R语言----05安装R包

 一、前言

1.R包是什么?

R包可以理解为多个函数的打包存放,包含函数、数据、帮助文件、描述文件等。

2.为什么要安装R包?

特定的分析功能,需要用相应的包实现。

二、R包安装

 1.R包都在哪里及怎么安装?

代码是在RStudio里运行

(1)CRAN网站----install.package()

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(2)Bioconductor----BiocManager::install()

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(3)github----devtools::install_github()

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2.如何快速下载R包?

可以使用镜像网站。镜像网站,即把一个互联网上的网站数据“拷贝”到本地服务器,并保持本地服务器数据的同步更新,因此也称为“复制网络站点”。

它和主站并没有太大差别,或者可算是为主站作的后备措施。有了镜像网站的好处是:如果不能对主站作正常访问(如某个服务器死掉或出了意外),但仍能通过其它服务器正常浏览。

R和Bioconductor主网站位于国外,选择国内的镜像可加快访问速度。

国内镜像推荐:

清华镜像、中科大镜像

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3.检查是否安装成功?

library( ) #括号里填刚安装的R包

(如果没有出现error,即安装成功)

4.如何列出一个R包里的函数或数据?

(1)ls()函数

在R中,可以使用ls()函数来列出当前环境中的所有对象,包括函数和数据。如果你已经加载了某个R包,可以使用ls()函数来列出该包中的所有函数和数据。

library(package_name)  # 加载R包
ls("package:package_name")  # 列出R包中的所有函数和数据

(2)lsf.str()函数

lsf.str()函数可以列出指定环境中的所有函数的详细信息,包括参数、返回值等。可以使用该函数来列出R包中的所有函数。

library(package_name)  # 加载R包
lsf.str("package:package_name")  # 列出R包中的所有函数的详细信息

(3)data()函数

如果你想列出R包中的所有数据集,可以使用data()函数。该函数会列出指定环境中可用的所有数据集。

library(package_name)  # 加载R包
data(package = "package_name")  # 列出R包中的所有数据集

 

 

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R软件的介绍 R是一个开放的统计编程环境,是一种语言R语言是从S语言演变而来的。S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。基于S语言开发的商业软件Splus,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性,取得了巨大成功。1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。R是开源软件,代码全部公开,对所有人免费。R可在多种操作系统下运行,如Windows, Li~和UNIX等。R需要输入命令,可以编写函数和脚本进行批处理运算,语法简单灵活。目前在R网站上约有两千多个程序,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。 R的获取与安装 R诞生于the University of Auckland的统计系。The Comprehensive R Archive Network简称CRAM,提供下载安装程序和相应软件。 R主页http://www.r-project.org/a下载:CRAM,选择镜像(如:http://cran.cnr.berkeley.edu/ ),选择操作系统(Linux,Windows或MacOS)。 以下简述R FOR WINDOWS的安装和使用: 在R主页下可以找到R的各个版本的安装程序和源代码。点击进入:Windows (95and later),再点击:base,下载SetupR.exe,约18兆,此便是R FOR WINDOWS的安装程序。双击SetupR.exe,按照提示一步步安装即可。 安装完成后,程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式(也可以在安装过程中选择不要创建)。通过快捷方式运行R,便可调出R的主窗口。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件,R的界面简单而朴素,只有不多的几个菜单和快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口,它也是部分运算结果的输出窗口,有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R时出现的一些说明和指引。 文字下的:>符号便是R的命令提示符,在其后可输出命令;>后的矩形是光标。R一般是采用交互方式工作的,在命令提示符后输入命令,回车后便会输出结果。 在R朴素的界面下,是丰富而复杂的运算功能。 附加安装 install. packages(package name, dependencies=TRUE) Windows下可以用菜单Packages--} Install package(s)安装 版本的更新 主程序:Windows下面只能卸载再安装 程序:update.packages() RStudio R语言可以独立运行,但是Rstudio作为R附加的GUI,有效的划分功能区,使输入和输出更为方便。 RStudio是可以在Mac OS X, Linux和Windows上运行在R编程语言中的生产力和灵活的用户界面。是一个自由和开源编程语言和环境,提供了大量的图形和统计方法统计计算和图形。从中可以快速方便地访问各种生产力工具的面向用户的界面。RStudio是一个非常实用的R语言的IDE,是一个免费的软件,特别是其服务器软件,可以将其构建在Linux服务器上,然后通过远程网页登陆访问,使得R语言的使用获得了极大的方便,也可以说是一个小小的云服务。

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