Python科学计算学习:从入门到放弃系列(2)用scipy解常微分方程组(涉及解释蝴蝶效应现象)

前言

Python 科学计算,接下来重点是三个,分别是1)解微分方程,2)画图和3)数值优化。前两者是相互关联的,因为对于微分方程的求解,如果不进行绘图展示,是很难直观理解解的含义的。另外,这部分的学习,对我来说有点困难,只能一步一步,慢慢前进了。

1. 问题描述(来自教材)

现在有一组常系数微分方程组(洛伦兹吸引子,这是混沌里面的内容)
方程组
三个方程表示了粒子在空间三个方向上的速度,求解这个方程组,也就是要在给定起点 ( x 0 , y 0 , z 0 ) (x_0,y_0,z_0) (x0,y0,z0) 和常数 ( σ , ρ , β ) (\sigma,\rho, \beta ) (σ,ρ,β) 情况下,求出一系列的坐标点 ( x i , y i , z i ) (x_i,y_i,z_i) (xi,yi,zi) (即粒子的空间轨迹。)

敲黑板重点:上面的方程,都是一阶的,就是每个变量,只是对时间 t t t 求一阶微分,这种情况下,才是我们今天介绍的函数能解的。如果是二阶及以上,需要进行转化才能求解(这部分内容暂时不会涉及)。

2. 解决步骤

  1. 写目标函数,其返回值是待求解的常微分方程组,该函数的自变量,包括微分方程组的自变量,还有待求值的时间片,方程常数
  2. 运行时间片调用 numpy.arange(),进行切片(计算机数值求解均是离散的)
  3. 调用 scipy,integrate.odeint() 进行求解,返回结果应该是与t时间片对应的各个状态
  4. 绘图即可展示给定时间里面的解!

3. 编程实现

3.1 实现代码

#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
# @Date    : 2019-04-09 16:10:50
# @Author  : Promise (promise@mail.ustc.edu.cn)
# @Link    : ${link}
# @Version : $Id$

from scipy.integrate import odeint  # 用from语法的,直接调用,不需要前面的包
import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import pylab as pl  # pylab 和 pyplot 有相近的功能
from scipy import integrate
import matplotlib.pyplot as plt


def lorenz(w, t, p, r, b):
    # w 是矢量,包含(x, y, z), 三个参数 p,r,b
    # 计算微分量?
    x, y, z = w.tolist()
    # 返回量是lorenz的计算公式
    return p*(y-x), x*(r-z)-y, x*y - b*z


t = np.arange(0, 30, 0.02)  # 时间点
# 调用 ode 对 lorenz进行求解
track1 = odeint(lorenz, (0.0, 1.00, 0.0), t, args=(10.0, 28.0, 3.0))  # odeint,函数名后面的位置,是传入自定义函数的参数
track2 = odeint(lorenz, (0.0, 1.01, 0.0), t, args=(10.0, 28.0, 3.0))
print(track1)
print(track1[:, 0])  # 取出第0列的意思,因为数组的每一行分别是 x,y,z; 取第0列就是把所有x取出来

# 画图

fig = pl.figure()
ax = Axes3D(fig)
ax.plot(track1[:, 0], track1[:, 1], track1[:, 2], lw=1)
ax.plot(track2[:, 0], track2[:, 1], track2[:, 2], lw=1)  # 用同一个ax,说明两幅图画在同一幅图
# 最后的show()不能忘
pl.show()

3.2 运行效果

两个初始值的比较
微分方程的计算机求解,本质上是把微分方程离散成差分方程(离散才是计算机的本质,就像或许量子的离散才是我们这个连续物质世界的本质,一切都是这么奇妙~)

求解过程,是以初始条件为起点,计算给定时间内每一个位置 ( x , y , z ) (x,y,z) (x,y,z),因此,odeint()函数,返回的是一系列数据点,如果仅是数值输出,是看不出什么规律的,只有画成上图,我们才能直观把握整个系统是如何运动的。上图两个线,是两条轨迹图。

洛伦兹吸引子是混沌理论里面的一个例子,讲的是,即使对于有确定描述的运动方程,只要初始条件有稍微的不同(如程序中,初始条件,(0.0, 1.00, 0.0) 和 (0.0, 1.01, 0.0),仅相差0.01), 也会导致后期的运动轨迹完全不同,用大家熟悉的话来说,就是蝴蝶效应

3.3 代码分析

  1. 需要调用的程序包,照着上面程序导入即可
  2. 时间分片函数,t = np.arange(0, 30, 0.02) # 时间点, 这是图中轨迹的来源,因为有这么多时间片段,才有那么多点让我们刻画轨迹
  3. odeint()的调用,track1 = odeint(lorenz, (0.0, 1.00, 0.0), t, args=(10.0, 28.0, 3.0)) # odeint,函数名后面的位置,是传入自定义函数的参数, 第一个参数,是我们要求解的微分方程组对应函数的函数名(有点绕),后面的所有参数,其实都是该函数定义过程中,使用的参数,请仔细阅读上面的代码
  4. odeint() 的返回值,是一个 m m m n n n 列的矩阵, n n n 对应我们定义的函数 l o r e n z ( w , t , p , r , b ) lorenz(w, t, p, r, b) lorenz(w,t,p,r,b) 返回值的个数,这个例子是3个( ( x , y , z ) (x, y,z) (x,y,z)), 因此 n = 3 n=3 n=3 m m m行对应时间片的数量,多少片,多少行。
  5. track1[:, 0], 对应第4的分析,每一列对应一个返回值,这里表示取出第0列,也就是把所有 x x x的值取出来,因为要画图。

4. 总结

在Python科学计算这里,是相对简单的,只要懂得基本的求解原理,照着说明使用求解函数,就可以了。

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洛伦兹方程是一非线性微分方程,可以使用scipy库中的odeint函数进行。odeint函数是scipy.integrate模块中的常微分方程通用函数,可以用于常微分方程和偏微分方程。 首先,需要导入所需库: ```python import numpy as np from scipy.integrate import odeint ``` 接下来,定义洛伦兹方程的函数。洛伦兹方程涉及三个变量,分别是x、y、z,以及三个参数σ、ρ、β。洛伦兹方程可以表示为三个微分方程: ```python def lorenz_equations(variables, t, σ, ρ, β): x, y, z = variables dx_dt = σ * (y - x) dy_dt = x * (ρ - z) - y dz_dt = x * y - β * z return [dx_dt, dy_dt, dz_dt] ``` 其中,variables是变量的数,包括x、y、z;t是自变量,通常为时间;σ、ρ、β是参数。 然后,定义初始条件和参数: ```python initial_conditions = [x0, y0, z0] t = np.linspace(t_start, t_end, num_points) ``` 其中,x0、y0、z0是初始条件,t_start、t_end是的时间范围,num_points是在该时间范围内想要获得的数据点的数量。 接下来,使用odeint函数洛伦兹方程: ```python solution = odeint(lorenz_equations, initial_conditions, t, args=(σ, ρ, β)) ``` 其中,lorenz_equations是定义的洛伦兹方程函数,initial_conditions是初始条件,t是自变量数,args是参数。 最后,可以通过solution数获得的结果,例如: ```python x = solution[:, 0] y = solution[:, 1] z = solution[:, 2] ``` 这样就可以获得x、y、z随时间变化的数据。 请注意,洛伦兹方程是一种混沌系统,初始条件和参数的微小变化可能导致完全不同的结果。因此,对于相同的初始条件和参数,可能会得到不同的

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