生信软件安装教程: HiC-Pro安装教程

wget HiC-Pro-master.tar.gz ## from github:
tar -zxvf HiC-Pro-master.tar.gz
cd HiC-Pro-master

Edit config-install.txt file if necessary

make configure
make install

conda env create -f MY_INSTALL_PATH/HiC-Pro/environment.yml -p WHERE_TO_INSTALL_MY_ENV
conda activate WHERE_TO_INSTALL_MY_ENV

which bowtie2
vim ~/software/HiC-Pro-3.1.0/config-install.txt
cat ~/software/HiC-Pro-3.1.0/config-install.txt
/home/xiecn/miniconda3/envs/hic/bin/bowtie2
/home/xiecn/miniconda3/envs/hic/bin/samtools
/home/xiecn/miniconda3/envs/hic/bin/python
/home/xiecn/miniconda3/envs/hic/bin/R
vim ~/software/HiC-Pro-3.1.0/config-install.txt
mkdir /home/xiecn/miniconda3/envs/hic/bin/HiC-Pro/
cd ~/software/HiC-Pro-3.1.0/
which gcc
which g++
sudo yum install -y gcc-c++
which g++
make confi

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