- 博客(27)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 【生物信息】 系统发育树-有根树 转化 无根树-基于R语言
在生信数据处理过程中，有时候要求我们使用无根树此处提供一种基于R语言ape包将有根树转化为无根树的方法和代码：
2022-04-25 18:06:41
2586
1
原创 不会画关系图？5 类图形为你展示—变量间相互关系—提供示例与完整代码-ggplot2-geom_point-ComplexHeatmap-pheatmap-ggpairs
不会画关系图？5 类图形为你展示—变量间相互关系—提供示例与完整代码-ggplot2-geom_point-ComplexHeatmap-pheatmap-ggpairs
2022-03-24 15:23:36
5716
原创 棒棒糖也能画成图—— ggplot2绘制棒棒糖图/哑铃图
欢迎关注公众号查看原文Part 1 ：棒棒糖图棒棒糖图因其形状和棒棒糖相似而得名，具体来看实际上是一个散点和一条线段的组合。棒棒糖图是散点图的一种变体，又与柱状图非常相似，但其在清晰展示数据的同时，减少了图形量，使得读者能够更加关注于数据本身而非图形。棒棒糖图能够帮助将数值与类别对齐，非常适合比较多个类别的值之间的差异。 本期介绍棒棒糖图的基本作图方法和优化**示例1：**相同数据源下柱状图和棒棒糖图展示数值差异效果对比**示例2：**使用棒棒糖图画出的好图Part 2 ：图像与代
2022-03-21 10:19:13
5491
原创 一起学画图：散点图+边缘分布统计图形-密度图-直方图-箱型图-小提琴图
Part 1 ：散点图+变量边缘分布图形公众号原文点我，感谢支持许多文章的散点图中，在散点图的周围还会有额外的单变量边缘分布统计图形（如下图）。前面几期我们介绍过，散点图主要反映的是两个变量之间的关系，而额外的边缘分布图则能直观反映每个变量的分布情况。本期就来介绍实现这类图形的常见方法。示例：Abundance of antibiotic resistance genes, intI1 gene and crAssphage in human fecal metagenomes.[1]示例图中散
2022-03-10 19:40:02
3315
原创 一起学画图：气泡图—常用于富集分析
公众号原文点我Part 1 ：气泡图气泡图是散点图的一种变体，一般的散点图反映的是两个连续变量之间的关系。而气泡图通常可以反映三个变量之间的关系，第三个变量一般体现在气泡的大小。当然，如果赋予气泡不同的颜色，那么也可利用其反映四个变量之间的关系。在实际使用中，气泡图常用于展示基因富集分析的结果。本期使用R包gapminder中现有数据集，基于ggplot2制作气泡图Part 2 ：图像与代码在加载数据并对数据进行简单的筛选后，很容易做出一个简单的气泡图：#加载相关包library(ggplo
2022-03-02 20:24:16
6502
原创 【学习笔记】Task04：集合运算-表的加减法和join等-天池龙珠计划SQL训练营 & 练习题详细解答
Task04：集合运算-表的加减法和join等-天池龙珠计划SQL训练营教程链接COMMENTS:这部分内容对于未接触增进没有接触过SQL语言的读者来说可能有点冗长和费劲，一方面语句的理解有些困难，另一方面本章文字内容非常多，非常容易让读者放弃。当然了，文中的例子质量非常高，想必是作者在实际工作中遇到的很多情况的影子。UNIONUNION 等集合运算符通常都会除去重复的记录.UNION ALL 进行不去重地合并.MySQL 8.0 还不支持 EXCEPT 运算，不支持交运算INTERSEC
2021-08-10 17:51:00
204
原创 【学习笔记】Task05：窗口函数等--天池龙珠计划SQL训练营
Task05：窗口函数等–天池龙珠计划SQL训练营原教程链接建议参考学习书籍: 《SQL基础教程》窗口函数窗口函数也称为OLAP函数,OLAP 是OnLine AnalyticalProcessing 的简称，意思是对数据库数据进行实时分析处理。常规的SELECT语句都是对整张表进行查询，而窗口函数可以让我们有选择的去某一部分数据进行汇总、计算和排序。窗口函数的通用形式：<窗口函数> OVER ([PARTITION BY <列名>]
2021-08-10 17:44:21
141
原创 阿里云天池龙珠计划—Python训练营： Task 4 Python数据分析：从0完成一个数据分析实战——.ipynb文件分享
天池的训练营的内容还不错，介绍了在使用Python进行机器学习中会用到的常见语法。但对于0基础学习Python的读者而言，部分地方可能需要稍加注释进行进一步解释，为此我上传了我的学习.ipynb文件，与大家分享。如有错误，欢迎指出。该Task是天池上面一个比赛：链接点我下载.ipynb文件...
2021-06-26 12:17:39
250
原创 阿里云天池龙珠计划—Python训练营： Task 1 Python基础入门：从变量到异常处理——.ipynb文件分享
天池的训练营的内容还不错，介绍了在使用Python进行深度学习中会用到的常见语法。但对于0基础学习Python的读者而言，部分地方可能需要稍加注释进行进一步解释，为此我上传了我的学习.ipynb文件，与大家分享。如有错误，欢迎指出。点我下载.ipynb文件...
2021-06-26 12:13:50
820
原创 阿里云天池龙珠计划—Python训练营：Task 2 Python基础练习：数据结构大汇总——.ipynb文件分享
天池的训练营的内容还不错，介绍了在使用Python进行深度学习中会用到的常见语法。但对于0基础学习Python的读者而言，部分地方可能需要稍加注释进行进一步解释，为此我上传了我的学习.ipynb文件，与大家分享。如有错误，欢迎指出。点我下载.ipynb文件...
2021-06-26 12:07:29
216
原创 阿里云天池龙珠计划—Python训练营：Task 3 Python基础进阶：从函数到高级魔法方法——.ipynb文件分享
天池的训练营的内容还不错，介绍了在使用Python进行深度学习中会用到的常见语法。但对于0基础学习Python的读者而言，部分地方可能需要稍加注释进行进一步解释，为此我上传了我的学习.ipynb文件，与大家分享。如有错误，欢迎指出。点我下载.ipynb文件...
2021-06-26 12:04:25
132
原创 Python-批量修改/删除/添加文件名称
import osdir = r'./测试文件/'list = os.listdir(dir)os.chdir(dir) # os.chdir() 方法用于改变当前工作目录到指定的路径。 # 只有这样操作了，下面的 os.rename()才会到这个目录下执行for file in list : new =file.lstrip('1') #删除前缀 1 print("原文件名："+file+" "+"新文件名："+new) os.rename
2021-06-16 13:01:55
607
原创 VMware无法打开问题解决：VMX无法访问等
一开始是出现如：Windows无法访问该路径、文件……的问题，这个问题网上一堆处理方法，无一适用。后来无意中看到是因为执行文件被劫持了，这个问题可以在安装目录下把程序名称更改，然后可以正常执行。然而……还没有结束，在打开虚拟机时又提示了包括：VMX无法访问等问题。这个问题又要怎么解决呢？找到你在VMware下安装虚拟机的目录，手动用VMware执行虚拟机.VMX的文件，可以执行了。但是你以为这就完了？虚拟机开机进去，2分钟左右，自动关机。得，这下子可能是我得Windows系统出问题了，可是重装系.
2021-03-03 13:09:11
1976
原创 阿里云—天池龙珠计划 SQL训练营——学习笔记/思维导图
这是我参加该训练营的学习笔记的第一篇第一课首先介绍了不同类别的数据库以及它们的典型代表，课程是以“关系型数据库” MySQL为平台开展的。并且，课程中提供了布置阿里云MySQL云数据库（当然，也提供本地MySQL数据库搭建的教程）的详细教程，以及创建数据库和表的详细步骤，上手容易，对小白友好。同时，还介绍了不同SQL语句的类别，并且提供了常用的例子以方便理解。课程还提供了自动建表的脚本，里面已经建好了后续课程将会用到的各类数据，并且导入方便，这大大方便了后续课程的学习和实际操作。可以说，这一课
2021-01-18 19:09:08
486
原创 中缀表达式转换为后缀表达式可编程法和手动操作法
中缀表达式转后缀表达式大体分为两种方法：手动转换：可以使用加括号法，二叉树法可编程法：维护一个运算符优先级表后缀表达式转中缀表达式可以用栈后缀表达式逐个入栈，栈初始为空。非操作符正常入栈，遇到操作符分先后从栈弹出两个操作数A和B（A先弹出），假设操作符为"&"，则得到中缀表达式为B&A，再将B&A作为操作数入栈，如此往复。中缀转后缀手动转换：1、括号法：（1）在中缀表达式中，按照运算符的优先级对运算符所包含的运算单元加括号。比如 a+b*c 加括号后为：(a+(
2020-06-10 20:28:14
385
原创 高等数学常用极限求法总结（无详解）
高等数学常用极限求法1、利用极限的四则运算法则与幂指数运算法则求极限（1）极限的四则运算法则及其推广（2）幂指数函数的极限运算法则及其推广（3）如0/0，∞/∞型等的不定时等不直接用上面的法则2、利用函数的连续性求极限3、利用变量替换法与两个重要极限求极限4、利用等价无穷小因子替换求极限5、利用洛必达法则求未定式（限于0/0和∞/∞型）的极限6、分别求左右极限以求得函数极限7、利用函数极限求数列极限8、利用适当放大与缩小求极限（1）简单的方法与缩小（2）利用极限的不等
2020-06-10 10:17:48
8131
原创 Keras如何保存每轮（每个Epoch）训练后的模型？
首先给出Keras中文官方文档：首先明确：保留模型需要使用Keras中的回调函数中的ModelCheckpoint怎么使用？在 .fit( ):fit(x=None, y=None, batch_size=None, epochs=1, verbose=1, callbacks=None, validation_split=0.0, validation_data=None, shuffle=True, class_weight=None, sample_weight=None,
2020-05-28 11:04:20
13820
2
原创 《网络是怎样连接的》阅读笔记（2），计算机网络基础知识小结笔记。
说明见《网络是怎样连接的》阅读笔记（1），计算机网络基础知识小结笔记。操作系统中的网络控制软件（协议栈）和网络硬件（网卡）操作系统内部：包括协议栈协议栈的上半部分：有两块，分别是负责用TCP 协议收发数据的部分和负责用UDP 协议收发数据的部分，它们会接受应用程序的委托执行收发数据的操作。浏览器、邮件等一般的应用程序都是使用TCP收发数据的.DNS查询等收发较短的控制数据的时候则使用UDP。UDP协议中的套接字不绑定对方的地址和端口。协议栈的下半部分：用IP 协议控制网络包收发操作的部分
2020-05-19 17:15:58
754
原创 《网络是怎样连接的》阅读笔记（1），计算机网络基础知识小结笔记。
首先，应该承认这本书写得是不错的。但是我读电子版读起来的感觉就是太累，累的原因是作者行文的时候是行云流水的从头到尾。其中可能会因为一些需要了解的知识额外补充很长的篇幅，导致你阅读是忘记自己到底阅读到网络的哪一步了。这只是我的自己在阅读时的一些摘要，笔记，和一些自己的理解。主要作为时用于记录自己学习的过程，如果能对你有帮助，那就太好了！当然了，我记录的这些内容并不完整，看到哪记到哪，如果有错误的地方非常希望大家指正。如果你需要这本书的pdf非扫描版本的话可以点赞留言，然后私信我，我看到后会即使给你发过
2020-05-19 17:14:22
562
原创 C/C++常用数据类型精要总结（不包括指针和结构及其他类型）
一份自我复习笔记，欢迎大家 指正、补充数据类型int：整型变量，一般占4个字节（4B），范围为[-231,231-1] （4B共32位，其中此处为带 符号位1位）unsigned int：无符号整型，占4个字节（4B），表示一个非负整数，范围为[0,232-1]long：长整型，与int型一样，占4个字节（4B）unsigned long:无符号长整型。类比int 和uns...
2020-05-02 18:06:47
278
原创 python的Opencv的'NoneType' object has no attribute shape问题解决
原因：cv2.imread(filepath,args)中filepath带有中文，也即图片文件目录要全英文。参考连接：https://www.jianshu.com/p/4773ac97675f
2020-04-01 20:26:03
1309
原创 Keras框架：“Failed to get convolution algorithm. This is probably because cuDNN failed to initialize”解决
看了论坛里很多大哥得解决方法，我自行调整了以下可行得代码。因为大佬们发出来得还有些tf不兼容得情况，我就不列举了。import tensorflow as tfimport kerasconfig = tf.compat.v1.ConfigProto(allow_soft_placement=True)config.gpu_options.per_process_gpu_memory...
2020-03-28 13:04:54
450
1
原创 python 读取txt文件内容并按列写入excel文件中
import xlwt #写入excel文件的库hr_book= xlwt.Workbook(encoding='ascii')hr_sheet=hr_book.add_sheet('HR_title',cell_overwrite_ok=True) #创建表格with open(r'此处为txt文件的路径','r+') as title: #'r+'表示对文件是进行"读取和写入的模式"...
2019-07-12 14:59:01
13204
3
原创 Python+Echarts=Pyecharts 图表运用：嵌套饼图的自行创建、运用示例（含完整可运行源码）
我的系统环境不知道什么原因用不了Pyecharts1.0以上的版本（Python版本是3.6.5，各种模块调用失败），故只得使用0.5.11的版本。在一次实例中需要用到一个父子关系及其在相应类别中比例的展示，日落图（Sunburst）显然是一个比较适合的图表。然而，官方文档表示：version 1.1.0 - 2019.5.14Addissue#1052，issue#1065...
2019-07-08 10:39:43
3658
1
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人