Rstudio Server常见问题处理手册

一.开头

上面这个界面是不是非常熟悉？Rstudio 死亡圈圈一般发生在输入账号密码后进入Rstudio的时候，如果之前运行过大任务，有可能会出现这种情况。Rstudio常见问题我们如何排查和处理,本文章将给你一些思路和处理方式。

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二.处理

2.1死亡圈圈

处理办法：

1.杀掉进程

# 获取进程号
ps -ef | grep "/usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u $(whoami)" | grep -v grep
# 杀掉进程：将123换成上一步得到的进程号 -9是固定的值，不要动（下面还有一行，是grep进程，无需理会，只需要关注红色框的进程）
kill -9 123
# 上述两条命令实现的功能也可以使用下面这一条命令来实现
ps -ef | grep "/usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u $(whoami)" | grep -v grep | awk '{print $2}' | xargs kill -15

2.清除session

# 输入命令，删除session文件（注意，新旧版R studio的目录位置不一样，可以先看看哪个目录有内容，然后再删除）
# 新版
ls ~/.local/share/rstudio/sessions/active
# 如果有内容，则删除
rm -rf ~/.local/share/rstudio/sessions/active
# 旧版
ls ~/.rstudio/sessions/active/session-*
# 如果有内容则删除
rm -rf ~/.rstudio/sessions/active/session-*
# 或者这个目录
ls -l ~/.local/share/rstudio/ctx/
# 看看有没有environment文件，将其删除
rm ~/.local/share/rstudio/ctx/environment
刷新浏览器。再尝试登录r studio

2.2异常崩溃

处理办法：

如果你遇到异常崩溃，这类情况通常您需要排查日志。请执行下面命令，根据日志记录有不懂的话可以问问GPT哈哈哈

# 查看版本
rstudio-server version
# 查看状态
service rstudio-server status
# 查看日志
sudo journalctl -u rstudio-server --since "24 hour ago" --no-pager

2.2 已知一些异常

• RStudio server keeps randomly crashing due to a same jsonrpc error
• Error with 'cacheKey' in .rs.WorkingDataEnv and .rs.CachedDataEnv

2023-03-09T17:41:28.759247Z [rserver-monitor] ERROR 2023-03-09T17:41:28.759048Z [rsession-bend1] ERROR jsonrpc error 7 (Method not found) [method: set_computed_theme_colors]
OCCURRED AT void rstudio::session::rpc::handleRpcRequest(const rstudio::core::json::JsonRpcRequest&, rstudio_boost::shared_ptr<rstudio::session::HttpConnection>, rstudio::session::http_methods::ConnectionType) src/cpp/session/SessionRpc.cpp:345; 
LOGGED FROM: void rstudio::session::rpc::handleRpcRequest(const rstudio::core::json::JsonRpcRequest&, rstudio_boost::shared_ptr<rstudio::session::HttpConnection>, rstudio::session::http_methods::ConnectionType) src/cpp/session/SessionRpc.cpp:350\|\|\|
--
2023-03-09T17:31:00.937519Z [rserver-monitor] ERROR 2023-03-09T17:31:00.937149Z [rsession-bend1] ERROR The previous R session terminated abnormally
LOGGED FROM: rstudio::core::Error {anonymous}::rInit(const rstudio::r::session::RInitInfo&) src/cpp/session/SessionMain.cpp:721\|\|\|

处理办法, 原因：Rstudio的bug

升级Rstudio版本

2.3 需要删除Session的异常

• ERROR system error 37 (No locks available)
• ERROR system error 39 (Directory not empty)

处理办法

清除session

2.4 R Session Disconnected

处理办法

• 出现这个问题，先排除一下自己的帐号是否被别人登录了，或者你是否在另外的浏览器进行了登录，或者在另外一个标签页进行了登录。Rstudio一个帐号只能在一个浏览器的标签中进行访问。
• 如果排除了上述的情况，进行下面的检查

• • 是否内存超出使用量，内存溢出的话，Rstudio进程会被系统杀死。
  • 硬盘空间是否充足，硬盘空间不足的话，Rstudio也会崩溃。
  • 查看是否有多个Rsession，是否是loading的时候，重新打开了Rstudio

• 确认资源没有问题，查看日志进行进一步排查

三.结束

今天我们列举了一些大家使用Rstudio Server 常用的异常和错误，或许你此刻被这些其中的问题弄得十分懊恼，不过没有关系希望文章对你有所帮助。

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