周报第二十周
学习时间
周报第二十周:2023.9.18-2023.9.24
本周进度
1.阅读了Adien et.在2009发表的关于Hi-C数据集的论文《Comprehensive mapping of long range interactions reveals》以及关于Rao et.在2014年发表的关于situ Hi-C数据集的论文《A three-dimensional map of the human genome at kilobase》。
2.增进了关于Hi-C数据集中关于heat map以及基因三维排列方式的理解。
下周计划
1.复习Hi-C数据集数据处理的Higashi的论文《Multiscale and integrative single-cell Hi-C
analysis with Higashi》以及situ hi-C处理的论文《A three-dimensional map of the human genome at kilobase》。
2.学习fast Higashi论文《Ultrafast and interpretable single-cell 3D genome analysis with Fast-Higashi》。