ADNI数据库的使用与脑影像数据下载

本文详细指导如何从ADNI官网获取影像数据,包括注册账号、选择数据类型、高级搜索参数设置、筛选数据并下载至指定文件夹,以高效获取所需AD和CN群体的T1MRI数据,避免无用数据下载。
摘要由CSDN通过智能技术生成

首先找到ADNI的官网,在官网上也有一些关于数据的简介可以帮助你对ADNI数据库多一些了解,以及更加方便地找到你所需要的数据。

点击官网连接进入网站,先点击数据与样本,然后在下方找到登陆注册,进入黑色界面之后找到右上角账号登陆即可,注意若是此步骤无法点击登录是因为没有接受cookie。

若没有账号则需要申请,大概申请需要一周以内的时间,快则两三天。

按照红框标注的步骤依次选择ADNI数据库以及选择下载的数据类型——影像数据,在此界面中间的一个统计图中我们可以观察到一些关于ADNI数据库被试样本的一些信息,包括不同发病阶段、不同年龄段的人数以及对应的男女比例等等。

在选择号下载的数据库以及需要下载的数据类型之后,登录可以看到自己专属的一个数据收集库,你想要下载的数据都会被归纳到这里然后进行统一下载。看以看到搜索你想要的数据是在高级搜索的位置,而下方便是你之间整理的不同类型、不同成像参数的数据,我们需要先点击高级搜索。对了,最前方那个搜索的按钮也可以使用,但为了更加方便快捷,我们一般使用高级搜索。

在点击高级搜索之后,看以看到以下界面,以需要下载AD的患病人群和正常人群的T1MRI数据为例,我们需要注意控制几个参数,已经在下方用红框顺序标出:首先是选择ADNI的不同阶段,我们这里选择·ADNIGO/2,因为我们发现这个阶段我们需要的的类型的数据比1阶段数据稍微好些、多些,然后就是选择研究组AD\CN,对应AD患者和正常人,选择图像类型MRI,控制选择切片厚度,注意切片类型是一定要进行控制的,但是如果后续要进行配准则不需要太过重视,三个扫面方向也各有千秋,需要根据自己的用途进行限制,最后则是选择T1类型。

在最右侧用黄框标注的部分如果你在相应的位置打勾,则这项结果会在最终的搜索界面中表示出来。

在最终的搜索界面中,我们可以看到部分的信息包括切片厚度以及对应厚度的人群数量,不同年龄段的人数以及成像参数,图像描述也就是成像参数部分差距较大,部分几乎没有什么差别,要注意区分选择。在选择数据步骤建议在黄色框位置进行筛选,避免下载过多无用数据。

图中显示的两种图像描述几乎没有区别。

在选择好数据之后,可以选择将其保存在已有文件夹或者是新建一个文件夹,文件夹的所处位置就是刚刚登录就看到的那个界面,也就是数据收集板块。

在数据下载步骤,我们首先要找到需要下载数据的文件夹,在文件夹中勾选出想要下载的数据,然后现在对应的CSV文件,最后点击下载或者分段下载,两个下载按钮的区别就是一个是把所有的数据打包下载,一个是把很多数据分成很多部分同时下载没建议选择分段下载速度更快。

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ADNI 3是一个国际性的研究计划,旨在通过收集和共享来自阿尔茨海默病患者和正常老年人的临床、认知、神经影像和生物标记数据来促进阿尔茨海默病的研究。虽然ADNI 3的数据收集工作主要在国外进行,但是中国也是参与该计划的国家之一。 要下载ADNI 3的国内数据,首先需要进入ADNI官方网站(adni.loni.usc.edu)并创建一个免费的账户。然后,可以通过网站上的"Data and Sample Sharing"部分来搜索和选择特定的数据集。可以根据自己的研究需要选择临床、认知、神经影像或生物标记数据。 一旦选择了相关数据集,就可以提交一个数据请求表格,并在表格中说明自己的研究目的和计划。要下载ADNI 3的国内数据,最好选择与中国相关的数据中心或研究机构作为机构来源,并提供合理的研究计划,以增加获取数据的机会。 数据申请提交后,ADNI数据管理中心会进行审核,并根据数据可得性和数据使用的适当性来决定是否批准。一旦申请获得批准,会通过电子邮件提供下载链接或其他具体的指导信息。 需要注意的是,ADNI 3国内数据的获取可能受到一些限制和限制条件的约束,因此需要确保遵守数据使用规定并获得相关的使用许可。此外,在使用ADNI 3国内数据进行研究时,也需要遵循伦理规范和保护个人隐私的原则。 总之,下载ADNI 3国内数据需要在ADNI官方网站上注册并提交数据请求表格,同时需要选择合适的合作机构来增加获取数据的机会,并遵守相关的数据使用规定和伦理法规。
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