基于TCGA及SEER等癌症公共数据库的深度挖掘和科研设计
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身处大数据时代,对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员,有没有一种可以既不做实验又不查病史,直接调用公共数据撰写发表SCI论文的方法呢?TCGA和SEER等癌症公共数据库即提供了这样一种可能。TCGA和SEER分别侧重于组学数据和临床数据,各有优势。TCGA(癌症基因组图谱)数据库是一个多组学的数据库,包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的SEER(癌症监测、流行病学和结果)数据库则是典型的临床医学数据库,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了各个癌种的海量临床病理信息和预后数据,并向全世界免费开放,为临床医师的循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计,全世界基于TCGA和SEER数据挖掘产生的文章已经超过2000篇,其中不乏最顶尖的学术期刊文章(如JAMA、新英格兰、Nature、Cell等),这一数目还在不断增长中。以往的TCGA课程往往侧重于R语言程序的讲解,不少学员反应难以掌握。本课程立足应用和实战,宗旨是“临床医生听得懂、学得会,科研人员亦有收获”。本课程将从临床应用视角介绍癌症公共数据库TCGA、SEER的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本统计方法等,深度解析近年讲课人发表的基于TCGA和SEER数据挖掘的经典案例,重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论,最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI论文撰写策略。
一、时间地点:
2019年5月24日–5月26日 郑州*鑫地酒店
(课程安排:第一天报到,授课两天&
基于TCGA及SEER等癌症公共数据库的深度挖掘和科研设计会议
最新推荐文章于 2024-01-12 19:00:55 发布
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