蛋白质翻译后修饰分析简介

蛋白质翻译后修饰

蛋白质翻译后修饰 (Protein post-translational modifications,PTMs) 通过功能基团或蛋白质的共价添加、调节亚基的蛋白水解切割或整个蛋白质的降解来增加蛋白质的功能多样性。蛋白质组中任一蛋白质都能在翻译时或翻译后进行修饰。不同类型的修饰都会影响蛋白质的电荷状态、疏水性、构象或稳定性,最终影响其功能。这些修饰包括磷酸化、糖基化、泛素化、亚硝基化、甲基化、乙酰化、脂质化和蛋白水解。相较于没有发生修饰的蛋白,PTMs会导致特定序列分子量的增加。在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中,蛋白会首先被酶切成肽段,然后进入质谱进行分析。通过质谱分析,得到的是一系列肽段的分子质量信息。对于某一个特定肽段而言,在没有发生任何翻译后修饰的情况下,其序列信息和分子量是确定的。蛋白质翻译后修饰几乎影响正常细胞生物学和发病机制的所有方面。因此,通过蛋白质翻译后修饰进行鉴定分析,对识别和理解 PTM 在细胞生物学和疾病治疗和预防的研究中至关重要。

数据分析流程

在这里插入图片描述

蛋白质翻译后修饰加入的官能团反应有:

1、Phosphorylation:可逆的蛋白质磷酸化,主要发生在丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基上,是目前研究得最深入的翻译后修饰之一。磷酸化在细胞周期、生长、凋亡和信号转导等过程中起着重要的调控作用。
2、Glycosylation: 蛋白质糖基化是蛋白质翻译后的主要修饰之一,对蛋白质的折叠、构象、分布、稳定性和活性都有重要影响。糖基化包含了从核转录因子的简单单糖修饰到细胞表面受体的高度复杂分支多糖变化的蛋白质的糖部分添加的多种选择。
3、Ubiquitination:泛素是一类分子量为 8 kDa 的多肽,由 76 个氨基酸组成,通过泛素 C 末端的甘氨酸连接到靶蛋白赖氨酸的 ε-NH2 上。
4、Methylation: 甲基化是一碳甲基转移至氮或氧(分别为 N-和 O-甲基化)至氨基酸侧链,增加了蛋白质的疏水性,当与羧酸结合时,可中和氨基酸负电荷。
5、S-nitrosylation:Snitrosylation 是细胞用来稳定蛋白质、调节基因表达和提供 NO 供体的关键 PTM。

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