周报第二十六周

周报第二十六周

学习时间

周报第二十六周：2023.10.30-2023.11.5

本周进度

1.学习了review《The 3D Genome Structure ofSingle Cells》,该论文主要是对此方向的一个总结性内容，读完此论文后对这个方向有了更深的了解。经典的workflow是sequence-aligenment-filter-dimensionality reduction-cluster/imputation/model-downstream analysis。如下图所示。

2.学习了周导的论文《Robust single-cell Hi-C clustering by convolution- andrandom-walk–based imputation》,了解了Schicluster算法，以及其中的RWR算法。

下周计划

1.学习最新的review《Computational methods for analysing multiscale 3D genome organization》
2.学习schicluster算法