冠层、叶片和光系统尺度的日光诱导叶绿素荧光SIF模拟的辐射传输模型:SCOPE模型介绍
SCOPE模型全称:Soil Canopy Observation, Photochemistry and Energy fluxes (SCOPE, Van der Tol et al. 2009)是荷兰特温特大学ITC的van der Tol开发的结合辐射传输和能量守恒的一维模型。是目前最广泛应用于日光诱导叶绿素荧光模拟的模型之一。
本文简单介绍SCOPE最新版本V1.73的模型功能、基础入门、模拟选项、输入和输出文件等。文末有SCOPE模型(Matlab版本)的Github下载地址和说明文档地址。
目录:
第一部分 模型功能介绍
第二部分 模型基础入门
第三部分 模拟选项介绍
第四部分 输入和输出文件介绍
第一部分 模型功能介绍
Model capabilities
Spectra
Fluorescence
Energy balance
Vertical profiles
BRDF
Time series
光谱模拟:
对于热辐射光谱,启用options.calc_planck
&options.calc_ebal
。
使用BSM模型进行土壤反射率模拟 options.soilspectrum
定义
光谱的光学部分Optical
考虑了物体(叶片,土壤)反射光的能力。
光谱的热辐射Thermal
部分基于普朗克定律,即温度高于0 K的任何物体都会发射电磁波。
SCOPE模型使用描述电磁波传播的辐射传输理论,并考虑了吸收和散射。
模型中包含3个部分:
土壤部分:
SCOPE使用BSM()(if options.soilspectrum)
模拟土壤反射率(光学部分)。另外,也可以提供一个具有土壤反射率的光谱文件(几个选项在*./data/input/soil_spectrum/soilnew.txt*
*中)。
叶片
SCOPE模型(尤其是fluspect_B_CX_PSI_PSII_combined()
)的工作方式类似于PROSPECT模型,模拟了叶片的反射率,透射率和吸收率(扣除反射率和透射率的部分)。特殊的部分是SCOPE可以模拟荧光。
另一个好处是xanthopyll循环(可用option.calc_xanthophyllabs
),您可能会在500 nm附近看到一个微小的差异。
备注:叶片尺度没有热辐射的叶片反射率的模型
冠层
SCOPE将冠层表示为两种类型的60个基本叶子层:阳叶sunlit(考虑叶子的倾斜度)和阴叶shaded。
在此考虑叶片和土壤的光学特性。
光学性能由RTMo()
,热辐射性能由RTMt_planck()
计算。输出的辐亮度Radiance(如下图所示)
备注:默认配置使用Stefan-Boltzmann定律(RTMt_sb()
),它将输出光谱积分的热通量而不是每个波长,在这种情况下:
半球形热辐射的积分为432.5 W m-2
直接辐射的积分140.4 W m-2
荧光模拟
options.calc_fluor
定义:
到达叶片(几乎所有物体)的光可以被反射,透射或吸收。在植物中,吸收的光可以用于三种不同的过程:
光化学反应 photochemistry(吸收二氧化碳)
非光化学淬灭non-photochemical quenching(NPQ):热耗散
发射叶绿素荧光chlorophyll fluorescence excitation
荧光(几乎是所有光)在到达传感器的过程中都会被吸收和散射。
SCOPE模型可以模拟3种荧光(半球):
(1)fluorescence emitted by all photosystems 光系统发出的所有荧光,在叶片或冠层内都没有任何散射/重吸收;
(2)fluorescence emitted by all leaves 所有叶片发出的荧光,在冠层内部或土壤背景下没有任何散射/重吸收;
(3)fluorescence emitted by canopy (all leaf layers) 冠层(所有叶片)发出的荧光,考虑了所有散射/重吸收。
备注:注意定向荧光和半球荧光在范围和单位上的差异。
SCOPE模型模拟定向荧光(实际到达传感器的荧光)及其成分来自:
(1)阳叶
(2)阴叶
(3)叶片和土壤的散射
可以使用options.calc_PSI
计算光系统Ⅰ的定向荧光,但不建议在光系统Ⅰ和Ⅱ(PSI,PSII)之间分配定向荧光。
备注:biochem_out里面存储着biochemical()
的输出,与PAM荧光有关的输出。
能量守恒模拟
定义
净辐射(Rn):… http://www.indiana.edu/~geog109/topics/04_radiation/4c-Radia