使用多线程和GPU加速LAMMPS算例安装教程

最新推荐文章于 2024-04-05 15:24:56 发布
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(主要是为了在多线程提速计算的同时再用上GPU显卡进行提速，只适用于NVIDIA的显卡)

步骤1. 下载对应操作位数的并行版本的LAMMPS并安装(后面带MPI的是并行版本)

网址是：LAMMPS Binaries Repository: ./64bit

 

步骤2. 下载对应操作位数的mpich2并安装

 网址是：

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大黄研二必过六级
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LAMMPS安装与使用
01-07
目录安装windows安装linux安装（centos7）利用命令行安装使用运行格式运行示例 安装 windows安装 安装分为三步： 下载安装包，lammps,lammps-mpi,mpich2,这里的安装包是64位的，32位对应的包去上面提到的网站去下载对应的包。lammps的包可以选择较新的版本来安装。 双击安装，注意第三个包是为lammps运行提供一些基本文件的，假如第三个不安装会提示dll文件缺失，从而无法运行。 检查运行,在shell命令行中运行lmp_mpi，假如没有报错就表明没有问题。 linux安装（centos7） linux下暂时未使用 利用命令行安装 安装库 首先安装对
windows系统下实现lammps的GPU加速计算
qq_42110789的博客
05-25 5893
写在前面 之前看到小木虫上有大佬在windows系统上用lammps的gpu加速，效果很好，不需要安装ubuntu系统，非常羡慕，可谓懒人必备。今天正好测试gpu包成功，顺带把方法分享给大家。（由于软、硬件环境差异，不能保证每个人用下述方法都能成功） 测试环境：window10系统 显卡：GTX1060（需要英伟达的显卡，该方法amd的显卡可能不行） 测试的lammps版本：LAMMPS 64-bit 15Apr2020 1.安装好win版lammps 串行并行版本应该都可以，windows版本的lammp
【LAMMPS学习】七、加速性能(4)加速器包
最新发布
荷塘阅色
04-05 1023
GPU 与多核 CPU 的性能取决于您的硬件、使用的配对类型、原子/GPU 的数量以及 GPU 上使用的精度（双精度、单精度、混合精度）。要查看当前可用于特定样式的加速样式，请在命令样式页面中找到样式名称（fix,compute,pair等），并查看列出的后缀（g、i、k、o、t）。同样，您应该尝试 GPU 库的精度设置，看看单精度或混合精度是否会给出准确的结果，因为它们通常会更快。否则，使用该样式的命令的语法是相同的，它们的功能是相同的，并且它产生的数值结果也应该是相同的，除了精度和舍入效果之外。
程序.rar_Lammps拉伸模拟_lammps_lammps单轴拉伸_lammps拉伸算例_碳纳米管
07-15
lammps软件模拟单臂碳纳米管单轴拉伸的算例
lammps并行安装教程.pdf
09-27
windows系统下lammps并行安装，一般性分子模拟软件。 兼容当前大多数的势能模型，编程水平高，计算效率高。可以 模拟软材料和固体物理系统。
KAPPA_lammps_lammps算例_thermalconductivity_
10-03
lammps官网提供的热导率算例，包含fix ehex
LAMMPS 2022版使用并行加速
novanova2009的博客
11-21 1595
\lmp.exe -pk gpu 1 split -1.0 device_type nvidiagpu -in .\in.deposit.atom.lmp 用时0:03:09。.\lmp.exe -pk gpu 0 device_type nvidiagpu -in .\in.deposit.atom.lmp用时 0:03:39。.\lmp.exe -pk gpu 1 split 1.0 -in .\in.deposit.atom.lmp用时0:03:09。用时0:05:13。
ubuntu22.04 安装lammps：lammps安装、功能包安装、GPU加速、将lmp添加到环境变量中
csu_lijunjie的博客
11-15 1324
此次安装使用make安装，虽然官网手册上面推荐使用cmake安装，说camke安装有很多好处，但是我自己的实践来看camke很容易报错，先后两次使用cmake安装也都失败了，所以还是选择了使用传统的make安装方式。
【接单外包笔记】centos7.9安装GPU并行LAMMPS2023
01-12 665
验证是否mpicc，mpicxx，mpirun，mpiexec都存在，如果都能运行说明openmpi并行框架已经安装成功。执行完后会生成lmp_mpi执行文件。参数说明： -n cpu核数。步骤3：修改GPU编译参数。步骤4：安装lammps。步骤6：环境变量配置。
lammps并行（mpi）安装及gpu加速
m0_58588820的博客
03-04 634
解决lammps并行安装的问题
Ubuntu下的lammps GPU加速（真的香）
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快乐学术猿
04-13 2万+
参考 Lammps实现GPU加速，博客界面很好看，就是要翻墙，哈哈哈，所以我就转到CSDN大家参考学习。 GPU加速 显卡驱动安装（本文默认为英伟达） - 检查自己的驱动是否安装成功 nvidia-smi 如果安装成功会有如下输出： 如果未安装会有如下结果： nvidia-smi command not found - 安装驱动 ubuntu-drivers devices #...
lammps安装 centos7成功安装
10-27
centos7亲测安装成功，摘自网上一个帖子，忘了出处，若有人知道望告知，添加链接，谢谢！
Lammps for GPU 编译手册
07-28
Lammps for GPU 编译手册 基础环境RHEL5U3、Nvidia C2050
想测试4片GPU卡，LAMMPS的设置方法
时光带来的礼物
08-23 3438
1. 编译出支持并行的LAMMPS可执行文件，网上有很多文章，大家可以找找，有问题联系我。我编译出的可执行文件是lmp_gpu；       2. 修改输入文件，加入如下内容：         package gpu force/neigh 0 3 1         其中第二位数字3是指定支持GPU卡的数量的，也就是说：        package gpu force/neigh 0
lammps安装GPU成功后运行报错
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报错：LAMMPS (23 Jun 2022 - Update 4)解决方法：换驱动。
C 怎么处理windows路径_【100天学习LAMMPS】第2天：LAMMPS并行版在Windows环境下的安装...
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环境准备：双路CPU工作站128G内存英伟达1080Ti显卡两块faiss源码包centos7.2+python2.7+anaconda2（环境变量与openblas安装同GPU版）centos7.2+python3.6+anaconda3（conda安装faiss环境）1 显卡驱动安装显卡安装有两种方式，一种是用yum从 ELRepo 源中安装，一种是从源码编译驱动。我们选用第一种方式来安装（简...
lammps—报错记录—gpu加速—ERROR:unable to initialize —cuda driver error 4 ... ‘geryon/nvd_device.h‘
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03-26 1483
对于这个问题的原因，很明显就是在使用GPU加速的时候CPU核心数目过多了而导致的。我还不太清楚为什么会这样，我看到网上有人发帖说 “在用GPU加速算法的时候，在同样的GPU使用情况下，使用数量多的CPU反而计算速度下降，这可能是因为MD的运算都在GPU中运行，而过多的CPU数目反而会增加各个计算板块之间的通信时间。” 类比思考一下，我这个报错可能是因为GPU加速算法并支持过多核数的CPU计算（没有测试过具体多少核数是上限度），因此产生了报错。
lammps运行报错以及GPU的效率测试
weixin_43011746的博客
11-23 2310
报错三：mpirun -np 4 lmp_mpi -in **_**_ev.in1 >out.log CPU可以运行。GPU：1个（80%利用率）运行时间： 0:01:49。GPU：1个（87%利用率）运行时间： 0:01:41。GPU：1个（80%利用率）运行时间： 0:01:47。GPU：1个（39%利用率）运行时间： 0:03:23。GPU：1个（37%利用率）运行时间： 0:02:09。GPU：1个（40%利用率）运行时间：0:05:48。解决方法：提交命令加入neigh no。
lammps安装教程linux
03-16
LAMMPS是一种分子动力学模拟软件，可用于模拟各种材料的行为。以下是在Linux上安装LAMMPS的步骤： 1. 下载LAMMPS的源代码，可以从官方网站或GitHub上获取。 2. 安装必要的依赖项，如MPI库和编译器。可以使用以下命令安装： sudo apt-get install mpich gcc g++ 3. 解压LAMMPS源代码，并进入解压后的目录。 4. 根据需要进行配置，可以使用以下命令： make yes-all #启用所有可用的软件包 make no-all #禁用所有软件包 make package-name #启用特定软件包 5. 编译LAMMPS，可以使用以下命令： make mpi #使用MPI编译 make serial #使用串行编译 6. 安装LAMMPS，可以使用以下命令： make install #将LAMMPS安装到默认位置 make install-user #将LAMMPS安装到用户目录 7. 测试LAMMPS是否安装成功，可以使用以下命令： mpirun -np 4 lmp_mpi -in in.file #使用MPI运行LAMMPS lmp_serial -in in.file #使用串行运行LAMMPS 以上是在Linux上安装LAMMPS的基本步骤，具体操作可能因系统版本和软件包而异。建议参考LAMMPS官方文档和社区论坛获取更多信息。

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