三维提取等值面的重建方法Marching Cubes

感谢原作者的分享,转载出自:http://www.cnblogs.com/shushen/p/5542131.html

                                     http://www.cnblogs.com/shushen/p/5607833.html

Marching Cubes算法是三维离散数据场中提取等值面的经典算法,其主要应用于医学领域的可视化场景,例如CT扫描和MRI扫描的3D重建等。

  算法主要的思想是在三维离散数据场中通过线性插值来逼近等值面,具体如下:三维离散数据场中每个栅格单元作为一个体素,体素的每个顶点都存在对应的标量值。如果体素顶点上的值大于或等于等值面值,则定义该顶点位于等值面之外,标记为“0”;而如果体素顶点上的值小于等值面值,则定义该顶点位于等值面之内,标记为“1”。由于每个体素单元有8个顶点,那么共存在2^8 = 256种情形,下图是Marching Cubes算法的15种基本情形,其他241种情形可以通过这15种基本情形的旋转、映射等方式实现。

  每个体素单元上顶点和边的索引规则如下图左所示,假如体素下方的顶点3的值小于等值面值,其他顶点上的值都大于等值面值(如下图右所示),那么我们可以生成一个与体素边2,3,11相交的三角面片,而三角面片顶点的具体位置则需要根据等值面值和边顶点3-2,3-0,3-7的值线性插值计算得到。

  对于与等值面存在交点的体素边,交点坐标用P表示,P1、P2代表边上两个端点的坐标,V1、V2代表这两个端点上的值,V代表等值面值,那么交点坐标的计算公式如下:

P = P1 + (V – V1)·(P2 – P1)/(V2 – V1)

  算法第一步:通过edgeTable表判断等值面和体素单元哪一条边相交

  体素单元顶点状态的索引号定义规则如下:

复制代码
cubeindex = 0;
if (V[0] < isolevel) cubeindex |= 1;
if (V[1] < isolevel) cubeindex |= 2;
if (V[2] < isolevel) cubeindex |= 4;
if (V[3] < isolevel) cubeindex |= 8;
if (V[4] < isolevel) cubeindex |= 16;
if (V[5] < isolevel) cubeindex |= 32;
if (V[6] < isolevel) cubeindex |= 64;
if (V[7] < isolevel) cubeindex |= 128;
复制代码

  以上图所示为例,仅顶点3标记为“1”,其他顶点标记为“0”,那么体素单元的顶点状态为0000 1000或者8,通过查找表得到edgeTable[8] = 1000 0000 1100,意味着体素单元的边2,3,11和等值面相交,然后通过线性插值计算各个交点的位置。

  算法第二步:通过triTable表生成对应三角面片的组成情况

  还是以上图所示为例,通过查找表得到triTable[8] = {3, 11, 2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1},意味着该种顶点状态可以生成三角面片(3, 11, 2),代表三角面片的3个顶点为边3,11,2和等值面相交的交点。

  经过上述步骤之后,我们可以得到等值面的点面信息。为了进一步完善显示效果,需要调整顶点法向。假设顶点(i, j, k)上的值为f(i, j, k),采用中心差分方法可以计算该点处的梯度矢量:

 

  对G进行归一化,得到顶点(i, j, k)上的单位法向量,然后对体素单元上8个顶点的法向量进行线性插值就可得到三角面片各个顶点的显示法向量。

edgeTable查找表

  View Code

triTable查找表

  View Code

本文为原创,转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/shushen

 

 

参考文献:

[1] William E. Lorensen and Harvey E. Cline. 1987. Marching cubes: A high resolution 3D surface construction algorithm. SIGGRAPH Comput. Graph. 21, 4 (August 1987), 163-169.

[2] http://graphics.stanford.edu/~mdfisher/MarchingCubes.html


上一篇介绍了Marching Cubes算法,Marching Cubes算法是三维重建算法中的经典算法,算法主要思想是检测与等值面相交的体素单元并计算交点的坐标,然后对不同的相交情况利用查找表在体素单元内构建相应的网格拓扑关系。Marching Cubes算法简单,但是存在一些缺陷:1.模型二义性问题;2.模型特征问题。

  对于二义性问题,以2D情形为例,存在一个单元中同一顶点状态而不同的连接方式(如下图所示)。

图:2D中Marching Cubes算法的二义性问题

  那么对于上图中两种连接方式的不同选择,可能会导致在同一张图像上完全不同的结果(如下图所示),二义性在3D中的直接后果是产生“孔洞”。如果在一个单元中,一条对角线的两端点值大于等值面阈值,另一条对角线的两端点值小于等值面阈值,那么通常会发生这种二义性问题。

图:二义性问题的不同结果

  对于特征问题,由于Marching Cubes算法只计算体素单元的交点坐标信息,并根据这些交点连接的三角面片来构建体素单元内的几何模型,这样假如体素单元内存在几何模型的特征信息(棱边、棱角),但是Marching Cubes算法最终构建出的几何模型会缺少这些特征信息(如下图所示)。

图:左上-交点坐标和法向;右上-Marching Cubes算法;左下-Extended Marching Cubes算法;右下-Dual Contouring算法

  Dual Contouring算法[Ju et al. 2002]也是经典的等值面提取算法,相比Marching Cubes算法,Dual Contouring算法利用Hermite数据(交点的位置和法向)进行等值面构建,它克服了Marching Cubes算法所出现的缺陷。具体算法分两步:

  第一步:利用二次误差函数生成顶点坐标

  对于每个与等值面相交的体素单元,通过最小化二次误差函数来生成一个顶点坐标:

 

其中pi为交点的位置,ni为交点的法向。

  误差函数可以写成矩阵形式:

 

其中矩阵A的行向量为交点的法向ni,向量b的每个元素为ni·pi

  极值点可以通过求解正则方程得到:

 

  但是文章指出这种方式会存在数值不稳定,并提出一种解决方法。基于QR矩阵分解计算正交矩阵Q,使得Q与[A b]相乘为如下上三角矩阵形式:

 

其中A'为3*3的上三角矩阵,b'为长度为3的向量,r为标量。

  那么误差函数可以变化为:

 

  然后再根据上式计算极值点。

  第二步:生成网格面片

  对于每一条等值面相交的体素边,那么包含该体素边的4个相邻体素单元内必然都存在顶点,将这4个顶点连接生成1个四边形面片。

  

  文章[Schaefer et al. 2002]详细介绍了Dual Contouring算法的实现细节,通过总结该文可以得到Dual Contouring算法过程如下:

  对于每个与等值面相交的体素单元:

  1. 创建1个4*4的零矩阵用于存放QR矩阵分解的结果;

  2. 对于体素单元的每条相交边,计算交点的位置pi和对应的法向ni

  3. 将向量[ ni.x, ni.y, ni.z, dot(pi,ni) ]添加到4*4的零矩阵底部;

  4. 通过QR矩阵分解得到3*3的上三角矩阵A'和向量b';

  5. 求解线性方程组A'TA'x = (A'Tb' - A'Tb'c) , 其中c是体素单元中所有交点的质心位置;

  6. 将计算得到的偏移量x加上质心位置c即为体素单元中的顶点坐标;

  7. 如果计算得到的顶点坐标位于体素单元之外,那么顶点坐标用质心位置c来代替;

  8. 对于每一条相交的体素边,将其周围4个体素单元内的顶点连接生成1个四边形面片。

 

图:左- Marching Cubes算法;右-Dual Contouring算法

 

图:左- Marching Cubes算法;右-Dual Contouring算法

 

图:box与sphere相交模拟

本文为原创,转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/shushen

 

 

相关: 

水泡动画模拟(Marching Cubes):http://www.cnblogs.com/shushen/p/5542131.html

参考文献:

[1] Tao Ju, Frank Losasso, Scott Schaefer, and Joe Warren. 2002. Dual contouring of hermite data. ACM Trans. Graph. 21, 3 (July 2002), 339-346.

[2] Scott Schaefer and Joe Warren. Dual contouring: The secret sauce. Technical Report 02-408, Department of Computer Science, Rice University, 2002.

[3] http://users.csc.calpoly.edu/~zwood/teaching/csc572/final15/kpidding/index.html



  • 2
    点赞
  • 41
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值