CrYOLO的安装踩坑记录

接上一次的内容，我将在自己的笔记本（Ubuntu22.04 CUDA10）安装CrYOLO软件。虽然官网教程写得很详细，但是无奈于Anaconda已经找不到各种包，还是要自己踩坑才知道到底怎么回事。

主要参考内容：Installation and Download — crYOLO documentation

安装前提条件：Anaconda、Nivida-driver，可以看上一篇内容Dell G3 3579 安装Ubuntu 踩坑过程以及Anaconda&CUDA环境配置_李鍶鐸的博客-CSDN博客

# 新建cryolo环境，采用CUDA10

conda env remove --name cryolo

conda create -n cryolo -c conda-forge -c anaconda pyqt=5 python=3.7 cudatoolkit=10.0.130 cudnn=7.6.5 numpy=1.18.5 libtiff wxPython=4.1.1  adwaita-icon-theme


conda activate cryolo

pip install 'cryolo[gpu]'


# 安装napari以及boxmanager插件

conda create -y -n napari-cryolo -c conda-forge python=3.10  pyqt pip

conda activate napari-cryolo

##注意！！！ napari 在Anaconda中已经搜索不到，需要改为pip安装
pip install napari napari-boxmanager

##安装qt动态链接库
sudo apt-get install libxcb-xinerama0


# 链接 napari
conda activate cryolo
cryolo_dir=$(realpath $(dirname $(which cryolo_predict.py)))
napari_link_file=${cryolo_dir}/napari_boxmanager
conda activate napari-cryolo
echo -e "#\!/usr/bin/bash\nexport NAPARI_EXE=$(which napari)\nnapari_exe='$(which napari_boxmanager)'\n\${napari_exe} \"\${@}\""> ${napari_link_file}
chmod +x ${napari_link_file}
conda activate cryolo

进入到cryolo环境，打开napari_boxmanager：
 

napari_boxmanager

搞定 可以开干了！！！！！！！