R语言作图——Radar chart（雷达图）

原创：黄小仙

2021.08.12 更新
对于导出带有透明度的高清图，小仙又发现了更懒的办法，特来更新

再Rstudio里调整好透明度之后，直接导出pdf，然后用Adobe illustrator打开pdf文件，直接导出png或jpeg就可以啦

———————————— 以下是原文 ———————————

今天小仙同学给大家分享下Radar chart的作图方法，其实雷达图我们在生活中能经常可以见到，比如大家很喜欢玩的王者荣耀里就有。通过简单的图形对比，人物特点一目了然。

也经常用来评估学生的成绩和产品的性能。

在生信领域，我们也可以用来比较评估样品的基因表达情况啦。

作图数据如下：

画出来的效果图如下：

作图方法：
Step1. 绘图数据的准备
首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式excel中保存成csv格式。数据的格式就在上面啦。

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)

Step3.绘图所需package的安装、调用

install.packages("fmsb")
library(fmsb)

Step4.绘图数据格式调整
radarfig<-rbind(rep(15,10),rep(0,10),data)
#在原有的数据上增加了两行，
#第一、二行分别是每个纵轴的最大值、最小值，也可手动添加

Step5.绘图

radarchart(radarfig, axistype=1,
            pcol=rgb(69/255,137/255,137/255) , pfcol=rgb(69/255,137/255,137/255,0.6),    
            plwd=4 ,seg=5,
            cglcol="grey", cglty=1, cglwd=2，axislabcol="black" ,caxislabels=seq(0,15,3),
            vlcex=0.7,calcex=0.7）

如果从RStudio直接导出png或者jpeg格式的图片，还是会有之前小仙同学提过的**“锯齿状”线条**。之前的解决方案是导出eps格式，在Adobe Illustrator里打开再导出成需要的格式。但本小仙发现一个“巨坑”，就是RStudio导出的eps图形没有透明度，需要在AI里手动调整透明图。
（其实R代码的这一部分本小仙很快就写好了 ，调整填充透明度费了老大劲，实名diss此bug）

填充透明度调整方法如下：
1.取消编组

2.选中线条，对象—实时上色—建立

3.选中线条，对象—拓展

4.更改填充颜色，输入相应颜色RGB数值

5.删掉图形白色背景

6.外观—填色—不透明度—调整数值

(⊙o⊙)，小仙同学也觉得这种方法有点麻烦，不过目前没有找到更好的方法啦
（据说excel也可以画雷达图，嫌麻烦的同学可以移步excel啦，能又快又好画出图就是好方法）
今天的分享就到这里啦。

（公众号：生信了）