ADNI数据库T1MRI数据处理——基于freesurfer与matlab(1)

在从ADNI上下载得到T1MRI数据之后,我们需要对数据进行处理才能进一步使用。

在信息获取过程中受到各种因素的干扰,导致数据内容不一致,因此我们选择使用freesurfer对数据进行一键式处理。

freesurfer必须要装载于linux系统上,安装成功的标志如图所示。

对数据进行reconall命令进行31步处理,具体详情如下图:

处理完成后我们需要的数据基本就在mri和surf这两个文件夹中。

我们还可以使用freesurfer自带的看图工具freeview对freesurfer的处理结果进行查看。

更多关于freesurfer的使用信息可以在freesurfer的维基网站上进行查询,31步每一步的处理结果以及对应的文件在该维基网站上都可以找到,我们后续的研究都是基于这些数据处理步骤得到的数据信息进行研究的。

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ADNI 3是一个国际性的研究计划,旨在通过收集和共享来自阿尔茨海默病患者和正常老年人的临床、认知、神经影像和生物标记数据来促进阿尔茨海默病的研究。虽然ADNI 3的数据收集工作主要在国外进行,但是中国也是参与该计划的国家之一。 要下载ADNI 3的国内数据,首先需要进入ADNI官方网站(adni.loni.usc.edu)并创建一个免费的账户。然后,可以通过网站上的"Data and Sample Sharing"部分来搜索和选择特定的数据集。可以根据自己的研究需要选择临床、认知、神经影像或生物标记数据。 一旦选择了相关数据集,就可以提交一个数据请求表格,并在表格中说明自己的研究目的和计划。要下载ADNI 3的国内数据,最好选择与中国相关的数据中心或研究机构作为机构来源,并提供合理的研究计划,以增加获取数据的机会。 数据申请提交后,ADNI数据管理中心会进行审核,并根据数据可得性和数据使用的适当性来决定是否批准。一旦申请获得批准,会通过电子邮件提供下载链接或其他具体的指导信息。 需要注意的是,ADNI 3国内数据的获取可能受到一些限制和限制条件的约束,因此需要确保遵守数据使用规定并获得相关的使用许可。此外,在使用ADNI 3国内数据进行研究时,也需要遵循伦理规范和保护个人隐私的原则。 总之,下载ADNI 3国内数据需要在ADNI官方网站上注册并提交数据请求表格,同时需要选择合适的合作机构来增加获取数据的机会,并遵守相关的数据使用规定和伦理法规。

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