R语言中如何导入元素两两之间的距离数据

R语言中dist()函数与as.dist()函数

下面给出五个元素两两之间的距离,试利用最短距离法、最长距离法和类平均法做出五个元素的谱系聚类,画谱系图并做出比较。
在这里插入图片描述

如何将其数据导入R中如图所示

在这里插入图片描述
其表面R语言中dist()函数与as.dist()函数区别不一,dist()函数是默认使用最长距离法计算数据之间的距离,而as.dist()函数笔者经查询,没有具体资料显示,由图中代码显示可得出点与点之间的距离。

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在R语言,我们可以使用`survcomp`包的`pairwise_survdiff()`函数对两两之间的C-INDEX值进行比较。 首先,我们需要用`coxph()`函数拟合每个模型,并使用`survC1()`函数计算每个模型的C-INDEX值。 ``` r library(survcomp) library(survival) # 导入数据 data <- read.csv("D:/5放射诊断/R生存分析/nafld.csv") # 将CACSgrades和CADRADS转换为因子型变量 data$CACSgrades <- as.factor(data$CACSgrades) data$CADRADS <- as.factor(data$CADRADS) # 拟合模型 model1 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking, data = data) model2 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking + CACSgrades, data = data) model3 <- coxph(Surv(time, MACE) ~ sex + age + NAFLD + Hypertension + Diabetes + Dyslipidemia + smoking + CACSgrades + CADRADS, data = data) # 计算C-INDEX值 cindex1 <- survC1(model1, data, time = "time", event = "MACE") cindex2 <- survC1(model2, data, time = "time", event = "MACE") cindex3 <- survC1(model3, data, time = "time", event = "MACE") ``` 接下来,我们可以使用`pairwise_survdiff()`函数对两两之间的C-INDEX值进行比较,以检查它们之间是否有显著差异。 ``` r # 对两两之间的C-INDEX值进行比较 pairwise_survdiff(list("Model 1 vs. Model 2" = cindex1$cindex, "Model 1 vs. Model 3" = cindex2$cindex, "Model 2 vs. Model 3" = cindex3$cindex)) ``` 这将输出一个表格,显示每对模型之间的p值和显著性水平。如果p值小于0.05,则意味着这两个模型的C-INDEX值之间有显著差异。

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