读文章 using single cell sequencing data to model the evolutionary history of a tumor

最新推荐文章于 2024-05-04 22:59:00 发布

bsn2020

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文章标签：算法

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这篇文章的关键是如何计算两个 mutation sites 的 mutation order 的后验概率。
主要是利用贝叶斯公式。
然后再据此构建一个有权重的有向图。利用最小支持树算法找到这个有向图的最小支撑树。
这篇文章有两个地方不大清楚。
1: 两个 mutation sites $x$ 和 $y$ 的关系是 $x - > y$ 或者 $y - > x$ 或者 $x n o t < - > y$ , 除此之外还有无别的可能。
2: 在第11面这个地方，在计算 error rates FD 和 AD 的时候，应该是一个 typo.

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读文章 using single cell sequencing data to model the evolutionary history of a tumor

这篇文章的关键是如何计算两个 mutation sites 的 mutation order 的后验概率。主要是利用贝叶斯公式。然后再据此构建一个有权重的有向图。利用最小支持树算法找到这个有向图的最小支撑树。这篇文章有两个地方不大清楚。1: 两个 mutation sites xxx 和 yyy 的关系是 x−>yx->yx−>y 或者 y−>xy->xy−>x 或者 xnot<−>yx not <-> yxnot<−>y, 除
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