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RSS订阅原创 synergy_bliss，synergy_hsa，synergy_loewe，synergy_zip的用法
Synergy 是指多种药物联合使用时所产生的协同作用效果。常见的 Synergy 计算方法包括 Bliss、HSA、Loewe 和 ZIP。Bliss 模型基于独立作用原理，假设两个药物在无交互的情况下独立起作用HSA 模型假设联合用药效果不超过最强单药效果。Loewe 模型基于剂量加成原理，假设联合用药效果等同于等效剂量单药效果。ZIP 模型结合 Bliss 和 Loewe 模型，通过零交互效应假设来评估协同作用。
2024-07-02 22:29:47
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原创 enumerate函数
enumerate(iteration, start)函数默认包含两个参数，其中iteration参数为需要遍历的参数，比如字典、列表、元组等，start参数为开始的参数，默认为0（不写start那就是从0开始）。enumerate函数有两个返回值，第一个返回值为从start参数开始的数，第二个参数为iteration参数中的值。提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考。
2024-06-24 10:46:55
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原创 random.choices()和random.sample()函数的区别
在Python编程语言中，sample函数是一个用于随机抽样的实用工具，它属于random模块的一部分。通过使用sample函数，我们可以从给定的数据序列中随机选取一定数量的不重复元素。
2024-06-24 10:28:25
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原创 isin() 以及.loc[ ]的使用
解释：drug_disease_pd[‘drug’].isin(embeddingf_matrix.keys()) 生成一个。drug_disease_pd[‘disease’].isin(embeddingf_matrix.keys()) 生成一个。isin()方法用于过滤数据框（DataFrame）或序列（Series）中的值，仅保留在给定列表中出现的值。，标示每个 disease 是否在 embeddingf_matrix 的键中。这是一种常用的方法来基于条件选择 DataFrame 中的数据行。
2024-06-22 22:43:30
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原创 分隔符的使用
制表符分隔值 (TSV) 文件格式表示用纯文本格式的制表符分隔的数据。该文件格式类似于 CSV，用于以结构化方式组织数据，以便在不同应用程序之间导入和导出。该格式主要用于电子表格应用程序和数据库中的数据导入/导出和交换。TSV 文件中的每条记录都包含在单行文本文件中，其中每个字段值由制表符分隔。TSV 文件格式的媒体类型是文本/制表符分隔值。
2024-06-22 21:55:15
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原创 在服务器后台运行文件
nohup python 文件路径（要是这个.py文件不在根目录下就写绝对路径，在根目录下就直接写文件名.py) > 输出文件的名字.txt 2>&1 && 最后一个& ，代表该命令在后台执行，这个命令不仅会将输出而且还会将错误输出到txt文件中。2>1 2与>结合代表错误重定向，而1则代表错误重定向到一个文件1，而不代表标准输出；例如：nohup python test.py > test.txt 2>&1 &2>&1 换成2>&1，&与1结合就代表标准输出了，就变成错误重定向到标准输出.
2024-06-22 16:11:39
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原创 csv.reader与pd.read_csv的区别与应用
csv.reader()：适合简单的CSV文件读取任务，轻量但需要手动处理数据。csv.reader()返回一个reader对象，该对象将遍历csv文件中的行。从csv文件中读取的每一行都作为字符串列表返回。pandas.read_csv()：适合复杂的数据分析和处理任务，提供强大的数据操作功能和便捷接口。pandas.read_csv()返回一个dataframesepPandas用来指定字段分隔符（如空格、制表符、逗号等）。delimitercsv.reader用来指定字段分隔符。
2024-05-31 10:25:45
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原创 try...except...的使用
异常是我们常说的==“报错”，宏观上分为两类==，一类是语法错误（SyntaxError），另一类是程序异常（Exception）。无论是语法错误还是程序异常，只要触发，程序就会立刻停止运行。KeyError（键错误）：当试图访问字典中不存在的键时引发的异常。ValueError（值错误）：当传递给函数的参数类型正确但值不合法时引发的异常。TypeError（类型错误）：当使用不兼容的类型进行操作或函数调用时引发的异常。FileNotFoundError（文件未找到错误）
2024-05-22 18:15:33
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原创 sort_values()
用法：参数用法by指定列名或索引值，即：根据哪列进行排序axis若axis=0或’index’，则按照指定列中数据大小排序；若axis=1或’columns’，则按照指定索引中数据大小排序，默认axis=0ascendingTrue:升序；False:降序，默认为Trueinplace是否用排序后的数据集替换原来的数据，默认为False，即不替换{‘first’,‘last’}，设定缺失值的显示位置。
2024-05-22 15:23:32
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原创 对文件中某一行根据包含的数量进行筛选
针对上面两种方法，第二种要求数据格式是规范的且没有额外的复杂情况，所以第一种较为灵活，且生成的数据格式规范。
2024-05-21 17:30:16
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原创 os.path的用法
即：只创建clf_cutoff_negative目录，而如果之前的目录不存在并且也需要创建的话，就会报错。os.makedirs()创建。
2024-05-20 10:53:01
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原创 Python 分组的方法
本文为自己自学内容的记录，其中多有借鉴别人博客的地方，一并在参考文献中给出链接。其中内容有理解不到位的地方，请各位大佬在评论区给出修改意见，感恩🌹。
2024-04-22 19:31:53
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原创 python 的append与extend ； join与” + “；map(function, iterable)与for循环的用法比较
这就是append()和extend()的区别：append()将整个列表作为一个单独的元素添加到另一个列表中，而extend()将列表中的元素逐个添加到另一个列表中。中用于将字符串序列（如列表、元组等）中的元素连接成一个字符串的方法。是一个可迭代对象，如列表、元组等，其中的元素都是字符串。经过上面两种方法的比较，显然join()的方法更简短。是连接的分隔符，它将用于连接序列中的各个元素。分隔符连接起来，并返回连接后的字符串。
2024-04-15 21:56:14
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原创 Self-attention
本文为自己自学内容的记录，其中多有借鉴别人博客的地方，一并在参考文献中给出链接。其中内容有理解不到位的地方，请各位大佬在评论区给出修改意见，感恩🌹1.输入表示：首先，将序列中的每个元素转换为一个高维空间的向量表示，这些向量通常是通过嵌入层(Embedding Layer)得到的。2.得分计算：对于序列中的每个元素，self-attention机制会计算它与序列中其他元素之间的相似度或“注意力得分”。这通常通过计算元素之间的点积来完成，并且可以应用缩放因子以避免梯度消失或爆炸问题。3.权重归一化。
2024-04-09 22:23:40
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