【接单外包笔记】centos7.9安装GPU并行LAMMPS2023

安装步骤

• 依赖安装

yum install openmpi
yum install environment-modules
yum install openmpi-devel

验证是否mpicc，mpicxx，mpirun，mpiexec都存在，如果都能运行说明openmpi并行框架已经安装成功。
安装fftw

yum install fftw

编译安装LAMMPS2023

步骤1：下载
下载地址
步骤2：解压

tar -xzvf lammps*.tar.gz

步骤3：修改GPU编译参数

cd /你的地址/lib/gpu
vim Makefile.linux
修改如下内容：
CUDA_HOME = /usr/local/cuda              # 这里是安装cuda的文件夹,默认地址，一般不需要修改
NVCC=nvcc                                #$(CUDA_HOME)/bin/nvcc  这里不需要懂
CUDA_ARCH=-arch=sm_89       #这里是显卡对应的型号，我这是4070卡，可以看我另外的帖子如何确定版本
CUDA_PRECISION=_D_DOUBLE_DOUBLE  #计算精度，默认不用动
$wq  #保存
make -f Makefile.linux -j 20   //编译

步骤4：安装lammps

cd  ../src
make no-all
make yes-asphere yes-rigid yes-colloid yes-class2 yes-molecule yes-kspace yes-manybody yes-dipole yes-gpu #选择所需要的模块make mpi -j 20

执行完后会生成lmp_mpi执行文件
步骤5：验证测试

cd  /你的路径/lammps-2Aug2023/examples/dipole
mpirun -n 16   /你的路径/lammps-2Aug2023/src/lmp_mpi -sf gpu < in.dipole 

参数说明： -n cpu核数

步骤6：环境变量配置

vim /etc/profile
PATH=/你的路径/lammps-2Aug2023/src:$PATH
wq
source /etc/profile
mpirun -n 16  lmp_mpi -sf gpu < in.dipole