R语言作图——Scatter plot with marginal density

原创 ：
黄小仙

大家好呀，今天小仙分享图是这个样子滴，边缘带有密度图的散点图。

Step1. 绘图数据的准备

首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式，建议大家在excel中保存成csv格式。
作图数据格式如下：
（今天偷懒啦，直接借用了iris数据集）

Step2. 绘图数据的读取

data <- read.csv(“your file path”, header = T, check.names = F)
#注释：header = T表示数据中的第一行是列名，如果没有列名就用header = F
#注释：R读取数据的时候，默认会把列名里的空格变成 "."，check.names = F就不会变了

Step3. 绘图所需package的安装、调用

library(ggplot2) 
library(ggExtra)             
# 注释：package使用之前需要调用
# 注释：ggExtra包直接用install.packages("ggExtra")安装就可以了

Step4. 绘图

p <- ggplot(data) + 
     geom_point(aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, color = Species)) +  
     theme_bw() + theme(legend.position =  "bottom") +   
     scale_color_manual(values = c("#FEB048", "#E083A1", "#9570D3"))
p

p1 <- ggMarginal(p, type = "density")
p1

p1 <- ggMarginal(p, type = "density", groupColour = TRUE, groupFill = TRUE)
p1

p2 <- ggMarginal(p, type = "histogram")
p2

p2 <- ggMarginal(p, type = "histogram", groupColour = TRUE, groupFill = TRUE)
p2

(公众号: 生信了）