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RSS订阅原创 CrYOLO的安装踩坑记录
接上一次的内容，我将在自己的笔记本（Ubuntu22.04 CUDA10）安装CrYOLO软件。虽然官网教程写得很详细，但是无奈于Anaconda已经找不到各种包，还是要自己踩坑才知道到底怎么回事。安装前提条件：Anaconda、Nivida-driver，可以看上一篇内容。
2023-09-25 10:24:10
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原创 Dell G3 3579 安装Ubuntu 踩坑过程以及Anaconda&CUDA环境配置
在参考了众多双系统以及移动Linux系统的教程后，鉴于自身手残以及不想把原有系统损毁，我使用了最保守的方法，重新买一条m2固态安装Ubuntu。自己5年前买的G3 3579笔记本逐渐吃灰（不得不说mini主机真的很适合办公室环境~），最近遇到需要本地运行Linux的程序，而之前使用wsl2常常遇到各种乱七八糟的问题，思来想去还是给笔记本安装一个Ubuntu系统。经过许久许久的DEBUG后，我终于发现原来不是网络的问题，而是conda没有此安装包(napari)，浪费半天时间/(ㄒoㄒ)/~~
2023-09-24 23:52:21
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原创 NCBI基因组下载工具（最终版？）
搁置了很久的项目，趁着最近有空终于把它给做完了，完结撒花🌸项目链接如下，在Linux系统下运行最佳（Mac可能在使用Rsync会有问题）该脚本便于从 NCBI Genank/Refseq 上批量下载基因组数据，可以根据需求选择下载格式，采用Rsync工具并行下载。
2023-07-27 23:32:23
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原创 从NCBI refseq 中下载特定物种的蛋白质数据
由于NCBI奇奇怪怪的格式，导致我们下载特定物种（某个科、某个属）比较麻烦，手动一条条下载肯定是不现实的，而对于部分很少涉及干实验的生物研究人员来讲写代码也不容易。
2022-09-24 19:26:49
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原创 从NCBI 上下载 gbff 文件并得到 CDS 信息
最近入门学习生信，面临的一个问题就是如何下载和预处理海量的基因组数据，尤其是 NCBI 上的 gbff 基因组注释文件，网络上翻了很久也找到对新手比较友好的代码，索性自己写了一段~要处理的有两个问题，在此分别讨论：一. 如何下载指定的文件（压缩包）且压缩包不损坏？二. 是如何从注释文件中摘取自己想要的 CDS 注释信息。......
2022-07-14 09:27:38
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原创 Windows WSL 挂载移动硬盘
WSL 不会自动挂载移动硬盘、U盘等外设，需要手动挂载之后才能访问:挂载`sudo mount -t drvfs X: /mnt/x/`卸载，实现正常弹出移动硬盘/U盘sudo umount /mnt/x/设置软连接：移动硬盘保存的都是数据，直接在根目录设置一个软连接，便于访问:ln -s /mnt/x/filename ....
2022-05-26 17:57:45
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原创 WSL Ubuntu 22.04 LTS gzip报错：/usr/bin/gunzip: 57: exec: gzip: Exec format error
最近在WSL中尝试了 Ubuntu 22.04 LTS，在解压文件中发现一个奇怪的BUG:/usr/bin/gunzip: 57: exec: gzip: Exec format error第一反应是重新安装 gzip，发现问题还在。试着删除 gzip，得到了下面的禁止删除提示：The following packages will be REMOVED: gzipWARNING: The following essential packages will be removed.Th
2022-05-26 17:46:21
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空空如也
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