R语言中的层次聚类
层次聚类是一种常用的无监督学习方法,它可以将数据集中的样本按照相似性进行分组。R语言提供了多种实现层次聚类的方法,包括使用不同的聚类算法和距离度量方法。本文将介绍如何在R中进行层次聚类,并提供相应的源代码示例。
一、数据准备
在进行层次聚类之前,首先需要准备数据。假设我们有一个包含n个样本的数据集,每个样本有m个特征。在R中,可以使用数据框(data frame)或矩阵(matrix)来表示数据。
下面是一个简单的数据集示例,其中包含5个样本和2个特征:
# 创建数据集
data <- matrix(c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10), nrow = 5, ncol = 2)
二、层次聚类算法
R语言提供了多种层次聚类算法,其中最常用的是基于欧氏距离的聚类算法。在R中,可以使用hclust
函数进行层次聚类。
下面是使用hclust
函数进行层次聚类的示例:
# 执行层次聚类
result <- hclust(dist(data), method = "complete")
在上面的代码中,dist
函数用于计算样本之间的距离矩阵,method = "complete"
表示使用完全连接法进行聚类。
三、聚类结果可视化
完成层次聚类之后,可以使用plot
函数将聚类结果可视化。聚类结果通常以树状图(dendrog