CentOS安装系统后常用软件/库文件安装

跑程序用的机器通常是没有办法连到外网的。所以一般都是在装机的时候把常用的软件/库文件安装好，防止以后安装应用软件时缺少文件太麻烦。故记录下来。不同软件可能需要相同的软件/库文件，懒得分开了就一并记下来了。
安装完系统后，修改yum源

yum -y install epel-release

搜索了一些常用的包：

yum -y install gcc gcc-c++ kernel-devel
yum -y install pcre pcre-devel
yum install -y zlib zlib-devel
yum install -y openssl openssl-devel

做药物研发、分子动力学常用的软件：
Amber：

yum -y install gcc gcc-gfortran gcc-c++ flex tcsh zlib-devel bzip2-devel libXt-devel libXext-devel \
               libXdmcp-devel tkinter openmpi openmpi-devel perl perl-ExtUtils-MakeMaker \
               patch bison boost-devel

PyMol
如果不更新yum为epel源，python-pmw这个包是找不到的。

yum -y install gcc gcc-c++ kernel-devel python-devel tkinter python-pmw glew-devel freeglut-devel \
               libpng-devel freetype-devel libxml2-devel glm-devel

OpenBabel
OpenBabel只要装一个cmake就好了。

yum -y install cmake

目前想到了就这些了，以后有需要了继续补充…