synergy_bliss，synergy_hsa，synergy_loewe，synergy_zip的用法

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前言

提示：这里可以添加本文要记录的大概内容：

Synergy 是指多种药物联合使用时所产生的协同作用效果。常见的 Synergy 计算方法包括 Bliss、HSA、Loewe 和 ZIP。

一、Synergy Bliss介绍

Bliss 模型基于独立作用原理，假设两个药物在无交互的情况下独立起作用

公式

与实际观测的联合效果相比，确定是否有协同作用（预期效果与实际效果的差异）

二、Synergy HSA (Highest Single Agent)介绍

HSA 模型假设联合用药效果不超过最强单药效果。

公式（EA,EB之间是逗号，不是相乘）

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三、Synergy Loewe介绍

Loewe 模型基于剂量加成原理，假设联合用药效果等同于等效剂量单药效果。

公式

用法

计算各个药物单独使用的剂量DA,DB
计算联合用药时的剂量dA,dB
代入公式，若左边之和小于1，则有协同作用。

四、Synergy ZIP (Zero Interaction Potency)介绍

ZIP 模型结合 Bliss 和 Loewe 模型，通过零交互效应假设来评估协同作用。

公式

五、代码演示

# Example data
E_A = 0.3  # Effect of drug A
E_B = 0.4  # Effect of drug B
E_AB = 0.6  # Combined effect of drug A and B

# Bliss model
E_bliss = E_A + E_B - E_A * E_B

# HSA model
E_hsa = max(E_A, E_B)

# Loewe model (assuming equal potency)
d_A = 0.5  # Dose of drug A in combination
d_B = 0.5  # Dose of drug B in combination
D_A = 1.0  # Dose of drug A alone producing the same effect
D_B = 1.0  # Dose of drug B alone producing the same effect
E_loewe = (d_A / D_A) + (d_B / D_B)

# ZIP model
E_zip = E_bliss + E_loewe - 1

print(f"Bliss Model: {E_bliss}")
print(f"HSA Model: {E_hsa}")
print(f"Loewe Model: {E_loewe}")
print(f"ZIP Model: {E_zip}")

六、 synergy Bliss、HSA、Loewe 和 ZIP 模型的结果可以作为回归模型的标签 (labels)

6.1 预测协同作用评分

如果你有大量的药物组合数据及其相应的协同作用评分，可以训练一个回归模型来预测新药物组合的协同作用评分。

6.2 药物组合优化

可以使用模型来优化药物剂量组合，以最大化协同作用评分。