- 博客(18)
- 资源 (1)
- 问答 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 利用有效特征交互学习识别遗传变异对神经影像学表型的主效应和表观遗传效应
然而，现有的方法主要关注遗传变异的主要影响，潜在地忽视了表观遗传效应的关键作用，这解释了大脑疾病缺失的遗传性。在阿尔茨海默病神经成像倡议(ADNI)数据集上的实验结果表明，与现有方法相比，我们的MTfiSCCA方法获得了更高的典型相关系数(CCC)和更好的疾病相关生物标志物等特征选择子集。此外，MTfiSCCA揭示了与阿尔茨海默病(AD)有关的遗传变异之间可解释的表观遗传效应，为阿尔茨海默病(AD)等脑部疾病的潜在致病机制提供了新的见解。最后，我们使用ADNI数据集评估了MTfiSCCA和相关的最新方法。
2024-07-09 17:44:18
787
原创 阿尔茨海默病的基因型-蛋白相互作用和相关性建模:多组学成像遗传学研究
我们提出MT-GPIC，从基因型（SNPs）、蛋白质（Y）和成像表型（Z）的数据中，联合识别基因型-蛋白质相互作用（GPI），并展示基因型-蛋白质相关（GPC）的情况。一般来说，遗传变异和蛋白质之间的相互作用及其相关性是两种不同的生物效应，因此，对遗传成像表型的两种影响进行分离是非常有趣和必要的。U是SNP的权重，V是蛋白质的权重，Q是SNPs和蛋白质标记物之间的相互作用效应GPI的矩阵，w是表型的权重。，指的是基因和蛋白质之间的效应修饰，因为蛋白质与特定的DNA序列结合，并有助于成像表型。
2024-07-08 20:28:31
633
原创 矩阵求导Matrix Calculus
好好用啊啊啊啊啊，我之前推导两三页特别花时间，而且很多时候都因为一些地方没注意推导错。因为科研需要对各种范数求导，每次对着数学公式的参考书找的很烦啊！如果是2范数的话可以直接写成norm2，但是F范数还是要展开。发现了一个网站，很适合我这种无脑的人。ok公式好难打啊，我手写拍照得了。
2024-07-01 22:47:16
130
原创 基于神经影像数据的多模态潜在空间诱导集成SVM分类器早期痴呆诊断
具体来说，我们首先将来自不同模态的神经成像数据投影到一个潜在空间中，然后将学习到的潜在表征映射到标签空间中，以学习多个多样化的分类器。为此，我们提出了一种新的基于多模态潜在空间诱导集成SVM分类器的AD诊断框架，该框架可以在一个统一的框架内无缝地进行潜在空间学习和多种分类器学习的集成(如图1所示)。具体来说，我们首先将来自不同模式(即我们研究中的MRI和PET)的神经成像特征投射到一个共同的潜在空间中，在学习它们的潜在表征的同时利用跨模式的相关性。（我只想知道缺失数据的处理方法，所以是挑着写的）
2024-07-01 22:35:24
560
1
原创 通过自适应稀疏多视图典型相关分析识别基因组、蛋白质组和成像生物标志物之间的关联
Identifying associations among genomic, proteomic and imaging biomarkers via adaptive sparse multi-view canonical correlation analysis源代码：GitHub - dulei323/AdaSMCCA: Adaptive Sparse Multi-view Canonical Correlation Analysis.Abstract：为了揭示大脑疾病的遗传基础，大
2024-06-06 21:19:10
2097
2
原创 Causality Inspired Representation Learning for Domain Generalization
已经提出了许多基于因果关系的方法来获得不变的因果机制[12，56，61]或恢复因果特征[5，10，27，47]，从而提高OOD的泛化能力。为了提高泛化能力，已经提出了许多DG方法，这些方法可以大致分为不变表示学习[9，22，25，34]，域增强[53，59，63，66]，元学习[2，6，21]等。不幸的是，我们不能直接将原始输入分解为X = f（S，U），因为因果/非因果因素通常是不可观察的，并且无法用公式表示，这使得因果推理特别具有挑战性[51，55]。假设[23，24，30]。
2024-06-04 11:25:19
928
原创 新手处理ADNI的gene expression数据记录贴【不是教程贴！！处理过程不可信！！】
我选择的是保留第一次出现的探针，然后再筛选出数量大于或等于100的，最后的结果只有10136个探针。论文里面用的是相同的基因的中值。网上根本没有什么教程，果然读研全靠自学。不想处理了，感觉就是自己瞎搞。
2024-05-22 11:24:30
231
原创 运行代码提示could not find function “gwasvcf_to_TwoSampleMR“
一直以为gwasglue和gwasglue2是一个东西，包里面下好了gwasglue2，但是没有gwasglue。下载gwasglue包。
2024-03-15 11:38:30
1050
8
原创 【使用zotero点击参考文献就会分成上下两个屏】
使用zotero的时候，点击参考文献就会分成上下两个屏，而且新开的下面的内容也不能关闭。
2024-03-05 11:13:59
1370
5
原创 双显示屏鼠标卡顿的问题
换了双显示屏，主屏在右边，副屏在左边，但是把主屏的东西拖到副屏上总是卡顿。从主屏的左边拖过去会很卡，但是从主屏的右边拖过去就很丝滑。
2024-02-27 10:35:56
1463
湘菜介绍前端实现代码，有四个界面，实现了响应式开发
2022-06-30
每个连续子序列都有一个唯一值
2021-05-15
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人