在NCBI的网页窗口使用Blast进行比对 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
(这是新的Blast主页 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastHomeNew)
我用的比对的序列:
>TRINITY_DN34_c0_g1_i1 len=278 path=[256:0-277] [-1, 256, -2]
TGGCGCGCGGTATCATCGGTGCTAAGGCCGATCCAGTTAACTTTGCTGGTATTGGCGGTG
CCGCTTACGAATACAACTACACTGCTACTGGTTCCTTTAATCAATCTATCATGCCTGCTA
ACTTTACTCCTGCTGGCGGCATCGATACTAATGATAGCAGCCCTACTTATCACCCTTTCA
GTGACTTTGACTACCAGTCCTTGTCTCTCGCTCTATACCACGAGTACATCGAGTATGACC
TCTTCAACTACGGTCTCACTAAATTCTCTGATACCGAG
下面是Nr注释的结果: