赋能医学影像,AI助力智能化辅助诊断,基于YOLOv8全系列【n/s/m/l/x】参数模型开发构建磁共振成像、CT扫描场景下医学图像脑肿瘤检测识别系统

在医学的浩瀚星空中,肿瘤与癌症等复杂疾病如同夜空中最难以捉摸的星辰,它们的发现与诊断往往依赖于高精度、高灵敏度的医学影像技术,如核磁共振(MRI)和计算机断层扫描(CT)等。这些技术如同现代医学的“火眼金睛”,能够穿透人体,揭示出隐藏在内部的疾病秘密。然而,传统的医学影像分析却面临着诸多挑战:高度依赖专家的主观判断、经验门槛高、分析过程耗时耗力,以及时效性不足等问题,这些都成为了制约医疗服务质量与效率提升的瓶颈。

随着人工智能(AI)技术的飞速发展,一场深刻的医疗变革正在悄然发生。AI以其强大的数据处理能力、学习能力和模式识别能力,为医学影像分析带来了前所未有的机遇。在医学影像领域,AI技术的应用不仅有望解决上述难题,更将推动疾病诊断向更加精准、高效、智能的方向迈进。医学影像数据是医疗大数据的重要组成部分,其海量、多维、复杂的特点为AI模型的训练提供了丰富的素材。通过深度学习等先进算法,AI可以从海量的影像数据中学习并提取出疾病特有的特征模式,进而构建出智能化的检测识别模型。这些模型能够自动分析影像,快速准确地识别出异常区域,为医生提供初步的诊断建议,极大地提高了诊断的效率和准确性。AI在医学影像分析中的应用,使得医生能够借助智能系统快速筛选出疑似病例,减轻了他们的工作负担,同时也降低了人为因素导致的误诊和漏诊风险。医生可以将更多精力集中在复杂病例的深入分析和治疗方案的制定上,从而提高了整体医疗服务的质量。此外,AI系统的实时性和远程服务能力,使得患者能够更快地获得诊断结果,尤其是对于偏远地区的患者而言,这无疑是巨大的福音。

本文从这样的背景出发,想要基于基础的实验尝试来开发构建医学影像场景下的智能化检测识别模型,在前面的系列博文中我们已经进行了相关的开发实践,感兴趣的话可以自行移步阅读即可:

《赋能医学影像,AI助力智能化辅助诊断,基于YOLOv3全系列【yolov3tiny/yolov3/yolov3spp】参数模型开发构建磁共振成像、CT扫描场景下医学图像脑肿瘤检测识别系统》

《赋能医学影像,AI助力智能化辅助诊断,基于YOLOv5全系列【n/s/m/l/x】参数模型开发构建磁共振成像、CT扫描场景下医学图像脑肿瘤检测识别系统》

《赋能医学影像,AI助力智能化辅助诊断,基于YOLOv7全系列【tiny/l/x】参数系列模型开发构建磁共振成像、CT扫描场景下医学图像脑肿瘤检测识别系统》

本文主要是想要基于经典的YOLOv8全系列的参数模型来进行相应的开发实践,首先看下实例效果:

简单看下实例数据:

如果对YOLOv8开发构建自己的目标检测项目有疑问的可以看下面的文章,如下所示:

《基于YOLOv8开发构建目标检测模型超详细教程【以焊缝质量检测数据场景为例】》

非常详细的开发实践教程。本文这里就不再展开了,因为从YOLOv8开始变成了一个安装包的形式,整体跟v5和v7的使用差异还是比较大的。

YOLOv8核心特性和改动如下:
1、提供了一个全新的SOTA模型(state-of-the-art model),包括 P5 640 和 P6 1280 分辨率的目标检测网络和基于YOLACT的实例分割模型。和 YOLOv5 一样,基于缩放系数也提供了 N/S/M/L/X 尺度的不同大小模型,用于满足不同场景需求
2、骨干网络和 Neck 部分可能参考了 YOLOv7 ELAN 设计思想,将 YOLOv5 的 C3 结构换成了梯度流更丰富的 C2f 结构,并对不同尺度模型调整了不同的通道数,属于对模型结构精心微调,不再是一套参数应用所有模型,大幅提升了模型性能。
3、Head 部分相比 YOLOv5 改动较大,换成了目前主流的解耦头结构,将分类和检测头分离,同时也从Anchor-Based 换成了 Anchor-Free
4、Loss 计算方面采用了TaskAlignedAssigner正样本分配策略,并引入了Distribution Focal Loss
5、训练的数据增强部分引入了 YOLOX 中的最后 10 epoch 关闭 Mosiac 增强的操作,可以有效地提升精度

官方项目地址在这里,如下所示:

目前已经收获超过2.6w的star量了。

官方提供的基于COCO数据集的预训练模型如下所示:

Modelsize
(pixels)
mAPval
50-95
Speed
CPU ONNX
(ms)
Speed
A100 TensorRT
(ms)
params
(M)
FLOPs
(B)
YOLOv8n64037.380.40.993.28.7
YOLOv8s64044.9128.41.2011.228.6
YOLOv8m64050.2234.71.8325.978.9
YOLOv8l64052.9375.22.3943.7165.2
YOLOv8x64053.9479.13.5368.2257.8

另外一套预训练模型如下:

Modelsize
(pixels)
mAPval
50-95
Speed
CPU ONNX
(ms)
Speed
A100 TensorRT
(ms)
params
(M)
FLOPs
(B)
YOLOv8n64018.4142.41.213.510.5
YOLOv8s64027.7183.11.4011.429.7
YOLOv8m64033.6408.52.2626.280.6
YOLOv8l64034.9596.92.4344.1167.4
YOLOv8x64036.3860.63.5668.7260.6

是基于Open Image V7数据集构建的,可以根据自己的需求进行选择使用即可。

除了常规的目标检测任务之外,还有旋转目标检测,如下:

Modelsize
(pixels)
mAPtest
50
Speed
CPU ONNX
(ms)
Speed
A100 TensorRT
(ms)
params
(M)
FLOPs
(B)
YOLOv8n-obb102478.0204.773.573.123.3
YOLOv8s-obb102479.5424.884.0711.476.3
YOLOv8m-obb102480.5763.487.6126.4208.6
YOLOv8l-obb102480.71278.4211.8344.5433.8
YOLOv8x-obb102481.361759.1013.2369.5676.7

是基于DOTAv1数据集训练得到的。

YOLOv8的定位不仅仅是目标检测,而是性能强大全面的工具库,故而在任务类型上同时支持:姿态估计、检测、分类、分割、跟踪多种类型,可以根据自己的需要进行选择使用,这里就不再详细展开了。

简单的实例实现如下所示:

from ultralytics import YOLO
 
# yolov8n
model = YOLO('yolov8n.yaml').load('yolov8n.pt')  # build from YAML and transfer weights
model.train(data='data/self.yaml', epochs=100, imgsz=640)
 
 
# yolov8s
model = YOLO('yolov8s.yaml').load('yolov8s.pt')  # build from YAML and transfer weights
model.train(data='data/self.yaml', epochs=100, imgsz=640)
 
 
# yolov8m
model = YOLO('yolov8m.yaml').load('yolov8m.pt')  # build from YAML and transfer weights
model.train(data='data/self.yaml', epochs=100, imgsz=640)
 
 
# yolov8l
model = YOLO('yolov8l.yaml').load('yolov8l.pt')  # build from YAML and transfer weights
model.train(data='data/self.yaml', epochs=100, imgsz=640)
 
 
# yolov8x
model = YOLO('yolov8x.yaml').load('yolov8x.pt')  # build from YAML and transfer weights
model.train(data='data/self.yaml', epochs=100, imgsz=640)

这里我们依次选择n、s、m、l和x五款不同参数量级的模型来进行开发。

这里给出yolov8的模型文件如下:

# Parameters
nc: 2  # number of classes
scales: # model compound scaling constants, i.e. 'model=yolov8n.yaml' will call yolov8.yaml with scale 'n'
  # [depth, width, max_channels]
  n: [0.33, 0.25, 1024]  # YOLOv8n summary: 225 layers,  3157200 parameters,  3157184 gradients,   8.9 GFLOPs
  s: [0.33, 0.50, 1024]  # YOLOv8s summary: 225 layers, 11166560 parameters, 11166544 gradients,  28.8 GFLOPs
  m: [0.67, 0.75, 768]   # YOLOv8m summary: 295 layers, 25902640 parameters, 25902624 gradients,  79.3 GFLOPs
  l: [1.00, 1.00, 512]   # YOLOv8l summary: 365 layers, 43691520 parameters, 43691504 gradients, 165.7 GFLOPs
  x: [1.00, 1.25, 512]   # YOLOv8x summary: 365 layers, 68229648 parameters, 68229632 gradients, 258.5 GFLOPs
 
# YOLOv8.0n backbone
backbone:
  # [from, repeats, module, args]
  - [-1, 1, Conv, [64, 3, 2]]  # 0-P1/2
  - [-1, 1, Conv, [128, 3, 2]]  # 1-P2/4
  - [-1, 3, C2f, [128, True]]
  - [-1, 1, Conv, [256, 3, 2]]  # 3-P3/8
  - [-1, 6, C2f, [256, True]]
  - [-1, 1, Conv, [512, 3, 2]]  # 5-P4/16
  - [-1, 6, C2f, [512, True]]
  - [-1, 1, Conv, [1024, 3, 2]]  # 7-P5/32
  - [-1, 3, C2f, [1024, True]]
  - [-1, 1, SPPF, [1024, 5]]  # 9
 
# YOLOv8.0n head
head:
  - [-1, 1, nn.Upsample, [None, 2, 'nearest']]
  - [[-1, 6], 1, Concat, [1]]  # cat backbone P4
  - [-1, 3, C2f, [512]]  # 12
 
  - [-1, 1, nn.Upsample, [None, 2, 'nearest']]
  - [[-1, 4], 1, Concat, [1]]  # cat backbone P3
  - [-1, 3, C2f, [256]]  # 15 (P3/8-small)
 
  - [-1, 1, Conv, [256, 3, 2]]
  - [[-1, 12], 1, Concat, [1]]  # cat head P4
  - [-1, 3, C2f, [512]]  # 18 (P4/16-medium)
 
  - [-1, 1, Conv, [512, 3, 2]]
  - [[-1, 9], 1, Concat, [1]]  # cat head P5
  - [-1, 3, C2f, [1024]]  # 21 (P5/32-large)
 
  - [[15, 18, 21], 1, Detect, [nc]]  # Detect(P3, P4, P5)

囊括了五款不同参数量级的模型。在训练结算保持相同的参数设置,等待训练完成后我们横向对比可视化来整体对比分析。

【Precision曲线】
精确率曲线(Precision Curve)是一种用于评估二分类模型在不同阈值下的精确率性能的可视化工具。它通过绘制不同阈值下的精确率和召回率之间的关系图来帮助我们了解模型在不同阈值下的表现。
精确率(Precision)是指被正确预测为正例的样本数占所有预测为正例的样本数的比例。召回率(Recall)是指被正确预测为正例的样本数占所有实际为正例的样本数的比例。
绘制精确率曲线的步骤如下:
使用不同的阈值将预测概率转换为二进制类别标签。通常,当预测概率大于阈值时,样本被分类为正例,否则分类为负例。
对于每个阈值,计算相应的精确率和召回率。
将每个阈值下的精确率和召回率绘制在同一个图表上,形成精确率曲线。
根据精确率曲线的形状和变化趋势,可以选择适当的阈值以达到所需的性能要求。
通过观察精确率曲线,我们可以根据需求确定最佳的阈值,以平衡精确率和召回率。较高的精确率意味着较少的误报,而较高的召回率则表示较少的漏报。根据具体的业务需求和成本权衡,可以在曲线上选择合适的操作点或阈值。
精确率曲线通常与召回率曲线(Recall Curve)一起使用,以提供更全面的分类器性能分析,并帮助评估和比较不同模型的性能。

【Recall曲线】
召回率曲线(Recall Curve)是一种用于评估二分类模型在不同阈值下的召回率性能的可视化工具。它通过绘制不同阈值下的召回率和对应的精确率之间的关系图来帮助我们了解模型在不同阈值下的表现。
召回率(Recall)是指被正确预测为正例的样本数占所有实际为正例的样本数的比例。召回率也被称为灵敏度(Sensitivity)或真正例率(True Positive Rate)。
绘制召回率曲线的步骤如下:
使用不同的阈值将预测概率转换为二进制类别标签。通常,当预测概率大于阈值时,样本被分类为正例,否则分类为负例。
对于每个阈值,计算相应的召回率和对应的精确率。
将每个阈值下的召回率和精确率绘制在同一个图表上,形成召回率曲线。
根据召回率曲线的形状和变化趋势,可以选择适当的阈值以达到所需的性能要求。
通过观察召回率曲线,我们可以根据需求确定最佳的阈值,以平衡召回率和精确率。较高的召回率表示较少的漏报,而较高的精确率意味着较少的误报。根据具体的业务需求和成本权衡,可以在曲线上选择合适的操作点或阈值。
召回率曲线通常与精确率曲线(Precision Curve)一起使用,以提供更全面的分类器性能分析,并帮助评估和比较不同模型的性能。

【mAP0.5】
mAP0.5,也被称为mAP@0.5或AP50,指的是当Intersection over Union(IoU)阈值为0.5时的平均精度(mean Average Precision)。IoU是一个用于衡量预测边界框与真实边界框之间重叠程度的指标,其值范围在0到1之间。当IoU值为0.5时,意味着预测框与真实框至少有50%的重叠部分。
在计算mAP0.5时,首先会为每个类别计算所有图片的AP(Average Precision),然后将所有类别的AP值求平均,得到mAP0.5。AP是Precision-Recall Curve曲线下面的面积,这个面积越大,说明AP的值越大,类别的检测精度就越高。
mAP0.5主要关注模型在IoU阈值为0.5时的性能,当mAP0.5的值很高时,说明算法能够准确检测到物体的位置,并且将其与真实标注框的IoU值超过了阈值0.5。

【mAP0.5:0.95】
mAP0.5:0.95,也被称为mAP@[0.5:0.95]或AP@[0.5:0.95],表示在IoU阈值从0.5到0.95变化时,取各个阈值对应的mAP的平均值。具体来说,它会在IoU阈值从0.5开始,以0.05为步长,逐步增加到0.95,并在每个阈值下计算mAP,然后将这些mAP值求平均。
这个指标考虑了多个IoU阈值下的平均精度,从而更全面、更准确地评估模型性能。当mAP0.5:0.95的值很高时,说明算法在不同阈值下的检测结果均非常准确,覆盖面广,可以适应不同的场景和应用需求。
对于一些需求比较高的场合,比如安全监控等领域,需要保证高的准确率和召回率,这时mAP0.5:0.95可能更适合作为模型的评价标准。
综上所述,mAP0.5和mAP0.5:0.95都是用于评估目标检测模型性能的重要指标,但它们的关注点有所不同。mAP0.5主要关注模型在IoU阈值为0.5时的性能,而mAP0.5:0.95则考虑了多个IoU阈值下的平均精度,从而更全面、更准确地评估模型性能。

【loss曲线】

在深度学习的训练过程中,loss函数用于衡量模型预测结果与实际标签之间的差异。loss曲线则是通过记录每个epoch(或者迭代步数)的loss值,并将其以图形化的方式展现出来,以便我们更好地理解和分析模型的训练过程。

【F1值曲线】
F1值曲线是一种用于评估二分类模型在不同阈值下的性能的可视化工具。它通过绘制不同阈值下的精确率(Precision)、召回率(Recall)和F1分数的关系图来帮助我们理解模型的整体性能。
F1分数是精确率和召回率的调和平均值,它综合考虑了两者的性能指标。F1值曲线可以帮助我们确定在不同精确率和召回率之间找到一个平衡点,以选择最佳的阈值。
绘制F1值曲线的步骤如下:
使用不同的阈值将预测概率转换为二进制类别标签。通常,当预测概率大于阈值时,样本被分类为正例,否则分类为负例。
对于每个阈值,计算相应的精确率、召回率和F1分数。
将每个阈值下的精确率、召回率和F1分数绘制在同一个图表上,形成F1值曲线。
根据F1值曲线的形状和变化趋势,可以选择适当的阈值以达到所需的性能要求。
F1值曲线通常与接收者操作特征曲线(ROC曲线)一起使用,以帮助评估和比较不同模型的性能。它们提供了更全面的分类器性能分析,可以根据具体应用场景来选择合适的模型和阈值设置。

综合实验对比来看:五款不同参数量级的模型最终没有拉开明显的间隔,n、s两个系列的模型效果相近,m系列模型效果居中,次于其余两款模型,l系列模型效果优于m系列模型,x系列模型效果则最优,综合考虑最终选择使用m系列的模型作为最终的线上推理模型。

接下来看下m系列模型的结果详情。

【离线推理实例】

【热力图实例】

【Batch实例】

【混淆矩阵】

【F1值曲线】

【Precision曲线】

【PR曲线】

【Recall曲线】

【训练可视化】

时代的浪潮在滚滚向前,拥抱科技时代带来的领域变革。展望未来,随着AI技术的不断成熟和医学影像数据的持续积累,AI在医学影像分析中的应用将更加广泛和深入。我们可以预见,未来的医学影像分析将实现全自动化、智能化和个性化,为医生提供更加全面、精准的诊断支持。同时,AI还将与其他医疗技术如基因测序、机器人手术等相结合,共同推动医疗行业的全面升级和转型。AI技术正以前所未有的速度和力量改变着医学影像分析的面貌,为疾病的早期发现、精准诊断和治疗提供了强有力的支持。在这场医疗变革的浪潮中,我们有理由相信,AI将成为推动医学进步的重要力量,引领我们迈向一个更加健康、美好的未来。

  • 24
    点赞
  • 6
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

Together_CZ

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值