nLogn LCS 算法总结

参考http://www.cs.ucf.edu/courses/cap5937/fall2004/Longest%20common%20subsequence.pdf

最长公共子序列 的 nlogn 的算法本质是 将该问题转化成 最长增序列(LIS),因为 LIS 可以用nlogn实现,所以求LCS的时间复杂度降低为 nlogn。

1. 转化:将LCS问题转化成LIS问题。

               假设有两个序列 s1[ 1~6 ] = { a, b, c , a, d, c }, s2[ 1~7 ] = { c, a, b, e, d, a, b }。

               记录s1中每个元素在s2中出现的位置, 再将位置按降序排列, 则上面的例子可表示为:

               loc( a)= { 6, 2 }, loc( b ) = { 7, 3 }, loc( c ) = { 1 }, loc( d ) = { 5 }。

               将s1中每个元素的位置按s1中元素的顺序排列成一个序列s3 = { 6, 2, 7, 3, 1, 6, 2, 5, 1 }。

               在对s3求LIS得到的值即为求LCS的答案。(这点我也只是大致理解,读者可以自己理解甚至证明。)

2.求LIS的 nlogn 的算法:

               参考上面给出链接中的pdf,由于是英文的,我也只是做一些翻译,译得不准请见

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