小哲的博客

生物等排原理在药物设计中代表了一种成功的策略，被广泛地应用于分子修饰和Me-Too药物设计之中。正确使用分子修饰策略有助于高效地发现新的先导化合物，提高发现有效安全药物的可能性。

药物发挥药效，需要与生物体内具有特定功能的生物大分子结合，这个生物大分子就是药物靶标。药物可作用的靶标绝大多数是蛋白质，少量为核酸和糖。那么，它们有什么样的结构特征呢？

药物设计的物质基础是药物和靶标。在体内，药物小分子通过与特定生物大分子靶标产生相互作 用，达到预期的药效。药物的分子结构决定了它的物理化学性质，以及与生物大分子相互作用时表现出来的生物学效 应。通过对上市药物和候选药物的结构进行分析、归纳，可以获得药物分子结构的一些共同特 征，在设计药物分子时参考这些特征，可以有效提高药物研发的成功率。下文介绍药物分子结构 的共同特征。

CADD是一个相当大的论题，涉及到结构化 学、药物化学、分子药理学、生物化学、结构生物学、分子生物学、化学生物学、细胞生物学、 生理学、病理学、生物物理学、组合化学、量子化学、分子力学、分子动力学、分子图形学、计 算化学、化学信息学、生物信息学、X射线晶体学、核磁共振技术、计算机图形技术、数据库技 术和人工智能技术等基础学科和应用学科与技术。融合这些学科知识与技术，CADD在药物作用 和药理活性预测、药效基团研究、药物构效分析、全新药物设计、高通量虚拟筛选及合成数据库 设计等方面展示了强大的威力，大大地提高

现代药物的研发是一个从基因到药物的研究过程，通常经历药物研究和药物开发两大阶段，需要 耗费1-3年时间和2亿美元。药物研究阶段起始于新靶标的发现（Target Discovery），研究人员 从基因研究开始，依靠大量实验数据获得与疾病相关的基因，进一步发现相应的蛋白，然后寻找 与疾病相关的药物靶标，再对它们进行靶标验证（Target Validation）。在这个基础上，研究人 员运用结构生物学手段，解析靶标的三维结构，发现和优化先导化合物（Lead Compound Identification and