Saslil-CSDN博客

原创 vtk文件中的点有编号吗？这些点是如何进行编号的呢？

在上述示例中，共有6个点，编号从0开始，依次为0, 1, 2, 3, 4, 5。通过这种方式，您可以确定每个点的索引号，并在需要时使用这些编号来获取或引用特定的点数据。vtk 文件中的点是按照顺序进行编号的，每个点都有一个唯一的索引号。这些索引号是用于标识每个点在数据集中的位置，从而方便后续的处理和分析。在 vtk 文件中，POINTS 关键字通常用于指定点的数量和数据类型，后面紧跟着每个点的坐标值。每一行代表一个点的坐标，按顺序逐行排列。

2024-04-08 13:58:21 262

原创直接在记事本中打开vtk文件，如何获取其中的信息？

虽然直接在记事本中打开 vtk 文件并提取信息可能相对繁琐，但对于一些简单信息的获取仍是可行的。如果需要更加高效和自动化地处理 vtk 文件中的数据信息，建议使用编程语言（如 Python 中的 VTK 库）来进行解析和提取。提取信息：根据文件的格式和结构，您可以在文本文件中手动提取您需要的信息。您可以根据文件中的不同部分来理解文件的结构和内容，以获取相应的信息。在vtk文件中，通常包含了大量的图像数据以及对应的元数据信息。打开 vtk 文件：使用记事本或文本编辑器打开您的 vtk 文件。

2024-04-08 13:57:37 297

原创不同扫描参数的MRI图像可以放在一起分析吗？

确保选择的图像质量足够高，以减小由于不同扫描参数造成的影响。总的来说，虽然可以将不同扫描参数的MRI图像放在一起进行分析，但需要仔细考虑和处理上述因素，以确保分析结果的可靠性和准确性。数据统一：在将不同扫描参数的MRI图像放在一起进行分析之前，需要对数据进行标准化处理，以保证不同图像数据之间的可比性。校准：由于不同扫描参数可能导致图像大小、对比度等方面的差异，需要进行适当的校准以确保图像之间的匹配。数据解释：在分析时要考虑到不同扫描参数可能导致的图像特征差异，对分析结果的解释应当考虑这些因素。

2024-04-08 13:56:59 249

原创不同扫描参数的MRI图像为什么大小不一致？

切片厚度：较大的切片厚度会导致每个像素代表的组织区域更大，而较小的切片厚度则会提供更高的空间分辨率。因此，切片厚度不同会导致同一区域的MRI图像像素数量不同，进而影响图像大小。在MRI扫描过程中，医学影像技师可以根据具体需要设置不同的扫描参数，包括切片厚度、扫描间隔、矩阵大小等。扫描间隔：扫描间隔是指相邻切片之间的间隔距离。如果扫描间隔较大，那么同一区域在相邻切片之间的信息会有所缺失，从而影响图像信息的完整性和大小。较高的矩阵大小会导致更多的像素被用于表示图像，进而增加图像的大小。

2024-04-08 13:56:25 273

原创什么叫异质性？（heterogeneous）什么叫疾病亚型？（disease subtypes）

疾病亚型指的是在某种疾病范畴中，根据不同的特征或表现方式将患者分成不同的亚组或亚型。这种分类可以帮助医生更好地了解疾病的发展和治疗，从而制定更有效的个性化治疗方案。疾病亚型的确定通常需要通过对临床数据、遗传信息等多方面的综合分析来完成。疾病亚型就是属于相同的疾病但表现出不同的症状，就可以把他们分为该疾病不同的类型称之为疾病亚型。这种异质性可能涉及病因、症状表现、治疗效果等方面，影响医学实践中的个性化治疗和诊断策略。在医学诊断和治疗中，异质性指的是。

2024-04-08 13:54:05 420 1

原创为什么要进行球面配准？球面配准不会破坏大脑个体本身的特征吗？

这种配准过程可以消除头部姿势差异或解剖结构变化等因素导致的图像偏差，从而提高大脑结构和功能数据的可靠性和可比性。因此，通过球面配准，我们可以更好地理解大脑个体之间的差异和相似之处，而不是破坏它们的特征。这是因为大脑的形状是复杂且不规则的，而球面配准可以帮助将不同个体的大脑形态进行对齐，从而实现更精确的比较和分析。此外，球面配准还有助于在神经科学研究、医学诊断和治疗规划等领域中更好地理解和分析大脑结构和功能。进行球面配准并不会破坏大脑个体本身的特征，相反，它有助于更准确地保留和分析每个大脑的特征。

2024-04-08 13:52:37 179

原创 ROI到底是大脑中某些固定的区域？还是自己划分的？（比如大脑中的某一块是个整体，ROI是这块整体还是说我可以划分出这块整体中的某一块来当作ROI？）

在复杂的设计如多水平实验设计中，研究者通常很难从总激活图（overall activation map）中解析各条件的活动模式，因此可用的解决办法就是：把某个感兴趣区内每个实验条件的激活信号显示出来，或者将某实验条件的信号与其他变量的关系展示出来。ROI可以是大脑中的固定区域，例如前额叶、颞叶、杏仁核等，也可以是通过研究人员定义和划分出来的特定脑区域，用于进一步研究其活动和连接性。因此，ROI可以是大脑中的整块区域，也可以是整体区域中的一个小部分，取决于研究人员的研究兴趣和实验设计。

2024-04-08 13:51:32 477

原创体素简介，对于体素的抽象认识

下图中，每个小方块代表一个体素，体素不存在绝对空间位置的概念，只有在体空间中的相对位置，至一点和像素也是类似的。体素是组成体数据的最小单元，一个体素表示数据中三维空间某部分的值，体素相当于二维空间中像素的概念。

2024-04-08 13:50:26 170

原创关于大脑图像配准、分割，目的？操作？

（Volumetric registration）：体积配准是将不同个体或时间点获取的3D脑部影像（如MRI、CT等）进行对齐和配准的过程。常见的体积配准方法包括线性配准（如刚性配准、仿射配准）和非线性配准（如形变场配准、BSpline配准）等。这种配准方法常用于结合不同成像技术的信息，提高图像质量和信息量。（Time-series registration）：时间序列配准是将同一被试者在不同时间点获取的神经影像数据进行对齐和配准的过程，常用于跟踪个体脑部结构或功能的变化，如疾病进展、治疗效果评估等。

2024-04-08 13:49:10 308

原创 MRI图像的TI/T2加权，切片厚度，采集平面

选择不同的扫描方向可以更好地观察特定区域的解剖结构和病变情况，医生会根据不同的临床需要来选择合适的扫描方向。大脑的MRI扫描图像的扫描方向可以影响图像的空间分辨率和对比度。T2加权成像（T2WI）----突出组织T2弛豫（横向弛豫）差别。T1加权成像（T1WI）----突出组织T1弛豫（纵向弛豫）差别。采集方向影响的是坐标原点位置吗？

2024-04-08 13:48:07 617

原创 ADNI数据库T1MRI数据处理——基于freesurfer与matlab（2）

球面配准会计算一个平滑的球面变形场，驱动球面配准的特征也会被映射到对应的球面顶点上，建立不同表面之间的顶点对应关系，对组成三维大脑皮层的每一个三角形网格的顶点进行移动。首先要读取同一个被试左右半脑的表面，找到上边各个点的位置，将左脑上边的各个点分别与右脑上的全部点计算出距离，只要由一个右脑点与该左脑点的距离小于给定的阈值，那么这个左脑点就属于半脑连接处的点，反之亦然。注意偶尔使用paraview查看表面的时候会出现一些错误，这个时候大概率是合成表面的时候出错了，需要重新检查对照，再次合成。

2024-04-08 13:44:38 382

原创 ADNI数据库T1MRI数据处理——基于freesurfer与matlab（1）

更多关于freesurfer的使用信息可以在freesurfer的维基网站上进行查询，31步每一步的处理结果以及对应的文件在该维基网站上都可以找到，我们后续的研究都是基于这些数据处理步骤得到的数据信息进行研究的。在信息获取过程中受到各种因素的干扰，导致数据内容不一致，因此我们选择使用freesurfer对数据进行一键式处理。我们还可以使用freesurfer自带的看图工具freeview对freesurfer的处理结果进行查看。freesurfer必须要装载于linux系统上，安装成功的标志如图所示。

2024-04-08 13:26:31 586

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