从零入门R语言-软件下载，环境搭建，数据导入导出

最新推荐文章于 2024-09-30 20:52:15 发布
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分类专栏： R语言vs科研 文章标签： 大数据 r语言 数据分析 python
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1. 为什么是R？

现在数据科学，深度学习领域最受欢迎的是Python, 那么为什么要学习R语言，Python 和 R 的优势分别在哪儿？

简单来说，R语言更适用与研究，偏数理统计，小而精，适合将来做科研学术。Python更适用于工业领域，普适性，通用性，计算性能更好，更适合做程序员或者进入企业。

具体可以参考张敬新老师翻译的R用于研究,Python用于生产, 英文原文地址为R is for Reasearch, Python is for Production。

所以首先需要确定自己的需求，R不一定适合每一个人。如果你是想认真学习编程思维，底层逻辑，那么R并不是一个很好地选择。但如果你只是需要一个工具，来帮你实现问题的分析，建模，解释和展示，那么R是一个很好地选择。R语言更适合高校研究从事数据分析，数据可视化，数理统计建模。数据科学的基本流程如图所示，在R上我们可以愉快的实现数据分析的全部流程。

2. 什么是R？什么是Rstudio?

R 是一种运行计算的编程语言， 而 RStudio 是一种集成开发环境 (IDE)，它通过添加许多方便的功能和工具来提供接口，使用 RStudio 的界面也使得用 R 变得更加容易。当然还有很多IDE可以用来进行R语言编程，如Sense, RIDE，甚至Jupyter notebook 以及 VS code 也都可以用来编程R，但这些都需要相对更高的门槛，相对更推荐使用Rstudio 进行R编程的全流程工作。

3. 安装R和Rstudio

首先你需要做的就是安装R和Rstudio到你的电脑，顺序一定是先安装R，再安装Rstudio。

3.1 安装R

官网下载地址https://cloud.r-project.org/，但是这个网址是国外的，下载速度较慢。建议用国内的镜像站：

如果你是Windows,Mac os, Linux 用户分别点击对应的 “Download R for windows”, “Download R for (MAC) OS”, “Download R for Linux” 下载最新版本的R-4.1.0即可。

如果是Windows用户建议不要安装在系统盘内，且安装路径一定要是英文，不能有空格，如果Windows系统用户名是中文应先改成英文。

3.2 安装Rstudio

找到 “Installers for Supported Platforms” 按钮，并对应自己的电脑系统下载对应版本的Rstudio客户端。

https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

安装好Rstudio后打开界面展示如下：

在这里插入图片描述

4. 怎样在Rstudio里编程？

现在已经设置了 R 和 RStudio，“现在我如何使用 R？”。首先要注意的是，与 Excel、SPSS 等其他提供点击式界面的统计软件程序不同，R 是一种解释性语言。这意味着您必须输入用 R 代码编写的命令。换句话说，你必须在 R 中编码/编程。

虽然使用 R 不需要是经验丰富的编码员/计算机程序员，但如果你是新接触编程语言这里需要了解一些基本编程概念。

介绍一些基本的编程概念和术语。

基本：

  • console pane：您输入命令的地方。

  • Running code 运行代码：通过在控制台中给出命令来告诉 R 执行一个行为的行为。

  • 数据类型：integers 整数、 doubles/numerics 双精度/数字、 logicals 逻辑和 characters 字符。整数是像 -1、0、2、4092 这样的值。双精度或数字是一组更大的值，既包含整数，也包含分数和小数值，如 -24.932 和 0.8。逻辑是 TRUE 或 FALSE，而字符是文本，例如“你”、“我”、“R语言真好”，注意，字符通常用引号括起来表示。

  • vectors向量：一系列值。这些是使用 c() 函数创建的，其中 c() 代表“组合”或“连接”。例如， c(2, 11, 22, 33, 91, 99) 创建一个六元素系列的正整数值。

  • factors因子：分类数据通常在 R 中表示为因子。分类数据也可以表示为字符串。如成绩可以分为 优，良，及格。

  • data frames 数据框：它们是 R 中数据集的表示，其中行对应于观测，列对应于描述观测的变量。

  • Conditionals条件:

    • R中=用于赋值，== 用于测试是否相等，例如 3+4 == 7 判断3+4 是否等于7，将返回TRUE。而 3+4 = 7将发生错误

    • 布尔代数：TRUE/FALSE 语句和数学运算符，例如 <（小于）、<=（小于或等于）和 !=（不等于）。例如，4 + 2 >= 3 将返回 TRUE，但 3 + 5 <= 1 将返回 FALSE。

    • 逻辑运算符：& 表示“与”以及 |代表“或”。例如， (2 + 1 == 3) & (2 + 1 == 4) 返回 FALSE，因为两个子句都不为 TRUE（只有第一个子句为 TRUE）。另一方面， (2 + 1 == 3) | (2 + 1 == 4) 返回 TRUE，因为这两个子句中至少有一个是 TRUE。

  • Functions函数，也称为命令：函数在 R 中执行任务。它们接受称为参数的输入并返回输出。可以手动指定函数的参数或使用函数的默认值。
    例如，R 中的函数 rnorm() 随机生成正态分布的数。rnorm(n, mean=0, sd=1), n为生成数字的个数，mean均值和sd标准差默认为0和1。你可以自己修改，在命令窗口输入`rnorm(3,mean=2,sd=3)``，按下enter.

5. R packages 安装使用

R各种类型的包package可以说是R最大的特色了，比如最为出名的ggplot2可视化包。那什么是R packages呢？如果把R作为一个手机的底层程序编码，那么package 就是手机上的各个APP。

R一些常用流行的包主要包括：

  • 数据导入:

readr导入csv/fwf文件, readxl导入.xls/.xlsx文件, haven导入SPSS/Stata/SAS文件

  • 数据处理

tidyverse , data.table

  • 数据可视化

ggplot2, cowplot.

5.1 包的安装

  • 安装包也建议切换为国内镜像源

点击 [Tools] ---- [Global Options…], 点击 Packages， 点击Change 修改为清华大学镜像源，China(Beijing1)

在这里插入图片描述

  • 安装官方包，一般情况下大部分常用的包都可以官方安装
install.packages("tidyverse")
install.packages("haven")
  • 安装Github来源的包, 需要先安装devtools包后才可以安装github来源的包
install.packages("devtools")
devtools::install_github("tidyverse")
remotes::install_github("tidyverse")
  • 加载包
library(tidyverse)

## ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.0 ──

## ✓ ggplot2 3.3.3     ✓ purrr   0.3.4
## ✓ tibble  3.1.1     ✓ dplyr   1.0.5
## ✓ tidyr   1.1.3     ✓ stringr 1.4.0
## ✓ readr   1.4.0     ✓ forcats 0.5.1

## ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
## x dplyr::filter() masks stats::filter()
## x dplyr::lag()    masks stats::lag()

library(data.table)

## 
## Attaching package: 'data.table'

## The following objects are masked from 'package:dplyr':
## 
##     between, first, last

## The following object is masked from 'package:purrr':
## 
##     transpose

library(ggplot2)
library(bruceR)

## 
## ⚡ bruceR: BRoadly Useful Convenient and Efficient R functions
## 
## Loaded R packages:
## [Data]: rio / dplyr / tidyr / stringr / forcats / data.table
## [Stat]: psych / emmeans / effectsize / performance
## [Plot]: ggplot2 / ggtext / cowplot / see
## 
## Frequently used functions in `bruceR`:
## set.wd() / Describe() / Freq() / Corr() / Alpha() / MEAN()
## MANOVA() / EMMEANS() / model_summary() / theme_bruce()
  • 更新包
update.packages("ggplot2")

# 更新所有包
update.packages()
  • 删除包
remove.packages("data.table")

6. Your first Projects 创建你的第一个项目

通过以上的配置对于R，Rstudio和Packages有了基本的认识。现在假设你有一个数据，你想对其进行数据处理分析建模解释等等一系列的工作。那么可以简单分为以下几个步骤：

  1. 在Rstudio内创建一个Project项目

[File] — [New Project] — [New Directory] — [New Project]

输入你的项目名称【“first project”】,选择项目存储位置，注意存储路径不要有中文。确定，这时候在你屏幕的右上角你就可以看到你的项目名称了。

在这里插入图片描述

  1. 新建R脚本编写R代码

创建 [R Script], 命名"first.R", 保存到你项目的保存文件夹内。

  • 查看你的项目路径
getwd()

## [1] "/Users/cpf/Documents/paper/writting_blog/paper_sections"
  • 安装和加载需要使用的包
install.packages("tidyverse")
install.packages("bruceR") 

library(tidyverse)
library(bruceR)
  • 导入数据集

使用import函数可以导入csv,exel等多种格式的文件，优先建议使用这个函数导入。

# mydata = import("~/yourpath/data.csv")

# 也可以使用R自带的数据集
data("weather", package = "nycflights13")
  • 查看你的数据集
glimpse(weather)

## Rows: 26,115
## Columns: 15
## $ origin     <chr> "EWR", "EWR", "EWR", "EWR", "EWR", "EWR", "EWR", "EWR", "EW…
## $ year       <int> 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013,…
## $ month      <int> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,…
## $ day        <int> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,…
## $ hour       <int> 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 16, 17, 18, …
## $ temp       <dbl> 39.02, 39.02, 39.02, 39.92, 39.02, 37.94, 39.02, 39.92, 39.…
## $ dewp       <dbl> 26.06, 26.96, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.…
## $ humid      <dbl> 59.37, 61.63, 64.43, 62.21, 64.43, 67.21, 64.43, 62.21, 62.…
## $ wind_dir   <dbl> 270, 250, 240, 250, 260, 240, 240, 250, 260, 260, 260, 330,…
## $ wind_speed <dbl> 10.35702, 8.05546, 11.50780, 12.65858, 12.65858, 11.50780, …
## $ wind_gust  <dbl> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 20.…
## $ precip     <dbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,…
## $ pressure   <dbl> 1012.0, 1012.3, 1012.5, 1012.2, 1011.9, 1012.4, 1012.2, 101…
## $ visib      <dbl> 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10,…
## $ time_hour  <dttm> 2013-01-01 01:00:00, 2013-01-01 02:00:00, 2013-01-01 03:00…
  • 清洗处理你的数据集，本章不侧重分析这个环节。数据处理具体细节可看我另一个回答里推荐的书籍，推荐使用tidyverse工作流处理清晰数据。
    R语言数据分析入门推荐书籍
# 
mydata2 = weather %>% 
  select(c(year, month, hour, temp, dewp, humid)) %>%  # 选择这些列
  filter(year == 2013) %>% # 选择2013年的观测
  mutate(yearnew = year + 1) # 创建新列yearnew 

glimpse(mydata2)

## Rows: 26,115
## Columns: 7
## $ year    <int> 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 2013, 20…
## $ month   <int> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,…
## $ hour    <int> 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19,…
## $ temp    <dbl> 39.02, 39.02, 39.02, 39.92, 39.02, 37.94, 39.02, 39.92, 39.92,…
## $ dewp    <dbl> 26.06, 26.96, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04, 28.04,…
## $ humid   <dbl> 59.37, 61.63, 64.43, 62.21, 64.43, 67.21, 64.43, 62.21, 62.21,…
## $ yearnew <dbl> 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 2014, 20…
  • 导出你修改完的数据集
export(mydata2, file= "~/yourpath/.mydata2.csv")
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