ADNI数据集几个使用小技巧 【1】

最新推荐文章于 2024-04-08 13:15:25 发布
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分类专栏： AD research 文章标签： ADNI Alzheimer image process 老年痴呆 影像处理
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ADNI数据集

ADNI数据集乍一看，都是英文，有点儿发蒙。千万不要着急，慢慢来。我看具体介绍它的文章并不多，下面介绍一下它的使用。

首先要注册

其次要下载数据，弄清楚是下载raw数据，还是processed数据

不管是哪种情况都要选择此项
若是只是想查找raw数据，可以选择第一个，如下：
在这里插入图片描述
我看我们实验室的小伙伴是选择的第二项“Advanced Search (beta)”做研究的，因为这里面包含了已经进行预处理的图像，这样就可以减轻后续的工作量。如下：
在这里插入图片描述

最低0.47元/天 解锁文章
qq_27196755
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专栏目录
ADNI数据集：.nii格式转换为.png格式
01-06
ADNI数据集：.nii格式转换为.png格式 1、共有AD_001-AD_015共15个.nii文件 分别查看每个文件的详细信息，以得到shape维度信息 import nibabel as nib file = 'D:\\图像分割\\AD\\AD_015\\AD_015.nii' #你的nii或者nii.gz文件路径 img = nib.load(file) print(img) 2、通过查看得到每个文件都为四维，只是大小不同 开始进行格式转换 import os import numpy as np import nibabel as nib import imageio im
ADNI-MRI-PET-ANALYSIS
爱学习的卡比兽
04-09 1173
ADNI MRI && PET 分析
ADNI数据库的使用与脑影像数据下载
Saslil的博客
04-08 831
在数据下载步骤，我们首先要找到需要下载数据的文件夹，在文件夹中勾选出想要下载的数据，然后现在对应的CSV文件，最后点击下载或者分段下载，两个下载按钮的区别就是一个是把所有的数据打包下载，一个是把很多数据分成很多部分同时下载没建议选择分段下载速度更快。在最终的搜索界面中，我们可以看到部分的信息包括切片厚度以及对应厚度的人群数量，不同年龄段的人数以及成像参数，图像描述也就是成像参数部分差距较大，部分几乎没有什么差别，要注意区分选择。若没有账号则需要申请，大概申请需要一周以内的时间，快则两三天。
ADNI数据集下载（详细）
热门推荐
蜗牛遥遥
02-20 2万+
刚刚接触到这个数据集的时候比较头疼，用了好长的时间才把下载过程和预处理过程弄明白。需要发送电子邮件给官方平台，收到回信后才能够下载到数据集。 1、ADNI账号注册 第一步：搜索百度打开ADNI 第二步，点击ADTA&SAMPLES 第三步：一直将鼠标往下拉 点击ADNI，进入里面填写信息。需要填写的信息还是挺多的，耐心填写，再等到邮件回复就可以了 2、ADNI数据集下载 登录申请的邮...
手把手式介绍 ADNI 影像数据下载
永远想不起来更新的博客
06-19 7359
1.搜索 1.1登录 打开ADNI的官网：http://adni.loni.usc.edu/，进入下面的界面。 点击 DATA&SMPLES 下的 ACCESS DATA AND SAMPLES，如下图。 页面跳转以后点击中间的“LOGIN”，这时会跳出一个新的界面，然后在右上角输入自己的帐号、密码即可。如果没有权限可以跳转到第2部分看看如何申请权限。 登录以后选择DOWNLOAD下的 Image Collections就是搜索下载影像数据，其他还有一些学习测试数据和遗传数据。 1.2 sea
ADNI影像数据解析及下载
wall
05-06 5615
Tips：权限申请：访问 ADNI官网 根据提示按部就班来，不麻烦，一般几天就会发邮件审核通过，网上也有很多写申请教程的博客，可以搜来看看。 快速索引数据集下载0 概览1 筛选数据集1.1 自定义筛选 - Advanced Search1.2 ADNI共享数据集 - Data Collections2 下载数据集数据初步处理可视化处理数据加载数据预处理 数据集下载 0 概览 登录状态下访问官网： 点击红框指示部分后，进入如下界面： 继续点击选中部分： search：初级搜索 Advanced Sea
影像数据库 | ADNI数据下载/分析
Tregs的博客
03-26 8214
师傅，别念了！！！
ADNI数据集使用python批量将nii.gz文件转为.png
m0_64111502的博客
07-10 736
介绍了ADNI数据集的数据格式转换
ADNI介绍与数据下载
C_abbage的博客
06-28 1万+
目录ADNI介绍1.About ADN2.fMRI数据3.各分组介绍4.相关文件5.注意事项网站下载数据下载方式 ADNI介绍 1.About ADN 阿尔茨海默病神经影像学计划 (ADNI) 是一项纵向多中心研究，旨在开发临床、成像、遗传和生化生物标志物，用于阿尔茨海默病 (AD) 的早期检测和跟踪。自十多年前推出以来，这一具有里程碑意义的公私合作伙伴关系为 AD 研究做出了重大贡献，实现了世界各地研究人员之间的数据共享。 最初的五年研究 (ADNI-1) 在 2009 年通过大机会补助金 (ADNI-G
ADNI挑选有意义的数据进行下载 【2】
qq_27196755的博客
06-27 4214
#ADNI数据集本身提供处理过的图片# 有一篇论文“Non-White Matter Tissue Extraction and Deep Convolutional Neural Network for Alzheimer’s Disease Detection ”中涉及到的预处理的数据如下： “We use the FDG-PET and MRI data downloaded from AD...
ADNI数据集下载（详细）-附件资源
03-02
ADNI数据集下载（详细）-附件资源
基于Python使用3D 卷积神经网络和 ADNI 数据集的阿尔兹海默智能诊断 Web 应用
最新发布
07-01
【作品名称】：基于Python使用3D 卷积神经网络和 ADNI 数据集的阿尔兹海默智能诊断 Web 应用 【适用人群】：适用于希望学习不同技术领域的小白或进阶学习者。可作为毕设项目、课程设计、大作业、工程实训或初期...
ADNI数据集下载（详细）-附件资源，包含下载地址
10-18
阅读建议： 下载ADNI数据集之前，建议详细了解ADNI项目和数据使用协议。此外，学者和研究人员可以探索数据集的不同部分，包括临床、影像和遗传数据。建议参考项目文档和相关研究，以更好地理解如何使用这些数据进行...
ADNI数据集-数据分析11.17
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11-19 3112
4850名认知正常/正常衰老老年人(CN)，CN参与者是ADNI研究中的对照受试者，他们没有表现出抑郁，轻微认知障碍或痴呆的迹象。2968名早期轻度认知障碍患者(EMCI)，5236名晚期轻度认知障碍患者(LMCI)，1738名阿尔兹海默症。1416名重要记忆关注/主观记忆疾病(SMC)，解决健康老年人对照组与MCI之间的差距。是“Relative IDentifier”的英文缩写，相对标识符的意思；colprot origprot 和蛋白有关的医学术语；是医学研究上经常使用的数据集；
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qq_41238579的博客
12-01 2185
ANDI 涉及到的数据集包括临床数据 Clinical Data（临床数据）：临床数据集由每个科目的临床信息组成，包括招募，人口统计学，体格检查和认知评估数据。该数据集还包括这些生物标志物的 csf 浓度和比率数据：tau，ab1-42和p-tau181p（csf 中的化学物质）。可以将整套临床数据批量下载为逗号分隔值（csv）文件。 在哪下载呢？ 就是download里面的study data 是不是很全！ 它下载得到一个cvs文件，是所有被试的。 临床数据怎么和Image数据匹配，还在研究。 应该
ADNI数据集阅读整理
Sungden的博客
01-08 1万+
因为科研需要，接触了ADNI数据库，但数据库庞大复杂，不容易看懂，网上相关介绍很少，不利于广大小白入门，自己也因此花了大量时间在认识数据上面。为方便交流，特作此博客，以襄后者。 要使用ADNI数据，首先需要注册，等几天之后，管理员会发邮件让你激活，这样就可以登录了。 点击download，选择image collections 点击other shared colle
ADNI数据集相关知识整理
qq_43799110的博客
12-01 2375
参考博文：https://blog.csdn.net/qq_27196755/article/details/93889868 该博文讲了如何选取同一受试者的PET及MRI数据，及ADNI数据库的基本概念 ADNI数据以Nifti格式下载后，经过SPM处理（无论是fMRI还是MRI）最后获得的图像很模糊。 解决方法： 1、下载DICOM格式的图像，经过转换为Nifti格式，再用SPM处理 2、直接...
ADNI数据集介绍
weixin_43444314的博客
05-28 2万+
http://blog.sciencenet.cn/blog-1969089-1046865.html (1)ADNI 1: 开发改进的方法，为获取老年痴呆症(AD)、轻度认知障碍(MCI)和老年人对照患者的纵向、多位点MRI和PET数据制定统一标准 获得一般可访问的数据仓库，描述大脑结构和代谢的纵向变化，以及临床/认知和生物标志物数据，以验证影像学替代物 在涉及这些患者的试验中，开发出能够最大限...
adni数据集预处理
09-09
adni数据集的预处理包括强度归一化和强度裁剪。 引用中的代码可以用于执行这些处理步骤。首先，通过使用nibabel库中的nib.load函数加载nifti格式的数据，并使用nifti_to_numpy函数将其转换为numpy数组。然后，使用normalization函数对数据进行强度归一化，即将数据减去均值并除以标准差。最后，使用clip函数将强度裁剪到指定的范围内，例如-1到2.5之间。通过循环遍历文件夹中的所有.nii文件，并对每个文件进行相同的处理步骤，可以将数据保存为.npy文件。通过运行该代码，可以对adni数据集进行预处理。

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