复杂网络社区结构发现算法-基于igraph 标签传播算法

最新推荐文章于 2024-08-26 12:07:08 发布

a_step_further

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分类专栏：复杂网络

本文链接：https://blog.csdn.net/a_step_further/article/details/51176980

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本文介绍了在复杂网络社区结构分析中，使用igraph库的标签传播算法处理加权图的方法。相较于其他算法，igraph提供了对权重的支持，并能自动确定迭代次数。在处理大规模数据时，igraph的C库展现出高性能，但其C接口使用相对复杂。文中通过代码示例展示了如何从文件读取加权图、处理图属性等关键步骤，并强调了在使用过程中需要注意的细节，以帮助读者理解和应用该算法。

摘要由CSDN通过智能技术生成

【前言】

继续我们本系列对复杂网络社区结构的方法探索，之前已经尝试过spark上标签传播算法、igraph 中随机游走算法、networkx中的clique渗透算法（见笔者相关文章），但一直局限于无向、无权重图的分析。本次，向前迈一步，引入权重。选用了igraph中的标签传播算法。

【方法讨论】

相比于spark上的标签传播算法，发现igraph中的接口增加了对权重的支持，同时不用事先指定迭代的次数，这是两点好的地方。当然，可以处理的数据量级上，igraph单机版本没法和spark集群版本相提并论了。但是相比于python版本networkx的性能瓶颈，igraph C library的计算效率领先几条街。（小小吐槽一下：igraph同时提供有python、R、C三种版本的接口，相比之下，C library的使用要繁琐很多，如果不是追求性能稍好些，真心推荐使用其它两种方式）

在对权重的处理上，官方文档如是说:

Weights are taken into account as follows: when the new label of node i is determined, the algorithm iterates over all edges incident on node i and calculate the total weight of edges leading to other nodes with label 0, 1, 2, ..., k-1 (where k is the number of possible labels). The new label of node i will then be the label whose edges (among the ones incident on node i) have the highest total weight.

算法接口也比较简洁明确（稍后咱们详细看如何使用）：

int igraph_community_label_propagation(const igraph_t *graph,
                                       igraph_vector_t *membership,
                                       const igraph_vector_t *weights,
                                       const igraph_vector_t *initial,
                                       igraph_vector_bool_t *fixed, 
				       igraph_real_t *modularity);

【不废话，上完整版代码】

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include </usr/local/igraph-0.7.1/include/igraph.h>
#include <string.h>

int main(int argc,char *argv[])
{
    printf("Hello world!\n");
    FILE *edgeListFile;
    FILE *community