ubuntu22.04 安装lammps：lammps安装、功能包安装、GPU加速、将lmp添加到环境变量中

此次安装使用make安装，虽然官网手册上面推荐使用cmake安装，说camke安装有很多好处，但是我自己的实践来看camke很容易报错，先后两次使用cmake安装也都失败了，所以还是选择了使用传统的make安装方式。

本文参考:

https://blog.csdn.net/qyb19970829/article/details/105463480

https://www.bilibili.com/video/BV1fq4y1D75i/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=4aa3947b0165154fc260c55bcb8e007f

https://www.bilibili.com/video/BV11L411M747/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=4aa3947b0165154fc260c55bcb8e007f

https://www.bilibili.com/video/BV12X4y1G71t/?spm_id_from=333.788.recommend_more_video.2&vd_source=4aa3947b0165154fc260c55bcb8e007f

一、安装前的准备

1.安装显卡驱动和CUDA

1.1 显卡驱动安装

     显卡驱动可以使用ubuntu中的软件与更新中的附加驱动这个功能安装，也可以使用终端手动下载安装。网上有很多经验帖可以参考。安装显卡驱动成功后输入：

nvidia-smi

若显卡驱动安装成功，则会有详情页面显示。

显卡驱动安装成功后还需禁用nouveau driver，nouveau是开源驱动，性能很差，一般都禁用。

在命令行输入：

sudo vi /etc/modprobe.d/blacklist.conf

在最后添加：

blacklist nouveau
options nouveau modeset=0

保存后退出，输入：

sudo update-initramfs -u

输入：

lsmod | grep nouveau

无输出代表禁用成功

1.2 CUDA Toolkit安装

上NVIDIA官网进行下载  https://developer.nvidia.com/cuda-downloads

安装完cuda后添加环境变量

sudo vim ~/.bashrc

在文件的最后添加以下内容：

export PATH=$PATH:/usr/local/cuda-12.2/bin

更新环境变量：

source .bashrc

检查cuda是否安装好，输入：nvcc -v ，出现以下信息说明安装成功

nvcc: NVIDIA (R) Cuda compiler driver
Copyright (c) 2005-2023 NVIDIA Corporation
Built on Tue_Jun_13_19:16:58_PDT_2023
Cuda compilation tools, release 12.2, V12.2.91

1.3 CUDA文件配置

进入gpu目录，修改Makefile.linux

cd lammps-2MAug23/lib/gpu
sudo vim Makefile.linux

根据自己的显卡型号和cuda版本修改以下信息

CUDA_HOME = /usr/local/cuda-12.2			#注意版本

CUDA_ARCH = -arch=sm_89                     #注意sm后面的数字和自己的显卡型号对应        

之后进行make：

make -f Makefile.linux

如果之后更改Makefile.linux 中的内容之后需要重新编译需要先 make clean 一下：

make -f Makefile.linux clean

2.安装依赖

sudo su					    #开启管理员模式，输入密码后继续
apt-get install gcc			#安装gcc
apt-get install g++			#安装g++

apt-get install gfortran		#安装gfortran
apt-get install make			#安装make

apt-get install vim             #安装vim

以上这些大概率是已经装好了的，在这里全部安装一遍是以防万一。一般来说真正需要装的是下面这两个：

sudo apt-get install mpi-default-*   #安装mpi
sudo apt-get install libfftw3*       #安装fftw包

二、安装lammps

官网上下载压缩包后解压缩:

sudo tar -xvf lammps2Aug2023.tar.gz

进入目录： /lammps2Aug2023/src/MAKE

删除Makefile.mpi中和图片相关的代码：

​​

三、安装过程中出现的问题及解决：

1.解决Ubuntu内核版本和显卡驱动版本不匹配的问题

发现client（客户端）的nvidia显卡驱动版本和kerenl内核版本的不一致

因为装cuda的时候会自动安装nvidia显卡驱动，导致之前装的驱动被覆盖。我安装了cuda 12.0，而cuda12.0会自动下载525版本的显卡驱动，把之前我下载的535版本覆盖了，因此出现了错误。

解决办法为：

安装和内核版本一致的显卡驱动，同时安装和该驱动匹配的最新版本的cuda

535支持的最高cuda版本是12.2，因此下载了cuda12.2。

输入：

nvcc -V

出现详细信息，说明安装成功。

2. 解决文件夹权限不够的问题

输入：

sudo su
chmod 7 filename

3. 如果出现报错中显示出进入某个功能包的目录后出错，说明是安装功能包的问题，需要根据功能包的要求把需要的软件和依赖配置好。在编译的时候不要用 make yes-all 的命令来下载所有的功能包

4. GPU加速时的报错