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RSS订阅转载 R装包方法
install.packages详解 (2014-02-16 23:07:58)转载▼标签： it 分类： RR中用.libPaths()函数查看lib路径，如果有多个lib,install.packages()默认是安装在第一个目录下。（1）install.packages(“tm”, dependencies=TRUE)用默认参数从CRAN上安装了tm程序包。dependencies设置为TRUE，在安装过程中通知install.packages函数下载并安装初始安装过程所依赖的程序包。（2）
2022-02-15 14:41:15
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原创 用python处理word文档----docxtpl模块
可能需要预先更新pip：C:\Users\Python\Python39\python.e.exe -m pip install --upgrade pip下载：pip install docxtpl或pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple docxtpl教程https://www.jianshu.com/p/2f2dac5e4317
2022-01-13 14:56:47
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原创 pip python模块 timeout解决办法
直接用命令：pip install 库名，因网络太慢，下载超时安装Python库出现的超时问题—如下两种解决方案：其一：pip --default-timeout=100 install -U 库名例如：pip --default-timeout=100 install -U numpy其二：包源镜像：pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 库名例如：pip install -i https://pypi.tuna.t
2022-01-13 14:50:59
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原创 python日期推算
x = datetime.date(2020,1,1)y = x + datetime.timedelta(days=54)ydatetime.date(2020, 2, 24)
2021-11-25 13:57:03
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原创 pandas数据清洗
pandas 空值处理，与原有空值区别化清洗：问题：导入数据原有空值有多种，且写法不统一，需要：新填充的空值如何避免与原有空值混淆，以便后续进行替换或逻辑运算？解决方法：采用DateFrame.fillna(value=0)而不用DateFrame.fillna(value=NaN)...
2021-11-15 10:28:26
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原创 linux两个文件取交集、并集、差集
如何得到两个文件的交集、并集和差集？交集：两个文件中都出现的行并集：两个文件中的所有行加起来，去掉重复差集：在一个文件中存在，而在另一个文件中不存在。比如以下两个文件：a.txtaaabbbccc111222b.txtcccdddeee111333结果：a.txt和b.txt的交集：ccc111a.txt和b.txt的并集：111222333aaabbbcccdddeeea.txt中存在b.txt中不存在：222aaabbbb.txt中存在
2021-10-29 09:12:44
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原创 2021-09-23
window安装pandas模块1.安装python环境。2.启用cmd，去到python环境目录下scripts文件夹，执行pip install pandas。
2021-09-23 11:04:51
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原创 CSDN上没有的安装教程收藏
比较全的安装教程。https://ngs-data-for-pathogen-analysis.readthedocs.io/zh_CN/latest/appendix/edirect.html
2020-05-07 14:06:34
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原创 Mac Terminal Error Log--brew, yum, wget
像我这样的运气也是没谁了。如果哪位大佬知道解决办法，请不吝赐教，谢谢????$wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/entrezdirect/edirect.tar.gz-bash: wget: command not found$yum -y install wget-bash: yum: command not found$which ruby...
2020-05-07 11:10:30
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转载 EDirect在linux和mac下的安装
转载自：https://cloud.tencent.com/developer/article/1450128Edirect是非常有用的工具其使用要用来perl，mac都预先安装了perl安装的时候最好按下面进行打开终端cd ~/bin/bashperl -MNet::FTP -e \ '$ftp = new Net::FTP("ftp.ncbi.nlm.nih.gov", ...
2020-05-04 21:08:59
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原创 python报错-记录我遇到过的
1.把list写进文件时：TypeError: expected a character buffer object修改write(xlist)成write(srt(xlist))。EOL while scanning string literal未。tuple index out of range未。4.mac升级系统到catin?a什么的之后，mvdir都不行...
2020-04-16 10:22:22
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转载 Mac解决终端报错“Read-only file system”
出现Read-only file system的地方mac升级之前只要获得权限后就可以在几乎任何目录下新建和删除文件。但是当mac升级到最新的版本catalina后，当在根目录或者其他系统目录下进行文件修改就会提示：Read-only file system解决办法：关闭 sip，终端输入sudo mount -uw /附上关闭sip的办法查看SIP状态在终端中输入csrutil...
2020-04-14 17:59:06
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转载 如何调用NCBI数据
一、NCBI各类数据储存库1、Sequence Read Archive (SRA)：raw sequence data and alignment information fromhigh throughput sequencing platforms including 454, illumina, SOLiD and PacBio.此外， European Nucleotide Arc...
2020-04-07 10:44:31
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原创 Mac terminal更新python
1.下载python3 for MacOS。2.终端查路径，which python3。3.输入代码：PATH=“路径”4.import PATH5. source ～/.bash_profile6. 就好啦！如图：
2020-03-22 21:45:20
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原创 python使用模块-导入module之Bio 、BeautifulSoup
Bio模块：Mac系统和Windows系统都是pip install biopythonMac的2.7使用bio模块时，会提示2.7走到生命尽头了BeautifulSoup模块：Windows的系统导入方法：1.下载BS4模块：http://www.crummy.com/software/BeautifulSoup/bs4/download/4.3/beautifulsoup4-4...
2020-03-09 16:54:17
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原创 Windows怎么装python环境&Mac怎么装python环境
自己平常用MacOS，但是在公司时，出于对接需要又必须用Windows。为避免混淆，Mark一下这两个不同的OS 装python环境的一些注意事项：pythonIDE：官网下载，2.7和3.7语法上比如括号、引号稍有差别。要学3.7可以看廖雪峰的博客，3.7比2.7多出的功能我暂时用不到Mac 自带的2.7暂时够用了，参考书也使用的2.7，暂时没遇到bug，但 2.7已经停止维护了哭唧唧。。。...
2020-02-17 18:19:34
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原创 粘贴PDF文本批量去掉换行符
有时候当我们想要亲自翻译并记录某个英文文献时，会先把pdf中的原文粘到word或者记事本里。由于pdf排版的原因，粘来的文献段落里有大量的换行符。如何批量去掉这些换行符，包括但不限于以下方法：法一：word查找替换功能case1：若换行符是硬回车，即向下再左拐弯的箭头，操作“全选-查找-高级搜索-特殊格式-段落标记 ^p 替换-高级搜索-特殊格式-分栏符^n"。查找和替换那两栏选项操作...
2020-02-12 10:35:54
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原创 How to install Qiime for MacUsers--小白新手也能看懂的qiime安装教程
qiime:http://qiime.org/install/install.htmlminiconda:https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.htmlMac OS or later version operation system.1.Download and install miniconda.2.Create your qii...
2019-08-27 16:57:33
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转载 python中的format函数
format()是python2.6新增的一个格式化字符串的方法，功能非常强大，有可能在未来完全替代%格式化方法,相比 % ，format()的优点有：1 .格式化时不用关心数据类型的问题，format()会自动转换，而在%方法中，%s用来格式化字符串类型，%d用来格式化整型;2. 单个参数可以多次输出，参数顺序可以不同3. 填充方式灵活，对齐方式强大通过位置来填充字符串‘{0...
2019-06-17 11:01:47
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原创 Update Perl in Mac
0.Open the Terminal.app (found in Applications -> Utilities) and copy & paste the command below into it (then press the ‘return’ key):curl -L http://xrl.us/installperlosx | bash1.Once this is...
2019-04-05 13:42:39
1097
空空如也
不想用工作电脑写代码，怎么把工作电脑的windows主机当成服务器存储数据？
2020-05-07
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