周报第十八周

周报第十八周

学习时间

入门第十八周：2023.9.4-2023.9.10

本周进度

1.阅读了一篇关于单细胞解卷积的论文《scMD-cell type deconvolution using single-cell DNA methylation references》,这篇文章用到了R,所以学习了部分R语言。
2.阅读了小部分周老师的《Single-cell DNA Methylome and 3D Multi-omic Atlas of the Adult Mouse Brain》论文。
3.复习深度学习。

本周问题

1.论文的代码部分用R语言写的，不太清楚需不需要学习R。
2.论文的缩写很多，有些缩写是上下文中没有的，阅读论文会比较吃力。
3.论文中单个句子能看懂，但是一旦联系上下文就比较难以理解了。可能是和不清楚此方向的具体研究内容有关，因此在理解论文上有问题。

下周计划

1.完成R语言数据处理的学习，并用R语言跑一下阅读的论文的模型。
2.阅读SCMD论文时用到该作者以前的EnsDeconv技术，此技术的相关论文是《Robust and accurate estimation of cellular fraction fromtissue omics data via ensemble deconvolution》，下周将会进行学习并争取将此模型跑起来。
3.如果还有时间将继续学习周老师的《Single-cell DNA Methylome and 3D Multi-omic Atlas of the Adult Mouse Brain》。