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RSS订阅原创 产品升级！抗性宏基因组SARG数据库更新至3.2版本，数据注释更丰富！
SARG（Structured Antibiotic Resistance Genes，https://smile.hku.hk/SARGs）数据库，其由ARDB和CARD整合而成，目前更新到v3.2版本，是已知的最为完整的抗生素抗性基因数据库。
2024-08-16 10:49:50
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原创 IF＞22| 一文解析宏基因Catalog怎么做
宏基因组基因目录（Catalog）是指利用大量的宏基因组数据，分析特定环境中的所有微生物的数据，可用于表征该环境中微生物特点、功能，是微生态研究的重要手段。
2024-08-14 18:02:25
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原创 深入水稻叶际：三代宏基因组测序揭示微生物组新奥秘
在获取叶际微生物宏基因组组装基因组(MAGs)时，研究人员面临着植物宿主污染和测序量限制等高难度挑战。
2024-08-07 10:52:16
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原创 自然界的清道夫：一株神奇的链霉菌
通过基因组分析和代谢通路的重建，解释了FZ201 具有丰富的降解基因和复合的降解网络，揭示了FZ201菌株降解PAEs的潜在机制。
2024-08-05 10:23:02
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原创 产品升级！抗性宏基因组又增添新成员：毒力基因VFDB-2024版
VFDB数据库全称为Virulence Factors of Pathogenic Bacteria，用于专门研究致病细菌、衣原体和支原体致病因子的数据库。
2024-07-31 11:03:03
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原创 C4单细胞|大脑发育也靠“内卷”？DNBelab C4平台神经科学领域又一力作！
“优胜劣汰，物竞天择，适者生存”是亘古不变的丛林法则，这在生命构成的基本单位-细胞间也不例外，为了争夺有限资源与空间，细胞间常常会发生激烈的竞争。
2024-07-29 11:08:37
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原创 产品升级|宏基因组产品增加新成员：多酚代谢注释数据库
多酚（polyphenol）是一种化学多样且丰富的植物衍生化合物，包括10000多个化学式和几个结构家族，包括聚合物（例如单宁）、单体（例如类黄酮）和简单酚类（例如酚酸）。
2024-07-22 11:20:01
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原创 肿瘤微生态研究利器——5R 16S rDNA测序
肿瘤微生物组（Tumor Microbiome）是肿瘤微环境中不可或缺的成员，肿瘤内微生物群通过多种机制影响肿瘤发展，在不同类型的肿瘤中，肿瘤内微生物群的组成和丰度具有高度异质性。由于它们的低生物量和其他障碍，全面描述肿瘤微生物组的特征极具挑战性。目前可用于研究肿瘤内微生物群的技术有。是对16S rDNA基因上的五个区域（V2、V3、V5、V6、V8）进行多重PCR扩增和测序。可有效降低组织中宿主DNA对细菌16S rDNA扩增的严重干扰。技术特点灵敏度更高分辨率更高，可用于种水平鉴定。
2024-07-17 12:01:16
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原创 Nature子刊|超千份宏病毒组样本，告诉你如何送样
粪便免疫化学测试（FIT）是筛查结直肠癌的主要手段，直接利用FIT样本进行宏病毒组测序是否可行？
2024-07-15 10:21:05
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原创 项目文章｜Cell子刊One Earth 土壤微生物多样性与人畜致病菌的流行
农田土壤孕育了大量微生物，其中也包括对人类和动物造成威胁的条件致病菌。
2024-07-10 10:43:26
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原创 客户文章|肠道微生物群在强迫症发病中的关键作用：琥珀酸信号揭示新机制
该研究通过将强迫症患者的粪便微生物群移植至小鼠体内，诱导小鼠出现强迫症行为，改变了其肠道微生物群，并发现琥珀酸参与了强迫症的发病机制。
2024-07-05 11:40:15
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原创 揭秘微生物社区的“社交网络”：基因组规模代谢模型(GEMs)的新前沿
当前，微生物群落的基因组组成和功能潜力通过宏基因组组装基因组（MAGs）的分析得以部分揭示，但其内在的代谢网络和相互作用机制仍充满未知。
2024-06-26 10:46:23
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原创 Nature Microbiology丨VITA单细菌转录组测序技术助力深入解析奶牛瘤胃微生物组功能异质性
瘤胃微生物组一直以来都是研究相对不足但又极其复杂的微生物生态系统之一。
2024-06-17 16:12:39
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原创 Nature子刊：你的健康在出生就被肠道病毒定义了？
ELGV目录提供了早期人类肠道病毒组最全面和完整病毒数据蓝图，这将有助于未来发现儿童疾病与病毒组之间的关联。
2024-06-14 10:56:28
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原创 构建全面框架 | 简化基因组+线粒体遗传进化联合分析
该研究旨在构建一个全面的框架，以界定和识别全球性害虫——烟粉虱（Bemisia tabaci）隐种复合体内的物种。
2024-06-13 16:24:43
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原创 Microbiome | binning+转录组→首个草鱼肠道基因集目录发布啦
此研究，不仅揭示了草鱼肠道微生物群的奥秘，也为水产养殖业的绿色发展提供了新的思路。
2024-06-07 10:55:58
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原创 不服就干！FEAST微生物溯源：一场微生物“寻根究底”的浪漫之旅
解样本中这些生物体来自何处以及如何形成群落，探清微生物的源头对于理解微生物群落构建机制、优先效应以及生物安全是很必要的。
2024-06-05 15:43:21
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原创 客户文章Microbiome | 破解植物-昆虫-共生体系微生态
本研究首次揭示了家蚕通过食用桑叶，从而在其表皮上累积抗真菌细菌的机制，强调了跨界微生物转移在昆虫防御系统中的作用
2024-06-04 11:44:04
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原创 IF=82.9|肠道病毒组新发现：病毒可与宿主免疫系统直接互作
发现患哮喘风险受到宿主 TLR9 rs187084 基因变异的调节，表明噬菌体与宿主免疫系统之间存在直接相互作用。
2024-05-30 17:27:06
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原创 Nature plants|做完单细胞还可以做哪些下游验证实验
富含共生固氮基因的基因模块表明，MtFER和LYK3对共生信号具有相似的反应。进一步发现MtFER可以被LYK3磷酸化并参与根瘤菌共生。
2024-05-28 14:49:36
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空空如也
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