Multi-echo Multi-band fMRI scanning and ME-ICA method

本文记录了首次接触Multi-echo Multi-band (MESMS) fMRI扫描序列及ME-ICA分析方法的学习过程。通过3T SIEMENS PRISMA设备进行扫描,使用FSL和AFNI工具进行分析。内容涵盖了multi-echo序列的原理、ME-ICA的介绍以及在BIDS结构下的应用,并探讨了ME-ICA作为去噪方法的有效性。同时,提供了相关资源链接以便进一步学习。
摘要由CSDN通过智能技术生成

# 第一次接触MESMS(multi-band)的MRI scanning sequence,以及 ME-ICA 分析方法,在此做笔记使用

# 一些因为project需要用到的tools和topics都附带对应的链接的整理,这个blog只是为了方便个人学习使用

# acquisition parameters: 3T SIEMENS PRISMA, brain scanning, ME 3 echoes (我也对echo的数目表示不解),MB 2 grapa,64 channel coil

# analysis tools: FSL (with BIDS structure), AFNI

 

1. 关于multi-echo sequence ,原理,与single-echo的对比,以及为什么ME的基础上一般加上MB

(1)什么是echo?有什么作用?

https://www.mr-tip.com/serv1.php?type=db1&dbs=Number%20of%20Echoes

以及 the effect of echo time on fMRI https://users.fmrib.ox.ac.uk/~stuart/thesis/chapter_4/section4_2.html

(2)ME的原理和对比single echo

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