节选自http://blog.sina.com.cn/s/blog_4d25466d0101nppl.html
DICOM 源自: involving the American College of Radiologists(ACR) and the National Electronics
Manufacturers Association (NEMA),是存储Image最简单格式,它是用于不同类型数据交流的一个协议。即不同类型的图像用DICOM存后,便于同行业进行分析。
它存每个slice看到单独的file,这些files用它代表的slice number来命名。头文件信息也嵌在该文件里,必须解压缩方能读取。在所有的图像格式中,DICOM数据在头文件里header里保持元数据(元数据meta-data包括原始数据和图像的基本信息如:维度和数据种类等信息。)。由于其存的文件多,操作就麻烦了,为此数据分析前需要将DICOM数据进行转换。
NIfTI National Institute of Mental Health and the National Institute of Neurological Disorders and Stroke 2000年开发的。2004年新版的NIfTI-1是Analyze7.5格式的拓展版,含有更多metadata.最重要的特点就是:它代表了在MRIscanner中的voxel indices 和spacial location的关系。使用合理的话,它会告诉我们哪边代表左脑。它标准的NIFTI文件拓展名.nii,里面含有header&image数据。
坐标系统
节选自https://www.cnblogs.com/haore147/p/3631448.html
dicom主要由扫描器产生,一般是一个slice一个文件;analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多;nifti ,由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式,支持3d或者4d。
一般从sanner拷出来的文件夹中,每一个文件夹里的dicom文件,代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。