医学图像处理包-AMICO（给NODDI加速）

如果用 NODDI MATLAB toolbox 跑一个多壳数据需要大量的时间，但用了AMICO则只需要几分钟

安装AMICO

下载安装包（GitHub - daducci/AMICO: Accelerated Microstructure Imaging via Convex Optimization (AMICO) from diffusion MRI data），解压后安装

cd AMICO的路径

python3 setup.py install 

 但是在这里遇到了问题

 报错是  Building wheel for python-spams (setup.py) ... error

所以要先安装 spams （python版）的包，地址如下：https://gforge.inria.fr/frs/?group_id=3975&release_id=10839#spams-python-v2.6.2-title-content

下载完成后，解压打开

cd spams的路径

sudo apt-get install libatlas-base-dev

python3 setup.py install

 

 安装完成后，再重新安装AMICO