/R2012b/bin找到matlab，运行，提示注册，按上面的方法注册即可。（若运行matlab时，只能以文件的形式打开，不能执行matlab，则为matlab添加快捷方式，sudo nautilus打开文件管理器，找到桌面上的快捷方式，双击，再注册即可）

Matlab 中文乱码 解决方法：

    1、Matlab2010的JRE目录为：/Matlab安装目录/sys/java/jre/glnx86/jre* 请根据自己的安装目录和版本确定JRE的目录；
    2、$ cd /Matlab安装目录/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/fonts/；
    3、建立目录: $sudo mkdir fallback (文件夹必须命名为fallback，原因未知)；也可手动建立：sudo nautilus以管理员身份打开文件管理器，在fonts文件夹下建立fallback文件夹。
    4、把字体复制fallback目录，选择其中之一就可以：
  （1） Windows 的simsun字体
  $ cp /media/Windows/WINDOWS/Fonts/simsun.ttc fallback/ 
 (2) 也可手动将simsun复制到fallback目录下。需要以管理员的权限打开文件管理器，将simsun复制进去，执行命令为：sudo nautilus（以管理员身份打开文件管理器）
   5、进入到 fallback目录，执行sudo mkfontscale 命令；
   $ cd fallback
   $ sudo mkfontscale
  （若不成功，需要以root的身份执行mkfontscale）执行成功会在fallback文件夹下生成font.scale文件。
   6、回到上一级菜单：
   $ cd ..
   7、将上一步生成的文件添加到 lib/fonts/fonts.dir文件中，可用以下命令完成，当然也可以用编辑器复制粘贴：
   $ sudo cat fallback/fonts.scale >> fonts.dir 
   若提示权限不够，则执行sudo chmod a+w fonts.dir,让fonts.dir有可写的权限；再执行sudo cat fallback/fonts.scale >> fonts.dir，将font.scale的内容写到font.dir;
  8、若此时打开matlab仍不能识别中文，则执行sudo chmod a+r fallback/*
  9、至此Matlab的Java环境中文支持安装完了，接下来配置Matlab;
  10、进入Matlab，应该直接能显示出来；没有的话选择 菜单 File>>Preferences>>Fonts 选择SimSun/wqy字体就行了
(注意这时是选择第二项desktop text font，意识是修改文件夹选项的字体，勾掉对号，选择最下面三个方块选项字体中任意一个，这3个就是我们刚添加的)；选择字体的选择框依然为方块  但是系统中可以显示中文.

##4 安装stamps 、triangle
$ cd StaMPS_v3.2.1/src
$ make
$ sudo make install

$ cd triangle
$ make
$ sudo make install
 若装不上就下载安装
$ sudo apt-get install triangle-bin

###5 环境变量的设置

将下面的内容拷贝到主文件夹下的bashrc下（该文件为隐藏，ctrl+H，取消隐藏），记得改为自己的路径，fftw改为对应的版本号

export PAGER=less
export EDITOR=vi

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/opengl:$L{D}_{L}IBRAR{Y}_{P}ATHexportL{D}_{L}IBRAR{Y}_{P}ATH=/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH

FFTW

export FFTW_LIB_DIR=/home/lu/StaMPS/doris_v406beta2/fftw-3.3.3/lib
export FFTW_INC_DIR=/home/lu/StaMPS/doris_v406beta2/fftw-3.3.3/include

export FFTW_LIB=“/usr/local/lib”

export INT_BIN=/usr/local/bin
export INT_SCR=/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0/ROI_PAC/INT_SCR

Matlab

export MATLAB_path=“/usr/local/MATLAB/R2012b”
export PATH=$PATH:$MATLAB_path/bin

export NETCDF_HOME=/usr/local/
export PATH=/usr/local/bin:$PATH

StaMPS

export STAMPS=“/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1”
export SAR=“/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0”

#export GETORB_BIN=“/home/lu/StamPS/doris_v4.06beta2/getorb/bin”
export GETORB_BIN=“/usr/local/bin”
export SAR_ODR_DIR=“/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0/ROI_PAC/SAR_FILES/ODR”
export VOR_DIR=“/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0/ROI_PAC/SAR_FILES/VOR”
export PRC_DIR=“/home/lu/StamPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0/ROI_PAC/SAR_FILES/PRC”
export INS_DIR=“/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0/ROI_PAC/SAR_FILES/INS”

export ROI_PAC=“$SAR/ROI_PAC”
export DORIS_BIN=“/home/lu/StaMPS/doris_v406beta2/bin”

export MY_BIN=“$IN{T}_{B}IN"exportMATLABPATH=$STAMPS/matlab:echo $MATLABPATH
export DORIS_SCR=”$STAMPS/DORIS_SCR"

export LC_NUMERIC=“en_US.UTF-8”
export LC_TIME=“en_US.UTF-8”

export MY_SAR=“$SAR"exportOU{R}_{S}CR="$MY_SAR/OUR_SCR”
export ROI_PAC=“$SAR/RO{I}_{P}AC"exportM{Y}_{S}CR="$STAMPS/ROI_PAC_SCR”

export MATLAB=“/usr/local/MATLAB/R2012b”
export GMT_INC_DIR=“/usr/include”
export GMT_LIB_DIR=“/usr/lib”
export GMT_BIN=“/usr/lib/gmt/bin”
export PATH=$PATH:$GMT_INC_DIR:$GM{T}_{L}I{B}_{D}IR:$GMT_BIN:$IN{T}_{B}IN:$INT_SCR:$MDX:$SAR_ODR_DIR:$IN{S}_{D}IR:$GETORB_BIN:$STAMPS/bin:$DORIS_BIN:$TRIANGL{E}_{B}IN:$MY_SCR:$OU{R}_{S}CR:$DORIS_SCR:$GETOR{B}_{B}IN:$GDAL