手撕 BiLSTM-CRF

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网上关于BiLSTM-CRF的资料可谓汗牛充栋;但是扎扎实实给出每一步推导(不跳跃),并结合每一行代码(包括每处张量运算的注释)的文章,至今未见

所以,关于【BiLSTM-CRF的推导和代码部分】你看到的可能是迄今为止最扎实的一个版本

注:我假设你已经熟悉了BiLSTM和CRF的基本原理; 否则,请先【大致浏览】以下材料

CRF: http://homepages.inf.ed.ac.uk/csutton/publications/crftut-fnt.pdf
LSTM: https://colah.github.io/posts/2015-08-Understanding-LSTMs/
BiLSTM-CRF原文: https://arxiv.org/pdf/1508.01991v1.pdf

零、Introduction

本文要介绍的是NLP序列标注领域近年来最经典的文章,百度研究院出品的《Bidirectional LSTM-CRF Models for Sequence Tagging》

本文专注于"手撕"这个模型的【代码和推导细节】,所有背景知识一概省略

一、路线图

Talk is cheap, 直接看代码
链接: https://gist.github.com/koyo922/9300e5afbec83cbb63ad104d6a224cf4

简化解构如下, 我会大致按照执行顺序来讲解:

  • 1 从__main__入手;了解主流程,即构造训练数据集和模型对象

  • 2 模型训练
    其中涉及求loss neg_log_likelihood()
    CRF的分子_score_sentence();
    CRF的分母_forward_alg(); 顺便介绍用到的log_sum_exp()

  • 3 模型推断, 就是前向运算 forward()
    其中涉及维特比解码_viterbi_decode()

def log_sum_exp(smat): # 模型中经常用到的一种路径运算的实现
    ...

class BiLSTM_CRF(nn.Module):
    def neg_log_likelihood(self, words, tags):  # 求负对数似然,作为loss
        ...

    def _score_sentence(self, frames, tags): # 求路径pair: frames->tags 的分值
        ...

    def _forward_alg(self, frames): # 求CRF中的分母"Z", 用于loss
        ...

    def _viterbi_decode(self, frames): # 求最优路径分值 和 最优路径
        ...

    def forward(self, words):  # 模型inference逻辑
        ...

if __name__ == "__main__":
    training_data = [...] # 准备好训练数据和模型
    model = BiLSTM_CRF(...)
    ...

    optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=1e-4)
    for epoch in range(300): # 训练300个epoch
        for words, tags in training_data:
            model.zero_grad()
            model.neg_log_likelihood(words, tags).backward()
            optimizer.step()

    # 观察训练后的inference结果
    with torch.no_grad(): print(model(training_data[0][0]))

二、参数估计(Parameter Estimation)

沿着执行顺序看,__main__下面的主流程就是构造训练数据集和模型对象,然后训练,然后推断;不多说。

看训练逻辑
https://gist.github.com/koyo922/9300e5afbec83cbb63ad104d6a224cf4#file-bilstm_crf-py-L78-L83

def neg_log_likelihood(self, words, tags):  # 求一对 <sentence, tags> 在当前参数下的负对数似然,作为loss
    frames = self._get_lstm_features(words)  # emission score at each frame
    gold_score = self._score_sentence(frames, tags)  # 正确路径的分数
    forward_score = self._forward_alg(frames)  # 所有路径的分数和
    # -(正确路径的分数 - 所有路径的分数和);注意取负号 -log(a/b) = -[log(a) - log(b)] = log(b) - log(a)
    return forward_score - gold_score
  • 首先使用LSTM求出了每一帧对应到每种tag的"发射【分值】矩阵" frames(注意不是【概率】!!! ,这里加起来和不为1;注意CRF跟HMM/MEMM的区别)

  • 然后,基于frames和当前的CRF层参数,可以求出指定隐状态路径tags对应的分值gold_score
    然后,不限定隐状态路径,求出所有路径对应分值之和 forward_score

  • 最后,根据CRF模型定义,两者相减即可

在这里插入图片描述

2.1 CRF的分子对数 _score_sentence()

上述 l o g ( Ψ ( t a g s , w o r d s ) ) log(\Psi(tags, words)) log(Ψ(tags,words))可通过函数 _score_sentence()求解

根据CRF模型定义,推导如下:

在这里插入图片描述

对应代码

def _score_sentence(self, frames, tags):
    tags_tensor = self._to_tensor([START_TAG] + tags, self.tag2ix)
    score = torch.zeros(1)
    for i, frame in enumerate(frames):  # 沿途累加每一帧的转移和发射
        score += self.transitions[tags_tensor[i], tags_tensor[i + 1]] + frame[tags_tensor[i + 1]]
    return score + self.transitions[tags_tensor[-1], self.tag2ix[END_TAG]]  # 加上到END_TAG的转移

※ 注意到上述推导过程中,我在 Σ \Sigma Σ 外面套了一层中括号。
这是为了避免歧义. 例如: ∑ i = 1 3 a i + c \sum_{i=1}^3 ai+c i=13ai+c到底是指 a 1 + a 2 + a 3 + c a1+a2+a3+c a1+a2+a3+c 还是 ( a 1 + c ) + ( a 2 + c ) + ( a 3 + c ) (a1+c)+(a2+c)+(a3+c) (a1+c)+(a2+c)+(a3+c)呢?

这里字母 c c c 不含下标,通常按照前一种方式理解即可。
符号简单的时候,还勉强能看出来;如果复杂一点呢?
相信很多同学都有 类似的被晦涩而充满歧义的数学表达坑过的惨痛经历。

古文是没有断句的,要靠读者的经验来消歧;古人不以糊涂草率为耻,反而将这种所谓“技能”美其名曰“句读”。 e.g. 子曰“民可使由之不可使知之”。断成“民可使由之,不可使知之” v.s. “民可使,由之;不可使,知之”;截然相反的歧义。

如果把代码比作“白话文”,则数学公式表达类似于“文言文”,而且是还没断句的那种。
呼吁大家:从我做起,尽力改善数学表达的可读性

期望能早日看到这个领域的 “胡适、鲁迅、陈独秀、蔡元培”们站出来改善这一局面; 目前我能想到的有以下几个方向,抛砖引玉,欢迎讨论补充:

  • 主动消歧:
    在这里插入图片描述

  • 变量复用:
    在这里插入图片描述

  • 合理命名:

  • 尽量使用大家习惯的符号,避免滥用 n , a , b , i , j , . . . n,a,b,i,j,... n,a,b,i,j,... 之类的无意义变量

  • 尽量使用容易猜到含义的首字母或者希腊字母作为变量名 e.g. I − > I n i t i a l , T − > T r a n s i t i o n , E − > E m i s s i o n , L − > L e n g t h , △ − > D i f f e n r e n c e I-> Initial, T->Transition, E->Emission, L->Length, △->Diffenrence I>Initial,T>Transition,E>Emission,L>Length,>Diffenrence

  • 必要时,使用 多字母的变量名(e.g. “head/tail”), 甚至导入辅助概念(第一枚硬币的颜色 “red/black”) 也是可以的
    在这里插入图片描述

  • 充分注解:

在这里插入图片描述

2.2 CRF的分母 _forward_alg()

分母对数 = l o g [ ∑ t ∈ A l l P a t h e x p ( Ψ ( t , w o r d s ) ) ] log[\sum_{t\in AllPath} exp(\Psi(t, words))] log[tAllPathexp(Ψ(t,words))]

这里有个困难 t ∈ A l l P a t h t\in AllPath tAllPath 难以穷举。e.g. 设 len(tags)=5len(words)=10,则 t 的取值空间是 5 10 5^{10} 510
换个思路,不再按照 t t t 求和,而是改为 沿着时间轴做DP

思考一下递推关系:

  • 穷举所有长度为L-1的path, 其集合记作 P L − 1 P^{L-1} PL1
    定义 α i , j = l o g [ ∑ y ∈ P i − 1 e x p ( Ψ ( w 1 − i , y 1 − i − 1 , y i = j ) ) ] α_{i,j} = log[\sum_{y\in P^{i-1}} exp(\Psi(w_{1-i}, y_{1-{i-1}}, y_i = j))] αi,j=log[yPi1exp(Ψ(w1i,y1i1,yi=j))] ,即"i时刻到状态j"的所有路径分数的log_sum_exp

  • 则有
    在这里插入图片描述

至此,我们将待求的"分母对数"化成了 关于 α α α 向量的log_sum_exp形式;只要能DP求出 α α α向量,问题就得到了解决。 α α α的递推关系如下

在这里插入图片描述

根据上述推导,观察【单个状态】 α i − 1 , j ′ − > α i , j α_{i-1,j'}->α_{i,j} αi1,j>αi,j 的递推过程:

已知: α i − 1 , j ′ α_{i-1,j'} αi1,j ∀ j ′ − > A l l T a g s \forall j'->AllTags j>AllTags
要求: α i , j α_{i,j} αi,j
做法: 加上 j ′ − > j j'->j j>j 的状态转移分 和 j ′ − > w i j'->w_i j>wi 的发射分;
α i , j = l o g [ ∑ j ′ e x p ( α i − 1 , j ′ + j j ′ , j + E j , w i ) ] α_{i,j} = log[\sum_{j'} exp(α_{i-1,j'}+j_{j',j}+E_{j,w_i})] αi,j=log[jexp(αi1,j+jj,j+Ej,wi)]
将上述【单个状态】的推导加以概括,得到【矩阵化】写法; 以1 -> 2时刻为例

在这里插入图片描述

对应代码

def _forward_alg(self, frames):
    """ 给定每一帧的发射分值; 按照当前的CRF层参数算出所有可能序列的分值和,用作概率归一化分母 """
    alpha = torch.full((1, self.n_tags), -10000.0)
    alpha[0][self.tag2ix[START_TAG]] = 0  # 初始化分值分布. START_TAG是log(1)=0, 其他都是很小的值 "-10000"
    for frame in frames:
        # log_sum_exp()内三者相加会广播: 当前各状态的分值分布(列向量) + 发射分值(行向量) + 转移矩阵(方形矩阵)
        # 相加所得矩阵的物理意义见log_sum_exp()函数的注释; 然后按列求log_sum_exp得到行向量
        alpha = log_sum_exp(alpha.T + frame.unsqueeze(0) + self.transitions)
    # 最后转到EOS,发射分值为0,转移分值为列向量 self.transitions[:, [self.tag2ix[END_TAG]]]
    return log_sum_exp(alpha.T + 0 + self.transitions[:, [self.tag2ix[END_TAG]]]).flatten()
def log_sum_exp(smat):
    """
    参数: smat 是 "status matrix", DP状态矩阵; 其中 smat[i][j] 表示 上一帧为i状态且当前帧为j状态的分值
    作用: 针对输入的【二维数组的每一列】, 各元素分别取exp之后求和再取log; 物理意义: 当前帧到达每个状态的分值(综合所有来源)
    例如: smat = [[ 1  3  9]
                 [ 2  9  1]
                 [ 3  4  7]]
         其中 smat[:, 2]= [9,1,7] 表示当前帧到达状态"2"有三种可能的来源, 分别来自上一帧的状态0,1,2
         这三条路径的分值求和按照log_sum_exp法则,展开 log_sum_exp(9,1,7) = log(exp(9) + exp(1) + exp(7)) = 3.964
         所以,综合考虑所有可能的来源路径,【当前帧到达状态"2"的总分值】为 3.964
         前两列类似处理,得到一个行向量作为结果返回 [ [?, ?, 3.964] ]

    注意数值稳定性技巧 e.g. 假设某一列中有个很大的数
    输入的一列 = [1, 999, 4]
    输出     = log(exp(1) + exp(999) + exp(4)) # 【直接计算会遭遇 exp(999) = INF 上溢问题】
            = log(exp(1-999)*exp(999) + exp(999-999)*exp(999) + exp(4-999)*exp(999)) # 每个元素先乘后除 exp(999)
            = log([exp(1-999) + exp(999-999) + exp(4-999)] * exp(999)) # 提取公因式 exp(999)
            = log([exp(1-999) + exp(999-999) + exp(4-999)]) + log(exp(999)) # log乘法拆解成加法
            = log([exp(1-999) + exp(999-999) + exp(4-999)]) + 999 # 此处exp(?)内部都是非正数,不会发生上溢
            = log([exp(smat[0]-vmax) + exp(smat[1]-vmax) + exp(smat[2]-vmax)]) + vmax # 符号化表达

    代码只有两行,但是涉及二维张量的变形有点晦涩,逐步分析如下, 例如:
    smat = [[ 1  3  9]
            [ 2  9  1]
            [ 3  4  7]]
    smat.max(dim=0, keepdim=True) 是指【找到各列的max】,即: vmax = [[ 3  9  9]] 是个行向量
    然后 smat-vmax, 两者形状分别是 (3,3) 和 (1,3), 相减会广播(vmax广播复制为3*3矩阵),得到:
    smat - vmax = [[ -2  -6  0 ]
                   [ -1  0   -8]
                   [ 0   -5  -2]]
    然后.exp()是逐元素求指数
    然后.sum(axis=0, keepdim=True) 是"sum over axis 0",即【逐列求和】, 得到的是行向量,shape=(1,3)
    然后.log()是逐元素求对数
    最后再加上 vmax; 两个行向量相加, 结果还是个行向量
    """
    vmax = smat.max(dim=0, keepdim=True).values  # 每一列的最大数
    return (smat - vmax).exp().sum(axis=0, keepdim=True).log() + vmax

三、推断(Inference)

推断逻辑很直观,就是过一遍LSTM拿到每一帧的发射状态分布;然后跑viterbi解码得出最优路径和分值。

def forward(self, words):  # 模型inference逻辑
    lstm_feats = self._get_lstm_features(words)  # 求出每一帧的发射矩阵
    return self._viterbi_decode(lstm_feats)  # 采用已经训好的CRF层, 做维特比解码, 得到最优路径及其分数
3.1 维特比解码 _viterbi_decode()

我假设你熟悉CRF算法;所以viterbi本身不用介绍了。 说一下跟前向求CRF分母对数时的小小区别:这里除了要迭代更新 α α α 以外,还要追踪每一帧的每个状态的最优“上一步”来自于哪里。因此,可以看到第9行的log_sum_exp()上方的第8行还记下了argmax

def _viterbi_decode(self, frames):
        backtrace = []  # 回溯路径;  backtrace[i][j] := 第i帧到达j状态的所有路径中, 得分最高的那条在i-1帧是神马状态
        alpha = torch.full((1, self.n_tags), -10000.)
        alpha[0][self.tag2ix[START_TAG]] = 0
        for frame in frames:
            # 这里跟 _forward_alg()稍有不同: 需要求最优路径(而非一个总体分值), 所以还要对smat求column_max
            smat = alpha.T + frame.unsqueeze(0) + self.transitions
            backtrace.append(smat.argmax(0))  # 当前帧每个状态的最优"来源"
            alpha = log_sum_exp(smat)  # 转移规律跟 _forward_alg()一样; 只不过转移之前拿smat求了一下回溯路径

        # 回溯路径
        smat = alpha.T + 0 + self.transitions[:, [self.tag2ix[END_TAG]]]
        best_tag_id = smat.flatten().argmax().item()
        best_path = [best_tag_id]
        for bptrs_t in reversed(backtrace[1:]):  # 从[1:]开始,去掉开头的 START_TAG
            best_tag_id = bptrs_t[best_tag_id].item()
            best_path.append(best_tag_id)
        return log_sum_exp(smat).item(), best_path[::-1]  # 返回最优路径分值 和 最优路径

四、总结

本文给出了 BiLSTM-CRF用作序列标注算法的 详细推导步骤,并在PyTorch官方教程的基础上 修改成了矩阵化写法;同时,给出了一份注释详尽的教学代码。
单步调试跟一遍,相信你会有不小收获。

happy coding, 祝好运!

参考文献

BiLSTM-CRF原文: https://arxiv.org/pdf/1508.01991v1.pdf
PyTorch官方教学代码: https://pytorch.org/tutorials/beginner/nlp/advanced_tutorial.html
矩阵化推导: https://zhuanlan.zhihu.com/p/44042528

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