这篇文章的关键是如何计算两个 mutation sites 的 mutation order 的后验概率。
主要是利用贝叶斯公式。
然后再据此构建一个有权重的有向图。利用最小支持树算法找到这个有向图的最小支撑树。
这篇文章有两个地方不大清楚。
1: 两个 mutation sites
x
x
x 和
y
y
y 的关系是
x
−
>
y
x->y
x−>y 或者
y
−
>
x
y->x
y−>x 或者
x
n
o
t
<
−
>
y
x not <-> y
xnot<−>y, 除此之外还有无别的可能。
2: 在第11面这个地方,在计算 error rates FD 和 AD 的时候,应该是一个 typo.
读文章 using single cell sequencing data to model the evolutionary history of a tumor
最新推荐文章于 2024-09-18 20:33:32 发布